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Title of test: Biologia molecolare completa Description: benedetto sia questo paniere Author: Gioctg01 Other tests from this author Creation Date: 09/09/2024 Category: Science Number of questions: 123

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Un tipo di legame debole che avviene fra 2 molecole che hanno cariche elettriche parziali di opposta polarità formano un'attrazione intermolecolare. legame idrofobico legame idrogeno legame covalente forze di van der Waals. Quale delle seguenti reazioni è poco probabile che avvenga spontaneamente? A + B--> C if ?G° for the reaction equals -2.5 kcal/mol A + B --> C if Keq for the reaction equals 0.5. A + B --> C if ?G° for the reaction equals -12.5 kcal/mol A + B --> C if ?G° for the reaction equals +1 kcal/mol . che cosa ha osservato Chargaff? in tutte le specie A+T=G+C il DNA estratto da tessuti diversi di organismi della stessa specie ha la stessa composizione in basi. la composizione in basi non varia da una specie all'altra in tutte le specie il n delle guanine è uguale a quello delle adenine. anche se c'è una rotazione libera intorno al legame glisodico delle basi azotate, l'ingombro sterico fa adottare alle pirimidine solo la configurazione anti le purine possono adottare solo la configurazione anti fa adottare alle pirimidine solo la configurazione sin permette alle purine solo la configurazione syn e molte possibilità alle pirimidine. La struttura a doppia elica assorbe la luce UV meno della struttura a singola elica perché le basi all'interno della doppia elica sono inaccessibili agli UV a causa dell'effetto ipocromico che si ha in quanto il legame H e l'impilamento delle basi limita la risonanza negli anelli aromatici delle basi non è vero la singola elica assorbe più luce UV l'impilamento delle basi aumento l'assorbimento della luce bianca a discapito dell'assorbimentodella luce UV. Quale delle seguenti proprietà chimiche dell'interazione tra purine e pirimidine non influenza struttura e funzione degli acidi nucleici? l'impilamento idrofobico l'assorbanza agli UV il tautomerismo delle basi la planarità delle basi. Certe sequenze nucleotidiche si ripiegano nell'elica Z più facilmente di altre. Quale delle seguenti è una caratteristica tipica dell'elica Z? le eliche Z sono solitamente destorse le eliche Z tendono a formarsi quando si alternano residui di A e G le eliche Z tendono a formarsi quando si alternano residui di 5 metilcitosine e G nelle eliche Z tutte le basi hanno conformazioni anti. Quale superstruttura può essere assunta da un tratto di DNA a doppia elica che contiene una sequenza ripetuta e invertita? Struttura circolare Struttura superavvolta Struttura Z Struttura cruciforme. La particolare instabilità dell'RNA (rispetto alle molecole di DNA) è dovuta alla presenza di un gruppo ..... sulla posizione 2' del ribosio ossidrilico fosforico metilico amminico. Quali interazioni molecolari sono implicate nella stabilizzazione della doppia elica del DNA? (2 risposte corrette) Legami fosfodiesterici Interazioni idrofobiche (impilamento delle basi). Interazioni di Van der Waals Legami covalenti. Quali dei componenti chimici di una catena polinucleotidica presentano cariche negative? Nessuno. I gruppi fosfato Le basi puriniche I residui di zucchero (desossiribosio o ribosio). Quali delle seguenti modificazioni sono utilizzate nei nucleotidi? Modificazioni degli acidi grassi Fosforilazione Metilazione Glicosilazione. Quale dei seguenti componenti NON appartiene al ribonucleotide Ribosio Gruppo fosfato Uracile Timina. Scegli il corretto ordine per il flusso di informazione del dogma centrale. DNA, traduzione, RNA, replicazione, proteine RNA, traduzione, DNA, trascrizione, proteine DNA, trascrizione, RNA, replicazione, proteine DNA, trascrizione, RNA, traduzione, proteine. Quale dei risultati sperimentali di Avery dimostrò che il DNA è necessario e sufficiente alla trasformazione dei batteri? Le proteine da sole permettono la trasformazione L'aggiunta di DNA da solo permette la trasformazione. Rimuovendo il DNA dagli estratti cellulari ottenuti dal ceppo S la trasformazione non avveniva Rimuovendo l'RNA dagli estratti cellulari ottenuti dal ceppo S la trasformazione non avveniva. Come è stato determinato per la prima volta che la tripletta UUU codifica per la fenilalanina? Determinazione della struttura tridimensionale a doppia elica del DNA Sintesi proteica in vitro programmata da un polinucleotide sintetico (poliU) che funge da mRNA artificiale in un estratto di cellule di E.coli. Determinazione chimica della composizione in basi del DNA e della composizione in amminoacidi delle proteine Sequenzamento diretto del DNA e del prodotto proteico. L'RNA può avere attività enzimatica? sì , i ribozimi sono RNA che hanno un sito di legame per il substrato ed una per i cofattori Si, le snRPN sono enzimi conivolti nello splicing no, la solo funzioni di regolazione e trascrizione no, può interagire con enzimi e mediarne l'attività ma non funzionare come un'enzima. quali funzioni dell'RNA sono dipendenti dalla sua struttura terziaria? trasportatore transiente di informazione genetica trasportatore di aminoacidi al sito di di sintesi proteica ruolo catalico splicing e trascrizione tutte. Gli appaiamenti di Hoogsteen risulta in un tetraplex da uno strecht di residui di G risulta in un triplex in cui tutti e tre i filimenti sono composti solo da purine possono risultare nella formazione di una tripla elica all'interno di lunghe sequenze che contengono solo purine e pirimidine in un filamento può creare interazioni addizionali AT . Quali delle seguenti affermazioni sui superavvolgimenti solenoide e plectonemico è vero? i superavvolgimenti plectonemici sono sempre sinistorsi, mentre quelli solenoidi sono destorsi solo i superavvolgimenti plectonemici sono stabilizzati dalla presenza di proteine la formazione di superavvolgimenti solenoidi è sequenza specifico nel DNA rilassato i superavvolgimenti plectonemici sono tutti destorsi e i superavvolgimenti sinistorsi sono solenoidi. Le Topoisomerasi di tipo II tagliano un solo filamento e sono dei monomeri entrambi i filamenti e sono in genere dimeri o multimeri un solo filamento e sono dimeri o multimeri entrambi i filamenti e sono in genere monomeri. Quali sono i parametri della struttura Z del DNA? Elica sinistrorsa | Diametro dell'elica: 20 Å Passo dell'elica: F34 Å Elica destrorsa | Diametro dell'elica 18 Å Passo dell'elica 46 Å Elica destrorsa | Diametro dell'elica 25 Å | Passo dell'elica 23 Å Elica sinistrorsa | Diametro dell'elica 18 Å Passo dell'elica 46 Å. Le Topoisomerasi di tipo I tagliano entrambi i filamenti e sono in genere monomeri un solo filamento e sono dimeri o multimeri un solo filamento e sono dei monomeri entrambi i filamenti e sono in genere dimeri o multimeri. i centromeri sono sono sequenze sul cromosoma eucariote che funzionano durante la divisione cellularecome punto d'attacco per le proteine che associano il cromosoma al fuso mitotico sono le sequenze in cui si forma il cinetocore nei cromosomi dei procarioti sono sequenze alle estremità dei cromosomi che aumentano la stabilità dei cromosomi lineari sono i siti a cui inizia la replicazione nei procarioti . Le sequenze dei telomeri contengono strutture secondarie tipo struttura cruciforme struttura a zig-zag Struttura a solenoide G quartet . Quali sono le caratteristiche della eterocromatina facoltativa? E' trascritta in alcuni casi ma non in altri. Non contiene geni. E' sempre compattata E' sempre trascrizionalmente inattiva. Quale struttura assume una doppia elica ibrida costituita da un filamento di DNA ed uno di RNA? Struttura A Struttura mista Struttura B Struttura Z . Un mRNA sintetico con sequenza ripetitiva 5'-CACACACACACACACACACACACA...-3' viene introdotto come stampo in un estratto cellulare usato come sistema di sintesi proteica in vitro. Assumendo che questa sintesi proteica inizi dal primo nucleotide della sequenza, senza bisogno di un codone di inizio, quale prodotto (o quali prodotti) ti aspetti di trovare dopo la sintesi? Una proteina con sequenza alternata di tre differenti amminoacidi Una proteina contenente un solo tipo di amminoacido Una proteina con sequenza alternata di due differenti amminoacidi. Due proteine con sequenza alternata di tre differenti amminoacidi . Considerando una molecola di DNA duplex circolare superavvolta, qual'è la relazione che esiste tra le grandezze: "twist" (Tw), "writhe" (Wr) e "linking number" (Lk)? A. Lk = Tw + Wr B. Lk = Tw - Wr C. Lk = Tw · Wr D. Tw = Lk + Wr . l'istone H1 linker appartiene ad una struttura di supporto detta scaffold Piccola proteina globulare con una coda N-ter di 20-35aa, 80 residui nel dominio centrale globulare e e regione Cter di 100 residui promuovono la condensazione del DNA, necessarie alla segregazione dei cromosomi durante la mitosi, implicate nei meccanismi di riparazione. si assembla in un tetramero con H3-H4 . L'acetilazione degli istoni gioca un ruolo biologico fondamentale nella maggior parte dei processi coinvolti nella regolazione della trascrizione. I principali enzimi coinvolti Le acetiltransferasi, che si dividono in 4 diversi gruppi acetiltransferasi (HAT), e le istondeacetilasi, che si dividono in gruppo A e B. Le istondeacetilasi (HDAC) catalizzano il trasferimento di un gruppo acetile all'amino gruppo in posizione ? delle catene laterali di lisina ed utilizzano come cofattore il Coenzima A. Ciò neutralizza la carica positiva dell'arginina e indebolisce l'interazione fra gli istoni ed il DNA. Le due principali classi A e B si distinguono perché la classe A acetila gli istoni sulla cromatina e la classe B gli istoni liberi nel citoplasma. Le acetiltransferasi svolgono la funzione opposta di ristabilire la carica positiva sulla lisina. Ci sono 4 classi di enzimi, di cui solo la classe III richiede uno specifico cofattore NAD+ Le acetiltransferasi, che si dividono in 2 diversi gruppi acetiltransferasi (HAT) A e B, e le istondeacetilasi. Le acetiltransferasi catalizzano il trasferimento di un gruppo acetile all'amino gruppo in posizione ? delle catene laterali di un'arginina ed utilizzano come cofattore NAD+. Ciò neutralizza la carica positiva della lisina e indebolisce l'interazione fra gli istoni ed il DNA. Le due principali classi A e B si distinguono perché la classe A acetila gli istoni sulla cromatina e la classe B gli istoni liberi nel citoplasma. Le istondeacetilasi (HDAC) svolgono la funzione opposta di ristabilire la carica positiva sulla lisina. Ci sono 4 classi di enzimi, di cui solo la classe III richiede uno specifico cofattore Coenzima A Le istondeacetilasi (HDAC) che si dividono in 2 diversi gruppi A e B, e le acetiltransferasi. Le istondeacetilasi catalizzano il trasferimento di un gruppo acetile all'amino gruppo in posizione ? delle catene laterali di lisina ed utilizzano come cofattore il Coenzima A. Ciò neutralizza la carica positiva della lisina e indebolisce l'interazione fra gli istoni ed il DNA. Le due principali classi A e B si distinguono perché la classe A acetila gli istoni sulla cromatina e la classe B gli istoni liberi nel citoplasma. Le acetiltransferasi, svolgono la funzione opposta di ristabilire la carica positiva sulla lisina. Ci sono 4 classi di enzimi, di cui solo la classe III richiede uno specifico cofattore NAD+ Le acetiltransferasi, che si dividono in 2 diversi gruppi acetiltransferasi (HAT) A e B, e le istondeacetilasi. Le acetiltransferasi catalizzano il trasferimento di un gruppo acetile all'amino gruppo in posizione ? delle catene laterali di lisina ed utilizzano come cofattore il Coenzima A. Ciò neutralizza la carica positiva della lisina e indebolisce l'interazione fra gli istoni ed il DNA. Le due principali classi A e B si distinguono perché la classe A acetila gli istoni sulla cromatina e la classe B gli istoni liberi nel citoplasma. Le istondeacetilasi (HDAC) svolgono la funzione opposta di ristabilire la carica positiva sulla lisina. Ci sono 4 classi di enzimi, di cui solo la classe III richiede uno specifico cofattore NAD+. la fosforilazione degli istoni è altamente dinamica, si distinguono chinasi e fosfatasi le chinasi fosforilano serine, treonine e tirosine prevalentemente nella porzione C terminale delle code istoniche. Trasferiscono un gruppo fosfato da una molecola di ATP ad un gruppo OH della catena laterale dell'aminoacido target, conferendo una carica negativa agli istoni e cambiando la conformazione della cromatina le chinasi fosforilano arginine, treonine e tirosine prevalentemente nella porzione N terminale delle code istoniche. Trasferiscono un gruppo fosfato da una molecola di ATP ad un gruppo OH della catena laterale dell'aminoacido target, conferendo una carica negativa agli istoni e cambiando la conformazione della cromatina. le chinasi fosforilano serine, treonine e tirosine prevalentemente nella porzione N terminale delle code istoniche. Trasferiscono un gruppo fosfato da una molecola di ATP ad un gruppo OH della catena laterale dell'aminoacido target, conferendo una carica negativa agli istoni e cambiando la conformazione della cromatina le chinasi fosforilano serine, treonine e tirosine prevalentemente nella porzione N terminale delle code istoniche. Trasferiscono un gruppo fosfato da una molecola di ATP ad un gruppo SH della catena laterale dell'aminoacido target, conferendo una carica negativa agli istoni e cambiando la conformazione della cromatina. Nel confronto tra i genomi di diversi mammiferi, quale dei seguenti parametri è meno conservata Posizionamento degli introni rispetto alla sequenza codificante Lunghezza e sequenza degli introni. Numero di introni e esoni Lunghezza e sequenza degli esoni . Da quali complessi è formato l'ottamero di istoni del nucleosoma? Due dimeri H3·H4, un dimero H2A2 e un dimero H2B2. Due dimeri H3·H4, un dimero H2A2 e un dimero H2B2. Un tetramero (H2A2·H2B2) e due dimeri H3·H4. Due dimeri H3·H4 e due dimeri H2A·H2B . Il contenuto in DNA genomico delle cellule degli eucarioti superiori corrrela con il numero di cromosomi della specie è proporzionato al numero di proteine codificate ed è proporzionale alla complessità della specie è strettamente correlato alla complessità morfologica, mentre varia ampiamente negli organismi inferiori. non è proporzionato al numero di proteine codificate, ma è in eccesso rispetto alla quantità che ci si potrebbe aspettare. Tra certe specie esiste una grande differenza del contenuto di DNA, a fronte di una complessità apparente non troppo diversa. Che cosa è il quoziente di impacchettamento o (compattamento) del DNA in vivo? Rapporto tra lunghezza del DNA e e le dimensioni della struttura o compartimento che lo contiene RRapporto tra lunghezza del DNA e numero di giri di superavvolgimento. Rapporto tra quantità di DNA e numero di cromosomi di una specie. Rapporto tra numero di cromosomi e dimensioni del compartimento che li contiene. . Caratteristiche della eterocromatina costitutiva E'quasi sempre compattata, trascrizionalmente inattiva e con pochii geni e' quasi sempre compattata, contiene pochi geni trascritti in alcuni casi ma non in altri,contiene geni E' sempre compattata, trascrizionalmente inattiva e priva di geni è poco compattata, sempre trascritta . Negli eucarioti, le famiglie geniche sono gruppi di 100-500 geni, spesso collocati adiacenti l'uno all'altro nel genoma, che si sono formati per duplicazione di un singolo gene ancestrale, seguita da fenomeni di convergenza . I geni membri di una famiglia hanno sequenze codificanti, e quindi anche funzioni biochimiche simili . 10-100 geni, spesso collocati in regioni anche distanti nel genoma, che si sono formati per duplicazione di un singolo gene ancestrale, seguita da fenomeni di divergenza . I geni membri di una famiglia hanno sequenze codificanti, e quindi anche funzioni biochimiche simili due o più geni, spesso collocati adiacenti l'uno all'altro nel genoma, che si sono formati per duplicazione di un singolo gene ancestrale, seguita da fenomeni di divergenza . I geni membri di una famiglia hanno sequenze codificanti, e quindi anche funzioni biochimiche simili . due o più geni, spesso collocati adiacenti l'uno all'altro nel genoma, che si sono formati per duplicazione di un singolo gene ancestrale, seguita da fenomeni di divergenza . I geni membri di una famiglia hanno sequenze codificanti, e quindi anche funzioni biochimiche diversei. Quale(i) enzima(i) viene (vengono) usato(i) per digerire la cromatina, e taglia(no) il DNA in multipli interi di 200 bp, permettendo di studiare l'organizzazione del DNA in nucleosomi? DNAasiI Nucleasi micrococcica Esonucleasi DNA asiI e DNAasi II. La fibra cromatinica da 30 nm (solenoide) è ulteriormente impacchettata a formare le anse cromosomiche che hanno un diametro di circa ... 100-400 nm 10-20 um 1000-2000 nm 100-400 A. Che cosa sono gli pseudogeni ? Geni inattivi non funzionali, riconosciuti per la presenza di un stop prematuro, mancanza di un promotore funzionale, spesso mancano introni. Si possono originare per duplicazione seguita da mutazioni, o per trascrizione inversa ed inserzione nel genoma seguita da mutazioni Geni non funzionali, riconosciuti per l'assenza di introni, hanno un promotore funzionale. Si possono originare per duplicazione seguita da mutazioni, o per trascrizione inversa ed inserzione nel genoma seguita da mutazioni Geni inattivi non funzionali, riconosciuti per la presenza di un stop prematuro, mancanza di un promotore funzionale, la cui modalità di origine non è nota Geni inattivi non funzionali, riconosciuti per la presenza di un stop prematuro, mancanza di un promotore funzionale, spesso mancano introni. Si possono originare per conversione genica. Le modificazioni covalenti delle proteine istoniche Cambiamenti post-traduzionali, interessano principalmente i residui accessibili del dominio globulare dell'istone. Cambiamenti post-traduzionali, interessano principalmente le code ed alcuni residui accessibili del dominio globulare dell'istone liker Cambiamenti post-trascrizionali, interessano principalmente le code ed alcuni residui accessibili del dominio globulare dell'istone. Cambiamenti post-traduzionali, interessano principalmente le code ed alcuni residui accessibili del dominio globulare dell'istone. Qual è la principale ragione per cui il genoma dei batteri non è organizzato in nucleosomi? le divisioni cellulari dei batteri avvengono in meno di 15 minuti i batteri rispondono velocemente alle condizioni ambientali tutte e 4 le rispote sono corrette una percentuale molto più grande del cromosoma batterico codifica per le proteine. Qual'è il meccanismo di replicazione del DNA dei cromosomi eucariotici? Origini multiple bidirerzionali su molecole di DNA lineare Una origine bidirezionale su una molecola di DNA linere Origini multiple unidirezionali su molecole di DNA lineare. Inizio dalle estremità di molecole di DNA lineari. . La telomerasi è una grande ribonucleoproteina che consiste di un RNA (TERC) che serve da stampo e di una proteina (TERT) con attività catalitica, che funziona come una trascrittasi inversa è una sequenza di DNA ripetitivo che si trova alle estremità dei cromosomi. una grande ribonucleoproteina che consiste di un RNA (TERC), che può essere considerata un tipo specializzato di RNA polimerasi. non estende l'estremità 3' più corta ma, al contrario, allunga ulteriormente l'estremità 5' che protrude. . Da quale attività enzimatica dipende il processo di correzione di bozze che caratterizza le DNA polimerasi replicative? Esonucleasica 5'-3' Polimerasica 3'-5' Esonucleasica 3'-5' RNasica . Chi rimuove gli inneschi di RNA che si vengono a trovare al 5' dei frammenti di Okazaki? la DNA polimerasi III una primasi la DNA polimerasi I RNAasi H . Nell' approccio sperimentale di Meselson e Stahl che portò le prove dell'ipotesi semiconservativa come il modello più probabile per la replicazione del DNA, quali radioisotopi e metodi di separazione sono stati usati? Cellule infettate con il batteriofago T4 coltivate in presenza di radionuclidi, DNA analizzato con il gradiente CsCl gradiente, Batteri cresciuti in N14H4 e in N15 H4, separati conun'ultracentrifuga in un gradiente di densità di CsCl Cellule radiomarcate con timidina [3H] Battercresciuti in un mezzo contenentetimidina [3H] fino a che l'intero DNA contenesse catene pesanti e quindi trasferite in un mezzo di coltura leggero e pesante per un ciclo di replicazione.Separazione su gradiente di densità. Una modalità NON utilizzata dai sistemi di riodellamento della cromatina possono modificare l'estremità Nterminale delle code istoniche sostituire un nucleosoma con un altro che contenga una variante istonica espellere un nucleosoma dal DNA possono far slittare un nucleosoma in una diversa posizione. La struttura di ordine superiore della cromatina sono controllate dalle topoisomerasi di tipo I e di tipo II dalla presenza dell'istone H1 che permette la formazione del nucleoide da proteine scaffold, di cui le proteine SMC sono iil maggior componente dalla formazione di tetranucleosomi . Che differenza c'è tra un cromatosoma ed un nucleosoma? Nel cromatosoma il DNA associato al nucleosoma ha un frammento di DNA più lungo Il cromatosoma non contiene istoni linker Il cromatosoma contiene una sola copia degli istoni del core Il cromatosoma contiene un istone H1 oltre al core istonico . In che modo il legame dell'istone linker H1 differisce da quello degli altri 4 istoni? Si lega solo al solco maggiore del DNA Si lega al DNA che fuori da entrambi i lati del nucleosoma si lega ad un filamento del DNA linker, che esce dal nucleosoma e lega un secondo sito nel DNA avvolto nel core si lega al DNA come parte dell'ottamero, ma non ha la coda istonica . I contatti tra il DNA e gli istoni del nucleosoma sono Tra le catene laterali degli aminoacidi e lo scheletro fosfosiesterico del DNA Circa la metà dei legami avviene tra lo scheletro fosfodiesterico e solco minore e lo scheletro peptidico degli istoni principalmente tra i motivi conservati degli istoni e le basi esposte verso la tasca maggiore del DNA Prevalentemente nelle regioni di DNA ricche di GC dove il DNA tende a piegarsi spontaneamente . Quale delle seguente frasi corrisponde alla struttura del nucleosoma? il DNA si avvolge x 3 volte attorno al core formando un superavvogimento sinstorso solenoidale il DNA si avvolge x 2 volte attorno al core formando un superavvogimento destorso solenoidale i nucleosomi sono composti da circa 1000bp avvolte intorno all'istone core i nucleosomi sono composti da circa 200bp avvolte intorno all'istone coreOSTA 2 . Nei Batteri lo scambio di materiale genetico può avvenire coniugazione, trasformazione, conversione trasformazione, coniugazione e trasduzione ricombinazione, trasformazione e coniugazione trasduzione, coniugazione e ricombinazione. quale meccanismo è rappresentato in questa immagine? 6.8 Nucleotide Excision Repair, sottopathway Global Genome NER, è presente solo nei mammiferi fotoliasi Nucleotide Excision Repair, sottopathway Transcrption Coupled -NER, è presente solo nei mammiferi MMR, Mismatch Repair presente in tutti gli organismi . L'immagine rappresenta la perdita di una purina che figura 7.1 corrisponde ad un processo di deaminazione. La deamnazione della citosina è alle base delle mutazioni di circa un 1/3 delle malattie genetiche umane determina la formazione di un sito abasico (AP). I siti AP sono mutagenici, perché possono introdurre mutazioni, bloccano le DNA polimerasi e per questo sono potenzialmente citotossici. non comporta alcun danno per la sequenza del DNA e deriva dall'alchilazione l'aggiunta di un gruppo alchile (metilico, etilico) agli atomi delle basi nucleotidiche o allo scheletro fosfodiesterico . Nell'immagine è visualizzato un meccanismo di riparazione. Quale? perchè si dice che il meccanismo è diretto?figura 7.2 E' riparata la formazione dei dimeri che si formano tra due pirimidine dopo esposizione agli UV E' un esempio di riparazione per escissione dei nucleotidi e non è una riparazione diretta E'un esempio di mismatch repair, non è una riparazione diretta E' una riparazione della transmetilazione da parte di una achilmetiltransferasi ed è una riparazione diretta . Secondo il modello di ricombinazione omologa più accreditato la maggior parte degli eventi di ricombinazione avviene come conseguenza figura 7.3 di una rottura su uno o entrambi i filamenti che si corregge tagliando e ricucendo i filamenti tagliati con gli enzimi resolvasi, di una rottura su entrambi i filamenti:1 la giunzione di Holliday può scorrere e mette a confronto sequenze non identiche, heteroduplex, attraverso un processo detto migrazione della giunzione di una rotture su singolo filamento ma non da tagli a doppio filamento. di una rotture su singolo filamento genera solo prodotti non crossing over e tutta la neosintesi del DNA avviene sullo stesso omologo . Come funziona la nick translation? la DNA polimerasi I polimerizza in direzione 5'-3 un frammento precedentemente degradato la DNA polimerasi I si lega ad un'estremità 5'OH libera in seguito ad un'interruzione del DNA, e digerisce nucleotidi nella direzione 5'-3' la DNA polimerasi I si lega ad un'estremità 3'OH libera in seguito ad un'interruzione del DNA, e digerisce nucleotidi nella direzione 5'-3' il dominio con un'attività polimerasica sintetizza un nuovo filamento e man mano sposta e idrolizza il filamento DNA pre-esistente con l'attività 3'-5' esonucleasica . Il test di Ames è utilizzato per stabilire l'eventuale effetto mutageno di una sostanza chimica.L'effetto mutageno è potenzialmente cancerogeno nell'uomo. Il test utilizza un ceppo di S. typhimurium mutato negli enzimi della sintesi dell'istidina. Se l'aggiunta della sostanza mutagene provoca mutazioni proprio sugli enzimi della sintesi dell'istidina del ceppo di S. typhimurium utilizzato, si potrà avere una reversione del danno con conseguente crescita di colonie batteriche sul terreno selettivo. Il test è altamente specifico cancerogeno nell'uomo. Il test utilizza un ceppo di S. typhimurium mutato negli enzimi della sintesi dell'istidina. Queste cellule pertanto non crescono su terreno privo di istidina. Se l'aggiunta della sostanza mutagene provoca mutazioni proprio sugli enzimi della sintesi dell'istidina del ceppo di S. typhimurium utilizzato, si potrà avere una reversione del danno con conseguente crescita di colonie batteriche sul terreno selettivo cancerogeno nell'uomo.E' un test in vitro in cui in linfociti di topo si registrano modificazioni sui geni relativi alla timidina-chinasi. Se le cellule sono "sane" assorbono la trifluorotimidina (TFT), un analogo tossico della timidina, muoiono. In caso di mutazioni però sono in grado di sopravvire perché il TFT non penetra all'interno della cellula; dunque il test è positivo se le cellule sopravvivono e proliferano. infettivo nell'uomo.Il test utilizza un ceppo di S. typhimurium mutato negli enzimi della sintesi dell'istidina.Le cellule crescono solo in assenza di istidina.si potrà avere una reversione del danno con conseguente crescita di colonie batteriche sul terreno selettivo. Qual è il danno più comune dell'idrolisi sul DNA? rottura del legame glisodico tra le pirimidine ed il DNA deaminazione della timina rimozione di una citosina e formazione di un sito abasico deaminazione della citosina ad uracile . se la lesione del DNA lascia un gap su un filamento e viene a mancare lo stampo le prime due risposte sono corrette non si possono riparare si verifica un'invasione da parte del filamento danneggiato, si genera una migrazione delle due giunzioni di Holliday, rotte da una resolvasi . Si utilizza il filamento inatto come stampo il filamento 3' a singola elica invade la porzione intatta del cromosoma,si appaia con il fiamento complementare e spiazza l'altra. . Una mutazione nel gene RuvB potrebbe aumentare il legame di RuvA al DNA aumentare gli eventi di ricombinazione del DNA aumentare il legame di RuvB al DNA ridurre la resistenza agli UV . Il complesso proteico detto caricatore della sliding clamp catalizza l'apertura ed il posizionamento della proteina sul DNA, allo stesso modo il caricatore rimuove la sliding clamp quando la sintesi del DNA è finita. Il caricatore è ATP dipendente, quando il caricatore si lega, le subunità ? e ? cambiano conformazione e possono in questo interagire con la pinza e determinarne l'apertura. Ha sei ripiegamenti simmetrici ed formata da un dominio ripetuto tre volte in ogni monomero. Il caricatore è ATP indipendente, quando il caricatore si lega, le subunità ? e ? cambiano conformazione e possono in questo interagire con la pinza e determinarne l'apertura. il caricatore si comporta come una topoisomerasi. cos'è la nick translation? è una tecnica molto utilizzata in biologia molecolare, che si avvale della proprietà dell'enzima klenow di spostare il taglio, generato dalla sua proprietà esonucleasica 3'-5' è una tecnica molto utilizzata in biologia molecolare, che si avvale della proprietà dell'enzima klenow di spostare il taglio, generato dalla sua proprietà endonucleasica 3'-5' e 5'-3' polimerasica è una tecnica molto utilizzata in biologia molecolare, che si avvale della proprietà dell'enzima klenow di spostare il taglio, generato dalla sua proprietà esonucleasica 5'-3' e5'-3' polimerasica è una tecnica molto utilizzata in biologia molecolare, che si avvale della proprietà dell'enzima klenow di spostare il taglio, generato dalla sua proprietà endonucleasica 5'-3' ' polimerasica. Ognuno dei subcomplessi catalitici della DNA polimerasi III si assembla sul DNA grazie ad un altro subcomplesso, subunità ? CHE hanno il ruolo di coordinare lo spostamento dell'oloenzima in modo che il filamento continuo e quello ritardato vengano sintetizzati insieme subunità chiamate ?, con attività polimerizzante, ? con attività esonucleolitica, correttore di bozze 3'-5', subunità ?, che formano un omodimero con struttura a ciambella, circonda la molecola di DNA che entra nel foro formato dalla ciambella. ?, principale organizzatore dell'oloenzima, complesso ? appartiene alla famiglia delle proteine AAA+ (ATPasi Associate a varie Attività) che utilizzano l'energia dell'idrolisi dell'ATP. Si possono classificare come ATPasi DNA dipendenti . Perchè ciascuna forca replicativa richiede un filamento guida ed un filamento ritardato? perchè la DNA polimerasi deve sintetizzare DNA dal 3' al 5' perchè l'elicasi svolgono un'elica più velocemente di un'altra perchè i filamenti del DNA sono antiparalleli e la polimerasi può lavorare solo in una direzione perchè la sintesi deve essere complementare . In E.coli, la riparazione di un DSB (rottura a doppio filamento) mediante HR (ricombinazione omologa) dipende dalle attività elicasica e polimerasica del complesso MutSMutL. Questo degrada un filamento del DNA dalla sua estremità 3' fino a che incontra una particolare sequenza chiamata ? , dopodichè degrada l'altro filamento generando alla fine un tratto di DNA sporgente in 3' a cui si lega la proteina RecA . Questa innesca i successivi passaggi ricombinativi. attività elicasica e nucleasica del complesso RecBCD. Questo degrada un filamento del DNA dalla sua estremità 3' fino a che incontra una particolare sequenza chiamata ? , dopodichè degrada l'altro filamento generando alla fine un tratto di DNA sporgente in 3' a cui si lega la proteina XRCC1 . Questa innesca i successivi passaggi ricombinativi. attività elicasica e nucleasica del complesso RecBCD . Questo degrada un filamento del DNA dalla sua estremità 3' fino a che incontra una particolare sequenza chiamata SOSbox , dopodichè degrada l'altro filamento generando alla fine un tratto di DNA sporgente in 3' a cui si lega la proteina RecA . Questa innesca i successivi passaggi ricombinativi. attività elicasica e nucleasica del complesso RecBCD . Questo degrada un filamento del DNA dalla sua estremità 3' fino a che incontra una particolare sequenza chiamata ? , dopodichè degrada l'altro filamento generando alla fine un tratto di DNA sporgente in 3' a cui si lega la proteina RecA . Questa innesca i successivi passaggi ricombinativi. Le cause endogene del danno al DNA Sono piuttossto rari. Consistono principalmente in , alchilazione e rotture a doppia elica Sono meno frequenti delle cause esogene. Consistono principalmente in depurinazione , deaminazione , ossidazione Sono meno frequenti delle cause esogene. Si dividono in errori delle replicazione, della ricombinazione, instabilità chimica del DNA, prodotti del metabolismo cellulare Sono più frequenti delle cause esogene. Si dividono in errori delle replicazione, della ricombinazione, instabilità chimica del DNA, prodotti del metabolismo cellulare . in E. coli la DNA polimerasi I è un complesso multipeptidico con 10 diversi polipeptidi Rha 4 domini funzionali ed 3 subunità ha un'alta processività, fedeltà un'attività esonucleasica 3'-5' (proof reading) Riempire le brevi sequenze di DNA a singola elica che derivano dalla replicazione del DNA (lagging strand) e dalla riparazione, quando i nucleotidi danneggiati devono essere rimossi . Le principali differenze nei processi di replicazione e trascrizione sono la trascrizione avviene nel citoplasma e la replicazione nel nucleo solo nella trascrizione occorre un templato la trascrizione ha come prodotto molte copie di RNA, la duplicazione ha come prodotto una copia del genoma che consiste in una molecola di DNA. la trascrizione può iniziare in qualunque punto, mentre la duplicazione necessita di precise sequenze di inizio dette promotori . In E coli, la cascata di eventi del mismatch repair INIZIA con i seguenti eventi: MutH lega riconosce e lega il mismatch nel DNA, quindi lega una ATP, cambia conformazione per formare una sliding clamp sul DNA, MutL si lega MutH e quindi attiva Mut S si forma un complesso UvrA e UvrB che cerca l'errore e crea delle distorsioniUvrA esce dal complesso e UvrB si complessa con UvrC e provoca incisioni dovc'è la lesione MutH può discriminare tra i filamenti parentale e filamento figlio grazie all'assenza di metilazione al sito d(GACT) quando viene sintetizzata la nuova elica, quindi l'elicasi UvrD attiva MutL MutS lega riconosce e lega il mismatch nel DNA, quindi lega una ATP, cambia conformazione per formare una sliding clamp sul DNA, MutL si lega MutS e quindi attiva Mut H . Nella RNA polimerasi di E.coli la subunità sigma70 media il legame della polimerasi al promotore, riconoscendo le sequenze -10 e-35, attraverso il dominio N terminale che riconosce il segmento UP del promotore fa parte del core della polimerasi media il legame della polimerasi al promotore, riconoscendo le sequenze -10 e-35, attraverso il dominio C terminale che riconosce il segmento UP del promotore è importante principalmente nella fase di allungamento . Qual'è l'elemento che agisce in trans (trans-dominante) nella regolazione l'allolattosio il gene lacZ il repressore promotore. La prima fase della riparazione per escissione di basi (BER), comune alle due vie short-patch BER e long-patch BER, coinvolge in successione l'attività di due enzimi, quali? DNA glicosilasi ed endonucleasi Ape1 DNA glicosilasi e Esonucleasi DNA glicosilasi ed endonucleasi Ape1 DNA glicosilasi ed endonucleasi Ape1 . Quale funzione viene alterata nella sindrome di Cockayne Riparazione del danno ossidativo associato alla trascrizione Riparazione del danno ossidativo associato alla trascrizione Riparazione del danno ossidativo associato alla traduzione Riparazione del DNA da UV, o sostanze chimiche . Qual'è la principale polimerasi coinvolta nella replicazine del DNA in E.coli? DNA polimerasi III DNA polimerasi II DNA polimerasi I DNA polimerasi . Quale funzione viene alterata nella sindrome di Cockayne Riparazione del DNA da UV, o sostanze chimiche la riparazione per escissione dei nucleotidi TCR-NER Riparazione del danno da sostanze alchilanti Riparazione del danno ossidativo associato alla trascrizione . Qual'è l'elemento che agisce in trans (trans-dominante) nella regolazione l'induttore il gene lacZ il promotore il repressore . Qual'è la principale polimerasi coinvolta nella replicazione del DNA in E.coli? Pol ? DNA polimerasi III DNA polimerasi II DNA polimerasi I . Durante la replicazione della cromatina, la forca di replicazione disassembla gli ottameri di istoni in tetrameri H32-H42 e in dimeri H2A-H2B Durante la replicazione della cromatina, la forca di replicazione disassembla gli ottameri di istoni in tetrameri H32-H42 e in dimeri H2A-H2B. Sono necessarie alcune proteine ausiliare (tra cui CAF e NP1) che favoriscono l'assemblaggio dei nucleosomi. Durante la replicazione della cromatina, la forca di replicazione disassembla gli ottameri di istoni in tetrameri H32-H42 e in dimeri H2A-H2B.i nucleosomi. Durante la replicazione della cromatina, la forca di replicazione disassembla gli ottameri di istoni in dimeri H32, H42 e in dimeri H2A-H2B. ll riassemblaggio dei nucleosomi comporta l'associazione degli istoni al DNA senza necessità di proteine ausiliarie Durante la replicazione della cromatina i nucleosomi restano permanentemente associati al DNA passando ad una delle due doppie eliche figlie. La prima fase della riparazione per escissione di basi (BER), comune alle due vie short-patch BER e long-patch BER, coinvolge in successione l'attività di due enzimi, quali? DNA glicosilasi e Esonucleasi DNA glicosilasi ed endonucleasi Ape1 Complesso RecBCD e proteina RecA XRCC1 e Ligasi. Perchè mutazioni in BRCA2 sono responsabili del 50% di tumori al seno? Il prodotto di BRAC2 interagisce con la proteina Rad51 e controlla la stabilità del genoma perchè la sua mancanza non permette una corretta riparazione del DNA tutte e tre le risposte sono corrette Il gene BRCA2 stabilisce con Rad51 delle interazioni proteina-proteina . Qual'è la proteina centrale della ricombinazione omologa RecA presente solo nei Procarioti RuvB che fornisce l'energa per lo scambio di appaiamenti RecA che è il prototipo di una classe di proteine presenti in tutti gli organismi RuvC che taglia i filamenti di DNA a livello della giunzione di Holliday . I meccanismi di riparazione sono specifici per tipo di errore e funzionalmente conservat. La riparazione diretta del danno avviene per tolleranza per sintesi di translesione per ricombinazione omologa per escissione delle basi e dei nucleotidi tramite fotoriattivazione e transmetilazione . Il DNA viene danneggiato sia per cause endogene che per cause esogene. Gli errori sono dati con la stessa frequenza da agenti mutageni esogeni ed endogeni. da danni esogeni i stimati al giorno 50000 rotture della singola elica. in maggior parte da agenti mutageni endogeni, quindi il DNA è danneggiato in condizioni fisiologiche da acqua, ossigeno e agenti alchilant in maggior parte da agenti mutageni ambientali, quali raggi X, agenti chimici, UV . Gli agenti alchilanti sono sostanze che si formano per l'aggiunta di un gruppo metilico o ossidrilico agli atomi delle basi nucleotidiche o allo scheletro fosfodiesterico. Possono essere sia bifunzionali,sia monofunzionali. sono composti elettrofili con affinità per gli atomi nucleofili delle basi a cui aggiungono gruppi metilici o etilici si formano per l'aggiunta di un gruppo alchile agli atomi delle basi nucleotidiche o allo scheletro fosfodiesterico. Possono essere bifunzionali, quando si legano ad una sola parte della molecola e non formano cross link. sono composti elettrofili con affinità per gli atomi nucleofili delle basi a cui aggiungono gruppi metilici o etilici. Sono solitamente bifunzionali. Nel caso del long-patch BER negli eucarioti, le attività di tre proteine, oltre alla ligasi finale, provvedono ad allungare di alcuni nucleotidi il 3'OH e a tagliare via il tratto di DNA spostato. Di quali proteine si tratta? DNA polimerasi ? o ? PCNA TFIIH FEN1 . Le sequenze ripetute nell'origine di replicazione (OriC) del cromosoma di E.coli vengono legate da una proteina che forma un grosso multimero associato all'Origine stessa. Di che proteina si tratta? Elicasi DnaA DnaB SSB. In questa rappresentazione schematica di un classico promotore procariotico, identifica gli elementi A, B e C e la distanza D. fig 9.1 A: Elemento -35, B: Elemento -10 (Pribnow box), C: Sito di inizio della trascrizione, D: 17-19 pb A:Elemento -10 (Pribnow box), B:Sito di inizio della trascrizione, C:Elemento -35, D: 17-19 pb, A: Elemento -35, B: Elemento -10 (Pribnow box), C: 17-19 pb, D:Sito di inizio della trascrizione A:17-19 pb, B:Sito di inizio della trascrizione, C: Elemento -10 (Pribnow box),D:Elemento -35 . La figura rappresenta 8.1 RNA polimerasi batterica complesso di preinizio nella trascrizione eucariotica olenzima RNA polimerasi batterica DNA polimerasi batterica . Relativamente al seguente tratto di una molecola di RNA, quale è la sequenza del filamento "stampo" del DNA? 5'-UACGCGGUACGGUCAAUGCAUCUACCU-3' 3'-ATGCGCCATGCCAGTTACGTAGATGGA-5' 3'-TACGCGGTACGGTCAATGCATCTACCT-5' 5'-TACGCGGTACGGTCAATGCATCTACCT-3 5'-ATGCGCCATGCCAGTTACGTAGATGGA-3' . Identifica correttamente le subunità dell'enzima nell'immagine fig 8.1 1.?, 2. ?, 3.?, 4.?, 5.? 1. ?, 2.?', 3.?, 4.?, 5.? 1.TFIIA, 2.TFIID, 3.TBP, 4.TFIIH, 5.TFIIE 1.RPB1, 2.RBP1, 3.11, 4.3, 5.CTD . Quale delle seguenti affermazioni è vera per la regione lacO dell'operone lac? Mutazioni in questa regione portano all'espressione costitutiva del promotore. Codifica per la proteina galattoside permeasi. Codifica per la proteina del repressore Lac. Contiene il promotore dell'operone. . Nella trascrizione procariotica La funzione del fattore ? è di riconoscere e legarsi al DNA a livello dei promotori, e non di altri siti, formando un complesso su cui successivamene si lega la RNA polimerasi. il fattore ? può riconoscere le sequenze promotrici anche quando non è parte dell'oloenzima La funzione del fattore ? è di legarsi alla RNA polimerasi batterica rendendola capace di riconoscere e legare stabilmente il DNA soltanto a livello dei promotori, e non di altri siti. Il nucleo (core) enzimatico della RNA polimerasi procariotica è in grado di distinguere i promotori dalle altre sequenze di DNA anche in assenza del fattore ?. Unità di espressione genica costituita da uno o più geni connessi e dalle sequenze dell'operatore e del promotore, che ne regolano la trascrizione induttore repressore promotore Operone. Quale delle seguenti affermazioni NON è vera per l'operone lac La regione dell'operatore regola la trascrizione attraverso l'interazione con la proteina repressore Lac. la trascrizione produce un singolo mRNA policistronic, che contiene lacZ, A e lac Y. Il gene lacI gene è controllato dallo stesso promotore del gene lacZ. Il repressore Lac è espresso costitutivamente. . cellule di E coli vengono fatte crescere in un mezzo di coltura che ha come unica fonte di C il gluccosio. Si aggiunge triptofano., le cellule continuano a crescere dividendosi ogni 30 minuti. Come cambiano i livelli di sintasi del triptofano, una proteina codificata dall'operone del triptofano , se il mRNA del triptofano è stabile, ossia viene degradato molto lentamente? I livelli di sintasi del triptofano restano elevati per molto tempo Quando la concentrazione del triptofano (aggiunto al mezzo di coltura) è alta, i livelli di sintasi del triptofano diminuiscono significativamente a causa dell'attenuazione della traduzione dell'mRNA, anche se l'mRNA è stabile. Non ci sono abbastanza elementi per poter dare una risposta I livelli di sintasi del triptofano aumentano in modo esponenziale. l risultato visto nello studio dei merodiploidi di Jacob e Monod che ha suggerito che la regione lacI agisse in trans per regolare l'operone lac era Un mutante non funzionale lacI non può essere corretto da un allele lacI Un mutante non funzionale lacO è corretto da un allele wild-type lacO. Un mutante non funzionale lacO non può essere corretto da un allele lacO Un mutante non funzionale lacI è corretto da un allele wild-type lacI . . La proteina del repressore Lac si lega All'operatore indipendentemente dalla presenza o meno di allolattosio Al gene lacZ in presenza di allolattosio All'operatore in presenza di allolattosio All'operatore in assenza di allolattosio. in quali casi si hanno i più alti livelli di espressione dell'operone del lattosio Alti livelli di glucosio, lattosio presente Bassi livelli di glucosio lattosio presente Alti livelli di glucosio, lattosio assente Bassi livelli di glucosio lattosio assente . Come sarebbe influenzata la trascrizione del trp di E. coli da modificazioni nella sequenza 3 della regione leader del mRNA del trp in modo che si possano appaiare con la sequenza 4 e non con la 2 Il sistema di attenuazione non risponderebbe più alla concentrazione di triptofano Non ci sarebbe attenuazione e la trascrizione procederebbe alla velocità massima L'attenuazione diminuirebbe e quindi la trascrizione aumenterebbe, perché le sequenze 2 e 3 si appaierebbero più spesso L'attenuazione aumenterebbe e quindi la trascrizione diminuirebbe, perché si avrebbe pratica¬mente sempre l'appaiamento delle sequenze 3 e 4. . Qual è il principio della tecnica EMSA? saggio usato per mappare esattamente le sequenze di contatto tra basi del DNA e proteine, si incubano i complessi DNA proteina con le nucleasi ed il taglio avviene a livello dei siti esposti al solvente, non dove la proteina è legata tecnica che permette di valutare una diversa metilazione in regioni del DNA tecnica di elettroforesi su gel di agarosio o acrilammide per separare frammenti di DNA di diversa lunghezza la metodica consente di valutare una diretta interazione tra proteine e DNA, basandosi sul cambiamento della mobilità elettroforetica quando i frammenti di DNA e proteine dopo incubazione vengono fatti migrare su un gel acrilammide denaturante. La sequenza consenso -10 è TATAAT. Se due geni tipA e tipB hanno promotori con la stessa sequenza, a parte la regione -10, dove il promotore di XXX è TAATAT e quello di XXY è TGTCGA, quale gene sarà trascritto più efficacemente e perché? viene trascritto più efficientemente tipA perché la sequenza in posizione 210 di tipB devia maggiormente dalla sequenza consenso e sarebbe più difficile da aprire, perché ha un contenuto di GC superiore. non c'è differenza vengono trascritte ugualmente viene trascritto più efficientemente tipB perché la sequenza in posizione 210 di tipA devia maggiormente dalla sequenza consenso e sarebbe più difficile da aprire, perché ha un contenuto di TA superiore viene trascritto più efficientemente tipA, perché è più simile alla sequenza originale del promotore . nel modello di Holliday, l'evento si risolve tagliando e ricucendo i filamenti prodotti mediante DNA polimerasi I endonucleasi ligasi resolavasi . La sintesi di translesione è un meccanismo di riparazione è una variante della ricombinazione omologa che utilizza hMutLa e hMutLb: interagiscono con MSH e con i fattori di replicazione per il riparo che ammette la tolleranza può incorporare nucleotidi in assenza di una stampo, ma commette molti errori che ammette la tolleranza può incorporare nucleotidi in assenza di una stampo, ma è comunque affidabile . Quali dei seguenti è un fattore chiave nella trascrizione dei mRNA eucarioti, che rilascia la pol II bloccata dal promotore prossimale ed appartiene ad un complesso più grande SEC(super elongation complex)? SSRP1 TBP P-TEFb TFIIS . Che cos'è il "quorum sensing"? Una risposta utilizzata dai batteri quando si verifica un'infezione anche tra batteri di specie diverse Un meccanismo di attivazione trascrizionale tipico delle cellule eucariote monocellulari, quali I lieviti quando si trovano in condizioni di sovraffollamento Un particolare tipo di trascrizione fagica. Un sistema di regolazione trascrizionale utilizzato dai batteri quando sono molto numerosi, essi producono sostanze capaci di diffondere all'interno delle cellule di batteri della stessa specie e di attivare la risposta. Quale delle seguenti caratteristiche della replicazione del DNA NON è la stessa per la trascrizione dell'RNA? L'inizio richiede il riconoscimento di una specifica sequenza del DNA La sintesi richiede un templato La sintesi è catalizzata in direzione 5'->3' L'inizio della sintesi richiede un primer . Il complesso del MEDIATORE è un importante componente per la formazione del PIC (complesso di pre-inizio della trascrizione), molto conservato tra lievito e mammiferi è un complesso di oltre 4 subunità, molto conservato tra lievito e mammiferi lega direttamente la RNA polimerasi mitocondriale è un importante componente per la inibizione del PIC (complesso di pre-inizio della trascrizione), molto conservato tra lievito e mammiferi . Qual modificazione avviene nel dominio CTD della RNA polimerasi durante fase di allungamento della trascrizione? nessuna una fosforilazione un'acetilazione una metliazione . Quale elemento è presente solso nella trascrzione in vivo degli eucarioti e non in vitro? TBP TAF TFIIH il Mediatore . La terminazione della trascrizione nei batteri avviene attraverso due principali meccanismi, che possono impiegare o meno una proteina, il terminatore Rho. Quale fra le seguenti affermazioni sulla proteina Rho è corretta? È una esonucleasi che degrada le estremità 3' dei trascritti di RNA È una subunità della RNA polimerasi che, in seguito a un cambio conformazionale della polimerasi, ne impedisce la trascrizione. È un'endonucleasi che taglia a livello di sequenze di terminazione specifiche. È un'elicasi che rompe l'appaiamento di basi fra stampo e trascritto. Trascrivi in vitro un frammento di DNA e purifica l'RNA prodotto, se separi i due filamenti del DNA e analizzi la composizione in basi di ciascuno di essi e dell'RNA trascritto, ottenendo i dati mostrati nella tabella. Quale filamento di DNA è il filamento stampo per la sintesi dell'RNA (tenendo conto che ci può essere un po' di errore sperimentale)? (Figura 6.4) filamento 1 e 2 Abbiamo troppo poca informazione per decidere. filamento 2 filamento 1 . Durante lo splicing nucleare, l'avvicinamento dei siti donatore (5') e accettore (3') è indotto dall'interazione delle snRNP U1 e snRNP U2 con ... Complesso formato da snRNP U4/U6 e U5. Complesso formato da snRNP U3 e U4. BBP (Branching point Bindin Protein) EJC Exon Jnction Complex . eventi chiave per la ricombinazione omologa sono tutte e tre le risposte sono corrette formazione e risoluzione delle giunzioni di Holliday allineamento di 2 regioni omologhe, invasione del filamento, introduzione di rotture sul DNA, . Quale dei seguenti fattori di trascrizione è utilizzato da tutte e tre le RNA polimerasi? TFIID TFIIIC TBP TFIIF . DNA footprinting" è una tecnica che può essere utile per identificare Una regione del DNA che è stata danneggiata da una mutazione Lo specifico sito di legame di un repressore, polimerasi o altra proteina sul DNA . La posizione di una regione a doppia elica all'interno di una regione a singola elica. La posizione di un particolare gene di un cromosoma . Qual è il corretto ordine degli eventi trascrizionali che avvengono dopo che la polimerasi si è legata al promotore? formazione del complesso chiuso, , formazione del complesso aperto, clearance del promotore, inizio della sintesi dell' RNA A. Inizia la sintesi dell'RNA,formazione del complesso aperto, formazione del complesso chiuso, clearance del promotore C. formazione del complesso chiuso, formazione del complesso aperto, inizio della sintesi dell' RNA, clearance del promotore D. formazione del complesso aperto, formazione del complesso chiusoo, inizio della sintesi dell' RNA, clearance del promotore . Quali delle seguenti RNA polimerasi è responsabile di codificare la maggior parte degli RNA codificanti? RNA polimerasi IV RNA polimerasi I RNA polimerasi II RNA polimerasi III . l trans-splicing è una forma particolare di splicing dell'RNA, osservato per lo più in alcuni organismi la giunzione interessa molecole di RNA diverse le giunzione interessa esoni non consecutivi tutte e tre le risposte sono corrette interessa solo organismi procariotici . lo spliceosoma è coinvolto nello splicing di Precursore dell'rRNA di Tetrahymena. Pre-mRNA nucleari eucariotici Pre-mRNA mitocondriali. tutti i mRNA .

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