BIOLOGIA MOLECOLARE lez 1-17

Quale dei risultati sperimentali di Avery dimostrò che il DNA è necessario e sufficiente alla trasformazione dei batteri?. Le proteine da sole permettono la trasformazione. Rimuovendo il DNA dagli estratti cellulari ottenuti dal ceppo S la trasformazione non avveniva. L'aggiunta di DNA da solo permette la trasformazione. Rimuovendo l'RNA dagli estratti cellulari ottenuti dal ceppo S la trasformazione non avveniva.

Anche se c'è una rotazione libera intorno al legame glicosidico delle basi azotate, l'ingombro sterico. fa adottare alle pirimidine solo la configurazione anti. fa adottare alle pirimidine solo la configurazione sin. permette alle purine solo la configurazione sin e molte possibilità alle pirimidine. le purine possono adottare solo la configurazione anti.

Qual è l'unità base di un acido nucleico?. un amminoacido. una base azotata. un nucleotide. uno zucchero.

Un legame fosfodiesterico: lega due basi azotate. lega due nucleotidi. lega due proteine. lega due amminoacidi.

Quali sono le funzioni fondamentali del DNA?. trasmettere e ricreare l'informazione genetica. rinnovare e riprodurre l'informazione genetica. conservare e trasmettere l'informazione genetica. conserva e allinea l'informazione genetica.

Se su un filamento di DNA si susseguono le basi TTTACGATATACC quali sono le basi complementari sull'altro filamento della doppia elica?. AAAUGCTAUAUGG. CCCTGCTCTCTGG. AAATGCTATATGG. TTTACGATATACC.

Nel DNA di una cellula, qual è in percentuale la quantità di timina se la citosina è il 35%?. 15%. 30%. 35%. 25%.

Quali dei componenti chimici di una catena polinucleotidica presentano cariche negative?. I residui di zucchero (desossiribosio o ribosio). I gruppi fosfato. Nessuno. Le basi puriniche.

Le prime prove sperimentali che il DNA costituisce il materiale ereditario degli organismi furono ottenute da: Mendel. Lamarck e Darwin. Griffith e Avery. Watson e Crick.

Che cosa ha osservato Chargaff?. in tutte le specie A+T=G+C. il DNA estratto da tessuti diversi di organismi della stessa specie ha la stessa composizione in basi. la composizione in basi non varia da una specie all'altra. in tutte le specie il n delle guanine è uguale a quello delle adenine.

Cos'è la struttura primaria di una molecola di DNA?. è la sequenza di fosfati. è la sequenza di amminoacidi. è la sequenza di acidi grassi. è la sequenza di nucleotidi.

Quali sono le tre conformazioni del DNA che conosciamo?. Z C A. Z B C. A Z S. B A Z.

La trascrittasi inversa può: sintetizzare DNA leggendo uno stampo di RNA. sintetizzare RNA leggendo uno stampo di DNA. sintetizzare proteine leggendo uno stampo di RNA. sintetizzare RNA leggendo la sequenza di proteine.

Quale struttura assume una doppia elica ibrida costituita da un filamento di DNA ed uno di RNA?. Struttura B. Struttura Z. Struttura A. Struttura mista.

Per palindrome si intende una particolare sequenza che può essere letta nello stesso modo da sinistra a destra e da destra a sinistra. Indicare quale delle seguenti sequenze di DNA a singolo filamento, diventa una palindrome associandosi al filamento complementare: 3'-CGTATTATGC-5'. 3'-GAGTAACTAC-5'. 3'-CAAAGGTTTG-5'. 3'-GAGCCGGCTC-5'.

Quale superstruttura può essere assunta da un tratto di DNA a doppia elica che contiene una sequenza ripetuta e invertita?. Struttura circolare. Struttura Z. Struttura cruciforme. Struttura superavvolta.

Quali sono i parametri della struttura Z del DNA?. Elica sinistrorsa | Diametro dell'elica 18 Å Passo dell'elica 46 Å. Elica sinistrorsa | Diametro dell'elica: 20 Å Passo dell'elica: F34 Å. Elica destrorsa | Diametro dell'elica 18 Å Passo dell'elica 46 Å. Elica destrorsa | Diametro dell'elica 25 Å | Passo dell'elica 23 Å.

La T°C melting del DNA. è una Timina che viene eliminata e porta lla fusione del DNA. è la T°C a cui il 50% del DNA è denaturato. è la T°C a cui il 100% del DNA è denaturato. è la T°C a cui il DNA si scioglie.

La singola elica di DNA assorbe la luce UV meglio della struttura a doppia elica perché: le basi all'interno della doppia elica sono inaccessibili agli UV. a causa dell'effetto ipercromico. l'impilamento delle basi aumento l'assorbimento della luce bianca a discapito dell'assorbimentodella luce UV. non è vero la singola elica assorbe più luce UV.

Gli appaiamenti di Hoogsteen. può creare interazioni addizionali AT. risulta in un triplex in cui tutti e tre i filamenti sono composti solo da purine. possono risultare nella formazione di una tripla elica all'interno di lunghe sequenze che contengono solo purine e pirimidine in un filamento. risulta in un tetraplex da uno strecht di residui di G.

L'effetto ipercromico del DNA consiste nel fatto che: se è a nucleotidi liberi assorbe meno luce UV. se è a singola elica assorbe meno luce UV. se è a doppia elica assorbe meno luce UV. se è a doppia elica assorbe più luce UV.

Quale delle seguenti proprietà chimiche dell'interazione tra purine e pirimidine non influenza struttura e funzione degli acidi nucleici?. il tautomerismo delle basi. la planarità delle basi. l'impilamento idrofobico. l'assorbanza agli UV.

Le Topoisomerasi di tipo 1 tagliano. un solo filamento e sono dei monomeri. entrambi i filamenti e sono in genere monomeri. un solo filamento e sono dimeri o multimeri. entrambi i filamenti e sono in genere dimeri o multimeri.

Per denaturazione del DNA si intende: la separazione dei due filamenti per rottura dei legami idrogeno. l'inattivazione di un gene. l'idrolisi del DNA. la sostituzione di alcuni nucleotidi nel DNA.

Considerando una molecola di DNA duplex circolare superavvolta, qual'è la relazione che esiste tra le grandezze: "twist" (Tw), "writhe" (Wr) e "linking number" (Lk)?. Lk = Tw + Wr. Lk = Tw - Wr. Lk = Tw · Wr. Tw = Lk + Wr.

Le Topoisomerasi di tipo II tagliano. un solo filamento e sono dei monomeri. un solo filamento e sono dimeri o multimeri. entrambi i filamenti e sono in genere monomeri. entrambi i filamenti e sono in genere dimeri o multimeri.

Quale dei seguenti componenti NON appartiene al ribonucleotide. Uracile. Gruppo fosfato. Timina. Ribosio.

La lettura di un segmento di DNA contenente il 20% di Adenina produrrà una sequenza di: DNA contenente il 40% di Uracile. RNA contenente il 20% di Uracile. DNA contenente il 40% di Timina. RNA contenente il 20% di Timina.

L'RNA può avere attività enzimatica?. no, la solo funzioni di regolazione e trascrizione. no, può interagire con enzimi e mediarne l'attività ma non funzionare come un'enzima. Sì, le snRPN sono enzimi coinvolti nello splicing. sì, i ribozimi sono RNA che hanno un sito di legame per il substrato ed una per i cofattori.

Quali funzioni dell'RNA sono dipendenti dalla sua struttura terziaria?. tutte. trasportatore transiente di informazione genetica. trasportatore di aminoacidi al sito di sintesi proteica. ruolo di splicing e trascrizione.

La particolare instabilità dell'RNA (rispetto alle molecole di DNA) è dovuta alla presenza di un gruppo ..... sulla posizione 2' del ribosio. fosforico. amminico. metilico. ossidrilico.

Il punto isoelettrico è il pH al quale. una proteina presenta una carica netta negativa. una proteina presenta una carica netta nulla. una molecola presenta solo gruppi funzionali protonati. una proteina presenta una carica netta positiva.

La lisina è un amminoacido. polare con catena laterale neutra. polare con catena laterale carica negativamente. polare con catena laterale carica positivamente. apolare.

In una proteina, il legame peptidico si forma. tra il gruppo carbossilico e il gruppo amminico dell'amminoacido successivo. tra il gruppo amminico e il gruppo carbossilico dell'amminoacido successivo. tra il gruppo carbossilico e la catena laterale dell'amminoacido successivo. tra il gruppo amminico e la catena laterale dell'amminoacido successivo.

Gli enzimi catalizzano reazioni chimiche. aumentando l'affinità dei reagenti che prendono parte alla reazione. aumentando la velocità d'interazione tra i reagenti. stabilizzando la struttura dello stato di transizione. legando in maniera specifica i prodotti della reazione.

All'interno del canale d'uscita delle proteine nel ribosoma. la proteina nascente può disporsi solo sotto forma di filamento. possono formarsi le prime strutture ad ɑ-elica. interi domini proteici possono ripiegarsi nella loro struttura nativa. possono formarsi le prime strutture a foglietto β.

Quale tra questi motivi o domini strutturali media il legame di una proteina all'RNA?. Jelly Roll. HLH. RRM. HTH.

Che cosa è il quoziente di impacchettamento o (compattamento) del DNA in vivo?. Rapporto tra numero di geni e lunghezza del DNA. Rapporto tra numero di cromosomi e dimensioni del compartimento che li contiene. Rapporto tra lunghezza del DNA e numero di giri di superavvolgimento. Rapporto tra lunghezza del DNA e e le dimensioni della struttura o compartimento che lo contiene.

I contatti tra il DNA e gli istoni del nucleosoma: circa la metà dei legami avviene tra lo scheletro fosfodiesterico e solco minore e lo scheletro peptidico degli istoni. avvengono tra le catene laterali degli aminoacidi e lo scheletro fosfodiesterico del DNA. principalmente tra i motivi conservati degli istoni e le basi esposte verso la tasca maggiore del DNA. Prevalentemente nelle regioni di DNA ricche di GC dove il DNA tende a piegarsi spontaneamente.

Quale(i) enzima(i) viene (vengono) usato(i) per digerire la cromatina, e taglia(no) il DNA in multipli interi di 200 bp, permettendo di studiare l'organizzazione del DNA in nucleosomi?. Esonucleasi. DNAasi I. Nucleasi micrococcica. DNAasi I e DNAasi II.

Da quali complessi è formato l'ottamero di istoni del nucleosoma?. Due dimeri H3·H4 e due dimeri H2A·H2B. Due dimeri H3·H4, un dimero H2A e un dimero H2B. Un tetramero (H2A·H2B) e due dimeri H3·H4. Un tetramero H3·H4, un dimero H2A e un dimero H2B.

Quale delle seguenti affermazioni corrisponde alla struttura del nucleosoma?. il DNA si avvolge per 2 volte attorno al core formando un superavvogimento destrorso solenoidale. i nucleosomi sono composti da circa 1000 bp avvolte intorno all'istone core. il DNA si avvolge per 3 volte attorno al core formando un superavvogimento sinistrorso solenoidale. i nucleosomi sono composti da circa 200 bp di DNA avvolte intorno all'istone core.

Caratteristiche della eterocromatina costitutiva. è sempre compattata, trascrizionalmente inattiva e priva di geni. è quasi sempre compattata, trascrizionalmente inattiva e con pochi geni. è quasi sempre compattata, contiene pochi geni trascritti in alcuni casi ma non in altri, contiene geni. è poco compattata, sempre trascritta.

Quali sono le caratteristiche della eterocromatina facoltativa?. è sempre compattata. Non contiene geni. è sempre trascrizionalmente inattiva. è trascritta in alcuni casi ma non in altri.

I centromeri. sono sequenze alle estremità dei cromosomi che aumentano la stabilità dei cromosomi lineari. sono sequenze sul cromosoma eucariote che funzionano durante la divisione cellularecome punto d'attacco per le proteine che associano il cromosoma al fuso mitotico. sono le sequenze in cui si forma il cinetocore nei cromosomi dei procarioti. sono i siti a cui inizia la replicazione nei procarioti.

La funzione dei telomeri ha a che fare con: nessuna delle affermazioni è corretta. il potenziale proliferativo di una cellula. la protezione del genoma dei batteri. la trascrizione dei geni che vi sono contenuti.

L'istone H1 linker. appartiene ad una struttura di supporto detta scaffold. si assembla in un tetramero con H3-H4. è una piccola proteina globulare con una coda N terminale da 20 a 35 amminoacidi,. promuove la condensazione del DNA, è necessaria alla segregazione dei cromosomi durante la mitosi, è implicata nei meccanismi di riparazione.

In che modo il legame dell'istone linker H1 differisce da quello degli altri 4 istoni?. Si lega al DNA che fuori da entrambi i lati del nucleosoma. si lega al DNA come parte dell'ottamero, ma non ha la coda istonica. si lega ad un filamento del DNA linker, che esce dal nucleosoma e lega un secondo sito nel DNA avvolto nel core. Si lega solo al solco maggiore del DNA.

La fosforilazione degli istoni è altamente dinamica, si distinguono chinasi e fosfatasi. le chinasi fosforilano serine, treonine e tirosine prevalentemente nella porzione C terminale delle code istoniche. Trasferiscono un gruppo fosfato da una molecola di ATP ad un gruppo OH della catena laterale dell'aminoacido target, conferendo una carica negativa agli istoni e cambiando la conformazione della cromatina. le chinasi fosforilano serine, treonine e tirosine prevalentemente nella porzione N terminale delle code istoniche. Trasferiscono un gruppo fosfato da una molecola di ATP ad un gruppo OH della catena laterale dell'aminoacido target, conferendo una carica negativa agli istoni e cambiando la conformazione della cromatina. le chinasi fosforilano serine, treonine e tirosine prevalentemente nella porzione N terminale delle code istoniche. Trasferiscono un gruppo fosfato da una molecola di ATP ad un gruppo SH della catena laterale dell'aminoacido target, conferendo una carica negativa agli istoni e cambiando la conformazione della cromatina. le chinasi fosforilano arginine, treonine e tirosine prevalentemente nella porzione N terminale delle code istoniche. Trasferiscono un gruppo fosfato da una molecola di ATP ad un gruppo OH della catena laterale dell'aminoacido target, conferendo una carica negativa agli istoni e cambiando la conformazione della cromatina.

Che differenza c'è tra un cromatosoma ed un nucleosoma?. Il cromatosoma non contiene istoni linker. Nel cromatosoma il DNA associato al nucleosoma ha un frammento di DNA più lungo. Il cromatosoma contiene un istone H1 oltre al core istonico. Il cromatosoma contiene una sola copia degli istoni del core.

Le sequenze dei telomeri contengono strutture secondarie tipo. struttura a zig-zag. Struttura a solenoide. struttura cruciforme. G quadruplex.

Nell' approccio sperimentale di Meselson e Stahl che portò le prove dell'ipotesi semiconservativa come il modello più probabile per la replicazione del DNA, quali radioisotopi e metodi di separazione sono stati usati?. Cellule infettate con il batteriofago T4 coltivate in presenza di radionuclidi, DNA analizzato con un gradiente di CsCl. Batteri cresciuti in un mezzo contenente timidina [3H] fino a che l'intero DNA contenesse catene pesanti e quindi trasferite in un mezzo di coltura leggero e pesante per un ciclo di replicazione. Separazione su gradiente di densità. Batteri cresciuti in N14 e in N15, DNA separato in un gradiente di densità di CsCl. Cellule radiomarcate con timidina [3H].

In Escherichia Coli la DNA polimerasi I. ha un'alta processività, fedeltà e un'attività esonucleasica 3'-5' (proof reading). è un complesso multisubunità formato da 10 diversi polipeptidi. ha 4 domini funzionali e 3 subunità. Riempe le brevi sequenze di DNA a singola elica che derivano dalla replicazione del DNA (lagging strand) e dalla riparazione, quando i nucleotidi danneggiati devono essere rimossi.

Le DNA polimerasi. possegono attività elicasica. non sono presenti nei procarioti. non sono mai enzimi processivi. posseggono più di una attività enzimatica.

Nella duplicazione del DNA a doppia elica, la funzione di stampo o template è svolta da: catene di RNA sintetizzate nelle fasi iniziali della replicazione. tutte e due le catene parentali di DNA. dalla DNA polimerasi. una sola delle due catene parentali.

Da quale attività enzimatica dipende il processo di correzione di bozze che caratterizza le DNA polimerasi replicative?. Esonucleasica 3'-5'. RNasica. Polimerasica 3'-5'. Esonucleasica 5'-3'.

Perchè ciascuna forca replicativa contiene un filamento guida ed un filamento discontinuo?. perchè la sintesi deve essere complementare. perchè l'elicasi svolge un filamento più velocemente dell'altro. perchè i filamenti del DNA sono antiparalleli e la polimerasi può lavorare solo in una direzione. perchè la DNA polimerasi deve sintetizzare DNA dal 3' al 5'.

Durante la replicazione del DNA le proteine SSB. idrolizzano ATP e promuovono la separazione dei due filamenti di DNA. formano una struttura ad anello e mantengono la DNA polimerasi attaccata allo stampo. fungono da caricatori della sliding clamp sul DNA stampo. legano il DNA a singolo filamento ed evitano che si formino strutture secondarie.

Il complesso proteico detto caricatore della sliding clamp catalizza l'apertura ed il posizionamento della proteina sul DNA, allo stesso modo il caricatore rimuove la sliding clamp quando la sintesi del DNA è finita. Il caricatore è ATP indipendente, quando il caricatore si lega, le subunità γ e τ cambiano conformazione e possono in questo interagire con la pinza e determinarne l'apertura. Ha sei ripiegamenti simmetrici ed formata da un dominio ripetuto tre volte in ogni monomero. il caricatore si comporta come una topoisomerasi. Il caricatore è ATP dipendente, quando il caricatore si lega, le subunità γ e τ cambiano conformazione e possono in questo interagire con la pinza e determinarne l'apertura.

La primasi: è molto attiva sul filamento discontinuo durante la replicazione. è un enzima altamente processivo. possiede attività di elicasi. trascrive normalmente i geni codificanti proteine.

Nella replicazione del DNA procariotico, la proteina Tus. riconosce le sequenze emimetilate in corrispondenza della OriC. riconosce le sequenze Ter e arresta l'avanzamento dell'elicasi. stimola l’idrolisi di ATP da parte di DnaA. stimola il legame cooperativo di DnaA alle sequenze DARS.

Qual è la principale polimerasi coinvolta nella replicazione del DNA in E.coli?. DNA girasi. DNA polimerasi II. DNA polimerasi I. DNA polimerasi III.

Un replicone è. tutto il DNA che viene sintetizzato a partire da una singola origine di replicazione. tutto il DNA che viene sintetizzato da parte della DNA polimerasi a partire da uno stesso primer. una proteina capace di riconoscere il replicatore e innescare l’inizio della replicazione. un insieme di sequenze localizzate in corrispondenza dell’origine di replicazione e sufficienti per dirigere l’inizio della replicazione.

Qual è la proteina di membrana che lega l'OriC emimetilata?. DnaB. SSB. DnaA. SeqA.

Le sequenze ripetute nell'origine di replicazione (OriC) del cromosoma di E.coli vengono legate da una proteina che forma un grosso multimero associato all'Origine stessa. Di che proteina si tratta?. Elicasi. DnaA. DnaB. SSB.

Qual è il meccanismo di replicazione del DNA dei cromosomi eucariotici?. Origini multiple bidirezionali su molecole di DNA lineare. Una origine bidirezionale su una molecola di DNA lineare. Inizio dalle estremità di molecole di DNA lineari. Origini multiple unidirezionali su molecole di DNA lineare.

La telomerasi. una grande ribonucleoproteina che consiste di un RNA (TERC), che può essere considerata un tipo specializzato di RNA polimerasi. è una grande ribonucleoproteina che consiste di un RNA (TERC) che serve da stampo e di una proteina (TERT) con attività catalitica, che funziona come una trascrittasi inversa. è una sequenza di DNA ripetitivo che si trova alle estremità dei cromosomi. non estende l'estremità 3 primo più corta ma, al contrario, allunga ulteriormente l'estremità 5 primo che protrude.

Durante la fase di selezione del replicatore eucariotico, le origini di replicazione vengono riconosciute direttamente da. le proteine istoniche. Cdc6 e Cdt1. l'elicasi MCM 2-7. il complesso ORC.