Fyziologie buňky

Disulfidické můstky. S-S můstky mezi cysteiny. vyžadují oxidační prostředí. vznikají pouze v ER. mohou se přestavovat pomocí enzymu PDI. probíhá pomocí disulfid izomerázy. jsou mezi sírou aminokyselin cysteinu a methioninu.

Vazba ubiquitinu, SUMO a NEDD8. vede k degradaci. vážou se přes S-S vazbu. vážou se peptidickou vazbou. vážou se autokatalyticky.

Peroxisom. organely zajišťující katabolismus dlouhých mastných kyselin. probíhá v něm metabolismus mastných kyselin s dlouhým řetězcem. nevzniká de novo, pouze dělením již existujících organel jako mitochondrie. může vznikat de novo pučením z ER. β-oxidace dlouhých MK.

Čím se vyznačuje transport do peroxisomů?. signální sekvence je na C-konci. signální sekvence se nachází na N-konci. transportován je již složený protein. signální sekvence je Ser-Lys-Leu. transportují se proteiny v nativní konformaci. proteiny do nich směruje signální sekvence KDEL. proteiny do nich směruje signální (směrovací) sekvence SKL. proteiny transportovány nesbalené pomocí chaperonů. u rostlin jsou modifikované na glyoxysomy.

Kolik molekul ATP dostaneme z 1 pyruvátu vstupujícího do mitochondriální matrix za aerobních podmínek?. 5. 7. 12,5. 20. 21,5. 30. 35.

Transport do mezimembránového prostoru mitochodrií. probíhá přes TOM, pomocí MIA složení SS můstků. přes TOM a TIM, pak ustřižení intermembránové domény. složení už v cytosolu a pak transport přes SAM. do matrix, tam složení a přes Oxa1 ven.

Na diagramu hydrofobicity je 7 hydrofobních oblastí, jedná se nejspíše o... receptor pro acetylcholin muskarinového typu. adenylát cyklázu. Na/K pumpu. ABC transportér. glukózový transportér. napěťově ovládaný iontový kanál.

p53. je transkripční faktor. je tumor-supresor. je inhibován fosforylací. je inhibován degradací.

Fosforylace. probíhá pouze na karboxylových aminokyseliných. probíhá na jakékoli AMK. probíhá pouze na hydroxylovaných aminokyseliných.

Jaké enzymy se podílejí na likvidaci ROS. superoxid dismutáza. glutathion reduktáza. kataláza. superoxid reduktáza.

Produkce Ca2+ je spuštěna. cAMP. IP3. cGMP. cADPR.

Signál pro transport. do ER je KDEL. do lysosomu je mannosa-6-fosfát.

TGF-β receptory. aktivují SMAD. interakce s receptory heterotetramery nebo heteropentamery RI, RII, RIII. aktivují spřažené Ser/Thr kinázy.

K čemu dochází při apoptóze?. k rozpadu jaderné laminy a disociaci jádra. vylití cytochromu c do cytoplazmy. dojde k lýze buňky. ATPsyntáza se točí opačně a na úkor ATP tvoří protonový gradient. se z mitochondrie uvolní kaspáza 9. dochází k vylití buněčného obsahu do ECM. je zastavena činnost ATP syntázy. vylití cytochromu c z matrix mitochondrie.

N-glykosylace. oligosacharidový prekurzor je (GluNAc)2(Man)9(Glu)3. inhibitorem je tunikamycin. probíhá nejprve na dolicholu, což je aminoalkohol podobný sfingosinu s dlouhým řetězcem.

Jak rakovinná buňka řeší soběstačnost co do růstových faktorů?. sama si je vytvoří. vytváří více receptorů pro růstový faktor. mutací vytváří neustále aktivní receptor. donutí buňky nádorového stromatu syntetizovat růstové faktory.

Sirtuiny. se účastní se regulace metabolismu. mají deacetylázovou aktivitu. mají jinou enzymatickou aktivitu. účastní se kalorické restrikce.

Nenasycené mastné kyseliny v membráně. zvyšují rigiditu. snižují rigiditu. zvyšují teplotu přechodu z tekuté do tuhé fáze. přispívají k větší fluiditě membrány.

Transport glukózy ze střeva. na apikální straně probíhá usnadněnou difúzí přes glukózový transportér. na apikální straně probíhá aktivně antiportem s Na+. na apikální straně probíhá aktivně symportem s K+. nepotřebuje přenašeče, probíhá samovolně difúzí. na apikální straně probíhá antiportem s K+. na apikální straně probíhá pasivně symportem s Na+. difuzí, není potřeba přenašeč.

Glukózový transportér. 10× prochází přes membránu. α-helixy tvořeny neuspořádaně z polárních a hydrofobních AK. regulován insulinem kovalentní modifikací. 12x prochází přes membránu.

SH2 doména. interaguje s Tyr-kinázami. interaguje se Ser/Thr-kinázami. je DNA-vazebný protein. zprostředkovává protein-proteinové interakce. rozpoznává fosfotyrosin v určité AA sekvenci. rozpoznává fosfoserin v určité AA sekvenci.

Transport do mitochondrií. signální sekvence je výhradně na N-konci. signální sekvence může být na N-konci nebo uprostřed sekvence. signální sekvence není odštěpena a zůstává součástí proteinu.

Jaká redoxní centra jsou v komplexu III?. Rieskeho protein s Fe-S centrem. cytochrom bH a bL, c1. NADH a FAD. cytochrom c, centra s Cu. cytochrom c, cytochrom a a1.

Transport do ER. kotranslační i posttranslační. do lumen signální sekvence obsahující hlavně aminokyselinu Leu. přes Sec61, což je porin. pro transport je nezbytná částice SRP.

Co je to Zellwegerův syndrom. cerebrohepatorenální syndrom. mutace v genech pro pro peroxisomy. v buňce se akumulují dlouhé řetězce. mutace v genech pro mitochondrie.

V savčím mitochondriálním genomu je pro komplex III kódována. 0 podjednotek. 1 podjednotka. 2 podjednotky. 3 podjednotky. 4 podjednotky.

Palmitoylová kotva. váže na glycin na N-konci. váže serin na C-konci. váže -SH skupinu cysteinu. je striktně extracelulární. vazba přes C-konec navázaného proteinu. vazba přes N-konec navázaného proteinu na cystein. orientace intracelulárně.

P pumpy. jsou pouze v plasmatické membráně. inhibitorem je vanadát. P doména je kovalentně modifikována. N je kovalentně modifikována na Arg 351. H+/K+ v apikální membráně buněk žaludeční sliznice. Ca2+ pumpa v mitochondriální membráně.

Proteolýza. je nevratná modifikace. vede výhradně k degradaci. uplatňuje se v Notch signalizaci. calpain provádí proteolýzu.

Choleratoxin. biotoxin sekretovaný bakterií Vibrio cholerae. vstupuje do buněk tenkého střeva receptorem zprostředkovanou endocytózo. způsobuje otevření Ca2+ kanálů. aktivuje adenylát cyklázu.

Co určuje orientaci N- a C-konce při transkripci do membrány ER. sekvence kladně nabitých aminokyselin. sekvence bohatá na Lys a Arg. speciální orientaci určující sekvence bohaté na Val a Leu. sekvence bohatá na Tyr a Trp. sekvence Lys, Arg.

Recyklace SNARE proteinů. v-SNARE je retrográdním transportem vráceno na původní membránu. zamotané v- a t-SNARE dojdou až do lysozomu, kde jsou rozloženy. probíhá pomocí AAA-proteáz, SNARE jsou následně degradovány proteolýzou. pro regeneraci SNARE je třeba GTP.

Hydrogenosom. způsobuje přemenu H+ na H. má v sobě poslední 3 enzymy glykolýzy. je u čeledi Trypanosomidae. má svoji vlastní DNA.

Přenos signálu fosforylací. sterická interference s vazbou substrátu nebo ligandu. vytvoření vazebného místa. změna konformace. změna lokalizace.

Interakce proteinů s fosfolipidovou dvojvrstvou je zajištěna přes. α-helix, z asi 12 polárních AK. β-skládaný list, střídají se polární a bazické AK. β-barel, antiparalelní listy. amfipatický α-helix.

Fosfolipázy. A1 a A2 štěpí MK na prvním, resp. druhém uhlíku. B štěpí polární skupinu vč. fosfátu. C štěpí MK bez rozdílu. D štěpí polární skupinu bez fosfátu.

Protein c-Myc. je transkripční faktor s motivem helix-loop-helix vázajícím DNA. hraje roli v progresi buněčného cyklu, apoptóze a transformaci buněk. je transkripční faktor s homeodoménou vázající DNA. mutace v něm je specifická pro gliomy. mutace v něm je specifická pro karcinom tlustého střeva. jeho aktivace je nutná pro inhibici terminální diferenciace buněk. reguluje přechod G2/M.

In vitro charakteristiky nádorové transformace buněk. buňky mají schopnost růst i bez podkladu. ztráta kontaktní aktivace. buňky mají neomezený replikační potenciál.

Thioredoxin je enzym, který. udržuje v lumen ER redoxní stav. udržuje v cytoplazmě cysteiny v SH formě—zajišťuje redukční prostředí cytosolu. obsahuje CXXC motiv. obsahuje -SH skupiny schopné přecházet z redukovaného do oxidovaného stavu. roli v redoxní (redukčně-oxidační) signalizaci. tvoří disulfidické mustky, S-S. obsahuje sekvenci Gly-Cys-Glu.

Export RNA z jádra. je Ran-nezávislý. rRNA vychází ve formě sbalených podjednotek ribozomů. probíhá pouze export RNA z jádra, nikoliv import do jádra.

ABC přenašeče. přenášejí jen malé hydrofobní molekuly. jen ionty. jen velké molekuly a peptidy. všechno od iontů po peptidy. aktivní přenašeč. pasivní přenašeč.

Savčí mitochondriální genom (lidský). může mít 17 100 bp, kóduje 10 proteinů, 7 genů pro tRNA a 10 rRNA. v matrix jsou rozmístěny stovky kopií genomu. kóduje jen některé podjednotky elektrontransportního řetězce. společně s proteiny tvoří nukleoidy. může mít 16 504 bp, kóduje 13 proteinů, 22 genů pro tRNA a 2 rRNA. může mít 14 708 bp, kóduje 25 proteinů, 10 genů pro tRNA a 4 rRNA.

V endoplazmatickém retikulu probíhají posttranslační modifikace. Které?. glykosylace. fosforylace. proteolýza. oligomerizace.

Nádorové stroma. jsou vlastní nádorové buňky. jsou ostatní buňky nádoru. slouží k výživě a transportu nádorových buněk.

SRP. je heterotrimerní protein. je ribonukleoprotein, skládá se z RNA a 6 proteinových podjednotek. RNA má asi 300 bází. pro rozeznání cílové sekvence je nutná podjednotka p2. p54 je důležitý pro rozeznání cílové sekvence. RNA je dlouhá 492 bází. slouží k transportu proteinů do ER. je to heptamer, který slouží k transportu do peroxisomu.

Jaderný pór. skládá se z nukleoporinů. brání volné difúzi proteinů větších než 40 kDa. tvoří místo kontaktu vnější a vnitřní membrány. jeho prostřednictvím je propojena vnitřní a vnější membrána.

NLS: napojen na protein. N-koncem. C-koncem. krátká sekvence s obsahem Arg a Lys. krátká sekvence s obsahem Leu.

Na přechodu proteinu mezi membránou a vodným prostředím se vyskytují které aminokyseliny. Tyr, Trp. Met, Cys. Val, Leu. Asp, Glu.

O-glykosylace. cukry jsou vázány na OH-skupinu Ser a Thr. probíhá na vnitřní membráně ER. prekurzory jsou fosforylované monosacharidy. výjimečně na hydroxyprolinu. na Cys a Met. na Val a Leu. probíhá na vnější membráně ER. výjimečně může být glykosylován hydroxylysin.

Kinázy. aktivační smyčka po fosforylaci brání navázání substrátu. aktivační smyčka po fosforylaci umožňuje navázání substrátu. aktivační smyčka se nachází v C-koncové α-helixové doméně. aktivační smyčka se nachází v C-koncové β-listové doméně.

SNARE proteiny po splynutí váčku. jsou rozpleteny AAA proteázou. V-SNARE se retrográdním transportem vrací, recykluje. jsou degradovány v lysozomu. jsou výhradně transmembránové.

Transport RNA z jádra. pouze export, nikdy ne import. závislý na Ran-GTPáze. RNA exportováno ve formě ribozomálních podjednotek. export mRNA funkčně propojen se sestřihovými faktory.

Inhibitor splývání váčků pomocí v-SNARE a t-SNARE. botulotoxin. aflatoxin. tetanotoxin. digitoxin. ouabain. rotenon.

Vyberte pravdivá tvrzení o koncetracích iontů. intracelulárně je více Na+. extracelulárně je více K+. extracelulárně je více Ca2+.

Transport proteinů do ER. solubilní proteiny mají sekvenci KDEL. membránové proteiny mají KKXX sekvenci.

Steroidní receptory. Po vazbě na PM aktivují kinázy. Po vazbě v cytoplazmě se translokují do jádra, kde regulují transkripci. Jsou to TF. váží steroidní hormony jako je tyroxin a kyselina retinová. umístěny uvnitř buňky. umístěny vně buňky. mohou vstoupit do jádra a modulovat genovou expresi. patří mezi ně receptory pohlavních hormonů.

Importin-β. váže náklad s GTP-Ran. váže náklad s GDP-Ran. váže náklad v nepřítomnosti Ran-GTPázy. potřebuje k transportu importin alfa.

Sfingolipidy. skládají se ze sfingosinu, přes amino skupinu navázané mastné kyseliny a přes hydroxylovou skupinu navázanou polární část (cukr nebo např fosfocholin). skládají se ze sfingosinu, přes hydroxylovou skupinu navázané mastné kyseliny a přes amino skupinu polární část (cukr nebo např fosfocholin). ceramid je prekurzor sfingolipidů, za X má navázán jen H. Sfingosin má dlouhý řetězec s až 90 C.

Tvorba disulfidických můstků. probíhá pouze v lumen ER. je mezi sírami cysteinů a methioninů. probíhá pomocí disulfid izomerázy.

Nádorové supresory. zabraňují abnormální proliferaci a přenosu poškozené genetické informace. inaktivace má recesivní charakter. inaktivace má dominantní charakter.

Jak vypadá transportní systém TOM?. komplex receptorů a kanálů na vnější mitochondriální membráně. komplex receptorů a kanálů na vnitřní mitochondriální membráně. Tom 40, Tom 22, Tom 5, Tom 6, Tom 7, Tom 70. Tom 50, Tom 20, Tom 5, Tom 8, Tom 4, Tom 61. Tom 40, Tom 22, Sam 50. nějaké tomy a Oxa 1. nějaké tomy a Sec61.

Ve tvorbě COPII váčků se uplatňuje malý GTP-vazebný protein. Který?. Ras. Rab. Sar1. Ran.

GPI kotva. uchycuje protein přes jednu se svých mannóz na jeho C-konci. protein na kotvu přenesen přes GPI-transamidázou. extracelulární. intracelulární. je připojena na N-konec proteinu. skládá se z fosfatidylinositolu, 4 mannóz, N-acetylglukosaminu, fosfoethanolaminu. vyskytuje se ve vnějším listu PM.

Sfingomyelin má jako polární skupinu. oligosacharid. fosfatidylcholin. fosfoserin. fosfocholin.

AAA proteázy. jsou jen u eukaryot. degradují transmembránové mitochondriální proteiny. jsou to hexamery tvořící prstenec. pracují za spotřeby ATP.

Scrambláza. ruší symetrii v membráně přehazováním fosfatidylserinu do vnější membrány. má úlohu při apoptóze. je aktivovaná ROS. patří mezi flopázy.

Protein pRb. DNA-vazebný protein. hraje důležitou roli v regulaci transkripčních faktorů. je tumorsupresor. je protoonkogen. je regulován fosforylací. je regulován degradací.

Bacteriorhodopsin. je světlem poháněná protonová pumpa. obsahuje aldehyd retinal. má 7 transmembránových α-helixů. tvoří dimer. tvoří trimer.

Fosforylace na tyrosinu. způsobuje signalizaci především sterickou interferencí. způsobuje signalizaci především vytvořením nového vazebného místa. neexistuje u prokaryot a nižších eukaryot. k jejímu rozvoji dochází se vznikem mnohobuněčnosti. vzniká se vznikem mnohobuněčnosti.

Pro transport proteinů do ER platí které z následujících?. je výhradně kotranslační. signální sekvence obsahuje hlavně aminokyselinu leucin (Leu, L). signální sekvence je na N-konci. je nutná SRP.

Cytokinové receptory. dimerizují po navázání ligandu. jsou hlavně tyrosinové. fosforylují STAT faktory. asociovány s kinázami JAK.

V intermembránovém prostoru mitochondrií je. cytochrom c. apoptózu indukující faktor (Apaf). adenylát kináza. kreatin kináza.

Ran GTPáza. je v jádře ve formě Ran-GDP. je v jádře ve formě Ran-GTP. je v cytosolu ve formě Ran-GTP. je v cytosolu ve formě Ran-GDP. GEF je na cytosolické straně póru. jako GAP se asociuje s euchromatinem.

Lipidy se podílejí na sortingu do váčků. Který z nich především. cholesterol. sfingosin. fosfatidylinositol. fosfatidylethanolamin. fosfatidylcholin.

Laminy. A a B se vytváří alternativním sestřihem. B neexistuje v embryu. na C-konci jsou isoprenylovány. A a C se vytvářejí alternativním sestřihem. fibrózní proteiny se strukturální a transkripční funkcí v jádře buňky. lamin A a B vznikají z jednoho transkriptu. vyskytují se u všech eukaryot. lamin B není v embryonálních buňkách. na C-konci mají izoprenylovou kotvu.

Co působí jako inhibitor Na+/K+ATPázy?. rotenon. digitoxin. ouabain. botulotoxin. aflatoxin. tetanotoxin.

Špatně sbalené proteiny v ER: co se s nimi děje?. zůstávají v ER. váže se na ně kalretikulin a kalcineurin. jsou odbourávány ERAD dráhou. jsou degradovány proteázami sídlícími v ER.

Proti nádoru působí. vrozená imunita. získaná imunita. cytotoxické T-lymfocyty.

F1-podjednotka bakteriální ATP-syntázy. je tvořena podjednotkami a, b, c. je tvořena podjednotkami alfa, beta, gama, delta a epsilon v poměru 1:1:1:3:3. Alfa a Beta je v poměru 3:1 vůči ostatním. je rotorem. je statorem. α, β , γ, δ, a ε podjednotky.

Cholesterol. polární část tvoří karboxylová skupina. zvyšuje rigiditu membrán. společně se sfingolipidy se vyskytuje v membránových raftech ve zvýšené koncentraci. stejně jako fosfatidylserin se vyskytuje hlavně ve vnějším listu membrány.

Vnitřní organizace jádra. je členěná fosfolipidovou membránou. není členěná fosfolipidovou membránou. uprostřed jádra je euchromatin.

Transportní váčky. COPII se uplatňují v retrográdním transportu. clathrinové se uplatňují v endocytóze. COPI v anterográdním transportu. COPI využívají GTPázu ARF1.

Jak je nazýván prostor mezi membránami jádra?. perinukleární. periplazmatický. internukleární.

Onkogeny. geny s s potenciálem způsobení rakoviny. vznik změnou exprese nebo jinou změnou protoonkogenů. transformace genů pro proteiny ovlivňující růst a diferenciaci buněk. je to dominantní změna.

Jaká je úloha mitochondrií při apoptóze?. uvolňují cytochrom c. tvoří apoptozom.

CFTR (cystic fibrosis transmembrane conductance regulator). je ABC přenašeč. pro přenos Na+. pro přenos Cl-.

Acetylcholinový receptor muskarinového typu. je spojen s trimérním G-proteinem. je spojen s receptorem nikotinového typu.

Jaderná membrána. je dvojitá. vnější a vnitřní membrána jsou propojeny jadernými póry. obě membrány jsou propojeny s lumen endoplazmatického retikula.

SKL se nachází. na N-konci. na C-konci.

Dávivý kašel (= černý kašel, pertussis) zapřičiňuje. AB5 toxin. Botulotoxin. AD2 toxin.

Jak se tvoří CopII váčky. Vazba na G protein ARF, pak sec. Vazba na Sar1, pak navázání Sec23, Sec24, Sec31, Sec13.

Sirtuiny. se účastní se regulace metabolismu. mají deacetylázovou aktivitu. mají jinou enzymatickou aktivitu.