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Title of test: quiz Description: info tot Author: me Other tests from this author Creation Date: 06/02/2025 Category: Computers Number of questions: 506

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Qual è l’utilizzo principale delle matrici BLOSUM? Confrontare sequenze di DNA umano Identificare mutazioni nei geni Allineare proteine con gradi di similarità evolutiva diversi . Qual è la funzione delle tecniche di classificazione? Prevedere l’esito di un evento futuro Rappresentare variabili qualitative Assegnare le unità a categorie predefinite. Qual è la differenza tra un database primario e secondario? I database primari archiviano solo sequenze RNA, i secondari solo proteiche I database primari usano solo dati teorici, i secondari sperimentali I database primari archiviano risultati sperimentali, i secondari dati analizzati. In un VIP score, cosa indica un valore inferiore a 1? Variabili altamente informative Variabili prive di varianza Variabili meno influenti per la classificazione. Cosa descrive la bioinformatica come scienza interdisciplinare? L'integrazione di matematica e fisica La fusione di genetica e linguistica La collaborazione tra biologi, informatici e ingegneri. Qual è il ruolo degli indici locali in HISAT2? Gestire varianti genomiche Determinare splicing alternativo Accelerare il sequenziamento . Qual è la differenza tra un t-test a varianza sconosciuta ma uguale e dissimile? La varianza sconosciuta non influisce sul test Il test con varianza dissimile considera una deviazione standard diversa per ogni gruppo La varianza uguale è usata solo con campioni appaiati. Cosa si intende per linguaggio di programmazione di alto livello? Un linguaggio orientato alla macchina Un linguaggio vicino alla logica umana Un linguaggio utilizzabile solo dagli esperti. Qual è l'obiettivo principale dell'indice FM creato da HISAT2? Sequenziare trascritti non noti Normalizzare reads allineate Ottimizzare la ricerca di pattern nel genoma. Quale rappresentazione grafica è più adatta per una tabella di contingenza? Colonne in pila Grafico a barre non errore sperimentale Diagramma a dispersione. Che cos'è la bioinformatica? La scienza che si occupa di modificare le strutture delle proteine Lo studio delle strutture tridimensionali delle proteine La scienza dell’archiviazione e analisi di grandi quantità di dati biologici . Qual è la funzione della memoria cache in un computer? Espandere la capacità della memoria ROM Accelerare l'accesso ai dati utilizzati di frequente Memorizzare programmi in esecuzione. Cosa rappresenta il coefficiente di probabilità in una distribuzione normale standardizzata? L'area sottesa alla curva per un dato intervallo Il valore massimo di Z La deviazione standard della distribuzione. Qual è un parametro essenziale per determinare la significatività statistica? Numero di geni totali p-value Sequenziamento di RNA totale. La deviazione standard è: La radice quadrata della varianza La media delle differenze assolute rispetto alla media La media delle osservazioni di una distribuzione. In quale contesto è utile la distanza euclidea? Quando i dati hanno distribuzioni molto diverse rispetto alla media cumulativa Per misurare l'entità delle differenze tra oggetti della stessa categoria Quando le variabili sono correlate e godono della reciprocità. Cos'è un autovettore in PCA? Una direzione che rappresenta una componente principale Una variabile indipendente Una media dei dati. Cosa rappresenta il codice ASCII in informatica? Un codice per la gestione delle operazioni di rete a valori numerici Un codice per associare caratteri alfanumerici a valori numerici Un codice per memorizzare numeri binari. Che cos'è una variabile in un algoritmo? un insieme di istruzioni Una quantità fissa che non cambia durante l'esecuzione Un identificatore che può contenere valori diversi durante l'esecuzione. Il coefficiente di determinazione può assumere valori compresi tra: 0 e 100 0 e 1 -1 e 1. Che cos’è l’algoritmo di allineamento Needleman-Wunsch? Un algoritmo per trovare regioni di somiglianza locale Un algoritmo di allineamento per confrontare sequenze con metodistatistici Un algoritmo per l’allineamento globale di due sequenze. In un dendrogramma, cosa rappresenta l'altezza di ogni nodo? Il valore medio delle osservazioni in un cluster La frequenza delle osservazioni in ogni cluster La somiglianza o distanza tra i cluster fusi. Quale caratteristica distingue i database primari dai secondari? Sono curati per coerenza Contengono dati sperimentali grezzi I dati derivano da analisi manuali. Cos'è una funzione in programmazione? Una struttura che memorizza variabili Una variabile usata per calcoli matematici Un blocco di codice riutilizzabile che esegue un compito specifico. Cosa rappresenta la tecnica di rotazione in PCA? Aumentare la varianza Ridurre i cluster Trovare direzioni di massima variabilità. Perché la matrice di conteggio necessita di normalizzazione? Per confrontare correttamente i livelli di espressione genica Per ridurre il numero di geni analizzati Per identificare trascritti non codificanti. Perché il trimming delle reads è necessario nell'RNA-Seq? Eliminare mRNA non codificanti Allineare i frammenti direttamente al DNA Rimuovere nucleotidi a bassa qualità. Quale linguaggio di programmazione è tipicamente utilizzato per analisi numeriche e statistiche? R HTML SQL. Qual è la funzione di una matrice di sostituzione? Assegnare punteggi alle sostituzioni di residui in un allineamento Calcolare la lunghezza delle sequenze proteiche per un allineamento ottimale Confrontare polimorfismi in una popolazione per trovare tutti i sostituenti possibili. In una regressione lineare, un valore di R² basso indica che: Il modello è altamente predittivo Il modello spiega completamente i dati Il modello spiega poca variabilità dei dati. Qual è la differenza principale tra linguaggi di alto livello e linguaggi di basso livello? I linguaggi di basso livello sono più portabili tra sistemi diversi I linguaggi di alto livello sono più vicini al linguaggio umano I linguaggi di basso livello sono più facili da leggere per i non esperti. Qual è la principale applicazione dell'analisi differenziale dell'espressione genica? Ricavare mutazioni nel genoma Identificare geni sovra- o sotto-espressi Sequenziare trascritti non noti. Qual è la funzione della tabella delle occorrenze nella trasformata BWT? Determinare la posizione dei caratteri originali Calcolare la percentuale di GC Mappare le reads sul genoma di riferimento . In un Volcano Plot, l'asse Y rappresenta: Il logaritmo in base 10 del p-value Il logaritmo negativo del fold-change Il logaritmo negativo del p-value. Qual è lo scopo del grafico 'Per base N content' in FastQC? Calcolare la lunghezza media dei frammenti Identificare basi non assegnabili nelle reads Misurare la distribuzione del contenuto di GC. Qual è lo scopo principale della tecnica OPLS-DA? Migliorare la separazione tra classi rimuovendo la variabilità ortogonale Identificare valori estremi in un dataset Eliminare le osservazioni con varianza maggiore . Qual è la definizione di un array? Un insieme di record Un insieme ordinato di valori Un insieme di variabili. Qual è il principale output prodotto da FastQC? Liste di reads allineate Dati di trascritti annotati Grafici per la valutazione della qualità delle reads. Qual è l'unità di misura utilizzata per indicare la velocità di trasmissione dati in rete? Bit al secondo Byte al secondo Kilobyte al secondo. In una rete a varianza di scala, quale caratteristica hanno i nodi hub? Non hanno connessioni dirette con altri nodi Sono altamente connessioni rispetto agli altri nodi Hanno un grado costante basso. Cosa indica il valore p in un test statistico? La probabilità di ottenere un risultato uguale o più estremo rispetto all’osservato, se l'ipotesi nulla è vera La probabilità di ottenere un risultato uguale o più estremo rispetto all’osservato, se l'ipotesi nulla è falsa La probabilità di ottenere un risultato uguale o più estremo rispetto all’osservato, se l'ipotesi nulla e quella alternativa coincidono. Che cosa rappresenta una curva ROC in un test diagnostico? La media dei valori di sensibilità e specificità La relazione tra tasso di veri positivi e tasso di falsi positivi La deviazione standard della specificità. Qual è la funzione della normalizzazione in un dataset? Ridurre il numero di osservazioni Aumentare la varianza dei dati Mettere i dati su una scala comune per facilitarne il confronto . Qual è il ruolo di un sistema operativo? Eseguire esclusivamente programmi di videoscrittura Gestire le risorse hardware e software del computer Convertire i linguaggi di programmazione. Qual è il ruolo dell'analisi di arricchimento GO? Identificare geni differenzia mente espressi Sequenziare direttamente l’intero genoma Collegare i geni espressi a funzioni biologiche. Qual è la missione principale di EMBL-EBI? Sequenziare il genoma umano e archiviare i dati per la medicina di precisione Studiare esclusivamente l'epigenetica Fornire risorse bioinformatiche per la comunità scientifica. Cos’è un SNP? Una struttura secondaria di RNA Un errore che causa malattie in tutti gli individui Una variazione di singolo nucleotide nel DNA. Come si comportano le reti casuali rispetto alla distribuzione di grado? La distribuzione di grado è invariante alla scala Non hanno una distribuzione di grado definita La distribuzione di grado segue una distribuzione di Poisson. Qual è il ruolo di un driver nel contesto del sistema operativo? Eseguire programmi applicativi Permettere l'uso di periferiche specifiche Fornire accesso diretto alla RAM. Quale struttura conserva il genoma umano? DNA Cromatidi Ribosomi . Che cosa rappresenta il range di una distribuzione? La media della distribuzione La differenza tra il valore massimo e il valore minimo La somma di tutte le frequenze. Che cos'è un file? Una memoria temporanea del sistema Un insieme ordinato di dati memorizzabili come unità Un programma che esegue operazioni su dati. Che cos’è un campione? Un sottoinsieme di unità estratto dalla popolazione La modalità con cui si manifesta una caratteristica L’intero insieme di unità di una popolazione. Quale software è stato il primo ad essere utilizzato per assemblare sequenze proteiche? IBM 7090 BLAST FASTA. Quale database è specifico per le espressioni geniche? Uniprot GenBank GEO (Gene Expression Omnibus). Quale elemento è essenziale per l'analisi di network molecolari? Strutture tridimensionali Mutazioni genetiche Interazioni proteina-proteina. Cosa rappresenta un nodo in un dendrogramma? Il punto di connessione tra rami che rappresenta una divisione tra variabili Il punto di connessione tra rami che rappresenta una divisione tra gruppi Il punto di connessione tra rami che rappresenta una divisione tra campioni. Qual è la caratteristica distintiva di una distribuzione normale? Ha media, mediana e moda coincidenti È asimmetrica Ha due picchi principali. Quando si ottiene la distanza euclidea utilizzando la distanza di Minkowski? Quando il parametro p è 2 Quando il parametro p è 3 Quando il parametro p è 1. La distribuzione normale è spesso utilizzata in statistica perché: È l’unica distribuzione simmetrica Molti fenomeni naturali seguono questa distribuzione È una distribuzione discreta. In un sistema di gestione di database relazionali, cosa consente l'operatore 'JOIN'? Sommare i valori di un attributo Combinare attributi identici da due tabelle Estrarre solo i record unici da una tabella. Qual è il compito principale della CPU in un computer? Gestire la rete per i calcolatori binari Eseguire operazioni di calcolo Memorizzare dati su cui eseguire i calcoli. Cosa rappresenta un dendrogramma? La varianza dei dati La media dei campioni La struttura di raggruppamento gerarchico tra oggetti. Qual è il termine che descrive il confronto tra sequenze biologiche per identificare somiglianze? Analisi Allineamento Archiviazione. Qual è il vantaggio di utilizzare la mediana invece della media? La mediana è calcolata più velocemente della media La mediana non è influenzata dai valori estremi La mediana fornisce sempre un valore più alto . Cos'è la probabilità cumulativa in una distribuzione normale? La somma delle medie dei dati La probabilità totale della distribuzione La probabilità che un valore sia minore o uguale a un certo punto. Qual è l’obiettivo di un allineamento globale disequenze? Analizzare solo regioni locali simili Confrontare interamente due sequenze per trovare somiglianze Identificare varianti di polimorfismo. Quale tecnica utilizza l'algoritmo Smith-Waterman? Tracciamento filogenetico Analisi globale Allineamento locale. Qual è il significato del Teorema del Limite Centrale? Le variabili di un campione hanno sempre una distribuzione normale La distribuzione delle medie campionarie tende a una distribuzione normale con campioni sufficientemente grandi Ogni distribuzione può essere trasformata in una distribuzione normale attraverso una trasformazione logaritmica. Quale programma è progettato per analizzare trascrizioni e identificare geni? CLUSTAL SPLIGN Needleman-Wunsch. Che cosa rappresenta un polimorfismo SNP? Una sequenza di DNA presente solo in specie diverse Una variazione della struttura proteica dovuta a mutazioni multiple Una variazione di singolo nucleotide comune in una popolazione. In SQL, quale comando viene utilizzato per aggiornare i dati esistenti in una tabella? DELETE UPDATE INSERT. Qual è la matrice usata per calcolare punteggi di sostituzione in allineamenti proteici? GAPM BLOSUM62 PAM250. In sPLS, qual è il vantaggio della selezione delle variabili? Aumenta il numero di cluster Riduce il rumore mantenendo solo le variabili informative Elimina tutte le variabili. Qual è un limite dell’algoritmo K-means? Non funziona con variabili quantitative È influenzato notevolmente da eventuali variabili outlier Il numero di cluster deve essere definito a priori. Qual è l’obiettivo di un compilatore? Gestire l’hardware di un computer Tradurre il codice sorgente in linguaggio macchina Interpretare il codice durante l’esecuzione. Quando si usa la distribuzione t Student? Solo per campioni formati da almeno 30 unità statistiche Per piccoli campioni con varianza ignota Quando la varianza della popolazione è nota . Cos'è una componente principale (PC) in PCA? Una combinazione lineare di variabili originali che massimizza la varianza Un vettore che rappresenta una variabile originale Un coefficiente che descrive la correlazione tra variabili. Che cosa rappresenta la moda in una distribuzione? Il valore più frequente in un dataset Il punto centrale di un intervallo di dati La somma di tutti i valori divisa per il numero di osservazioni. La varianza misura: La somma dei valori della distribuzione La dispersione dei dati rispetto alla media La differenza tra il valore massimo e minimo. Quale tecnica utilizza un approccio euristico per ridurre i tempi di calcolo degli allineamenti? FastQ Clustal Omega BLAST. Come si definisce la densità di una rete? Il numero di link connessi ai nodi principali La somma dei gradi di tutti i nodi Il rapporto tra il numero effettivo di link e il numero massimo possibile di link. Qual è la struttura dati utilizzata per velocizzare la ricerca nei database genomici? Albero binario Tabella hash Lista collegata. Quale mutazione coinvolge lo scambio di una purina con una pirimidina? Transizione Trasversione Inversione. Qual è la funzione del comando 'build' in Bowtie? Normalizzare dati RNA-Seq Creare l'indice del genoma di riferimento Analizzare bias di sequenziamento. Quale organizzazione ha coniato il termine “bioinformatica”? Paulien Hogeweg e Ben Hesper EMBL National Institutes of Health. Quale tipo di memoria può essere solo letta e non modificabile dall’utente? RAM Cache ROM. Che cos’è un linguaggio SQL? Un linguaggio di basso livello per la programmazione di sistema Un linguaggio per la creazione di siti web Un linguaggio per la gestione di gestione di database relazionali. In un’analisi PLS, che cosa rappresenta la Q2Y? La somma dei quadrati delle deviazioni La capacità predittiva del modello La varianza spiegata delle variabili predittiva. Che cosa rappresenta l’area sotto la curva di una distribuzione normale? La media della popolazione La probabilità cumulativa di eventi Il valore massimo della distribuzione. Quale algoritmo è ottimizzato per identificare splicing alternativo? HISAT2 Bowtie STAR. Qual è la definizione di curtosi? La misura di quanto una distribuzione sia appuntita o piatta rispetto alla normale La frequenza della moda di un dataset La media delle deviazioni dalla mediana. Qual è la caratteristica delle reti a invarianza di scala? Hanno molti nodi con basso grado e pochi hub con alto grado Hanno tutti i nodi con lo stesso grado Seguono una distribuzione di Poisson. Cos'è la normalizzazione per somma? Moltiplicare ogni valore per un fattore costante Sottrarre la media di ogni variabile Dividere ogni valore per la somma totale del campione per ridurre le differenze di scala. In quale tipo di memoria viene solitamente caricato il malware? Cache RAM ROM. Quale dei seguenti strumenti statistici automatizza i calcoli delle probabilità? Grafici a torta Tavole Z Software come R ed Excel. Qual è la funzione del Volcano Plot in biostatistica? Identificare rapidamente cambiamenti significativi in esperimenti tra due gruppi Mostrare la correlazione tra variabili Determinare il valore mediano di una variabile. A cosa serve l’analisi filogenetica in bioinformatica? Confrontare i polimorfismi genetici Prevedere la struttura di acidi nucleici Tracciare le relazioni evolutive tra specie. Che cosa rappresenta l’allineamento globale di due sequenze? Un confronto limitato alle regioni simili Solo le regioni con differenze rilevanti Un confronto su tutta la lunghezza delle sequenze. Quale fenomeno è alla base delle variazioni genetiche dei genomi? Mutazione Crossing over Polimorfismo . In quale situazione si usa un grafico a torta? Per mostrare la distribuzione di frequenza di una variabile quantitativa Per rappresentare una serie temporale Per rappresentare le percentuali di una variabile qualitativa. A cosa serve il database dbSNP? Archiviare sequenze di DNA procariotico appartenente al clade SNP Archiviare varianti di singolo nucleotide (SNP) Confrontare sequenze proteiche tra organismi dotati di SNP consolidati. Come si chiama una rete in cui i link non indicano una direzione specifica? Rete non orientata Rete ponderata Rete orientata. Qual è la funzione principale del sistema operativo? Gestire le risorse hardware e software Memorizzare dati in modo permanente Eseguire calcoli complessi. Quale è il principale vantaggio dell'uso di Bowtie per l'allineamento delle sequenze? Garantire allineamenti globali precisi Velocità ed efficienza nella gestione di grandi dataset Rilevare trascritti non codificanti per mappatura senza genoma di riferimento . Qual è la formula della deviazione standard della media? σ2/nσ2/n s/ns/n σ/√n. Quale struttura conserva il genoma umano? DNA Cromatidi Ribosomi. Qual è la tecnica di mappatura che utilizza la tabella hash per confrontare sequenze? MegaBLAST SPLIGN BLAT. In informatica, cosa rappresenta la complessità computazionale di un algoritmo? Il numero di istruzioni eseguite durante l’esecuzione Il tempo di esecuzione in funzione della dimensione dell'input La quantità di memoria RAM utilizzata durante l'esecuzione. Quale parametro statistico indica la probabilità che un allineamento sia casuale? Percent identity Query Coverage E-value. Che cosa rappresenta il livello di significatività in un test statistico? La probabilità di rifiutare l'ipotesi alternativa quando è vera La probabilità di rifiutare l’ipotesi nulla quando è vera La probabilità di accettare l’ipotesi nulla quando è vera. Che cos'è un database relazionale? Un sistema che organizza i dati in tabelle correlate tra loro Un sistema di memorizzazione senza struttura Un sistema di archiviazione sequenziale di file. Chi ha sviluppato il metodo di sequenziamento del DNA che ha rivoluzionato la genomica? Allan Maxam Kary Mullis Frederick Sanger. Quale analisi determina relazioni evolutive tra organismi? Filogenesi molecolare Sequenziamento Analisi funzionale. Qual è il principale obiettivo di un allineamento multiplo? Predire sequenze sconosciute Calcolare la densità della rete Identificare regioni conservate. Quale parametro di un test diagnostico si migliora principalmente aumentando il cut-off del ROC? Accuratezza complessiva Specificità Sensibilità. Qual è la funzione dei quartili in una distribuzione? Dividere i dati in quattro parti uguali per analizzare la distribuzione centrale e quella esterna Trovare la moda della distribuzione Indicare la frequenza cumulativa dei dati. Quale dei seguenti elementi non è una caratteristica di un linguaggio di programmazione? Alfabetico Grammatica Firmware. Qual è l'obiettivo dell'allineamento tra sequenze? Trovare somiglianze per identificare funzioni simili Confrontare sequenze per trovare regioni con funzioni simili Cambiare la sequenza genetica per migliorare la funzione. Quale tipo di RNA è coinvolto nella regolazione post-trascrizionale? miRNA tRNA rRNA. Quale tipo di mutazione coinvolge un cambiamento puntuale in una sequenza? Delezione Inserzione Transizione. In un modello PLS, T e U rappresentano: Valori casuali Deviazioni standard Componenti latenti di X e Y. Qual è lo scopo di un database primario? Archiviare dati sperimentali come sequenze nucleotidiche Conservare solo sulle proteine di primati Contenere dati derivati dall'analisi dei dati primari. Qual è il significato della mediana in un insieme di dati? È la somma di tutti i valori divisa per il numero di osservazioni È il valore che appare più frequentemente È il valore che divide i dati in due metà uguali. Perché è importante scegliere la giusta metrica di distanza in Cluster Analysis? Determina le unità di misura dei cluster Influenza il raggruppamento e la somiglianza tra oggetti Per stabilire a priori gli oggetti da porre nello stesso raggruppamento. Quale dei seguenti grafici è adatto per rappresentare una variabile quantitativa continua? Grafico a torta Diagramma a barre Istogramma. Qual è la principale differenza tra mutazione e polimorfismo? Il polimorfismo raggiunge almeno l'1% nella popolazione La mutazione è comune nella popolazione Il polimorfismo causa solo le inserzioni. Quale parametro influenza maggiormente la sensibilità di Bowtie? Numero massimo di mismatch consentiti Percentuale di GC Numero di reads totali. Che cos'è una rete orientata? Una rete in cui non ci sono collegamenti Una rete in cui i link indicano una direzione specifica tra due nodi Una rete in cui tutti i link hanno lo stesso peso. Quale problema è evidenziato da un elevato tasso di duplicazione nei grafici di FastQC? Bassa qualità delle reads Errori di splicing Sovra rappresentazione di sequenze. Cos'è un VIP score in PLS-DA? Un indice di dispersione delle variabili più importanti Un punteggio che indica l'importanza delle variabili per la classificazione Una misura della media delle variabili più importanti che determinano l'esistenza di classi . Quale database contiene dati funzionali genomici? Reactome GEO GenBank. Il campionamento casuale semplice si effettua: Con un metodo che garantisce la casualità delle estrazioni Usando un criterio di praticità Estraendo unità della popolazione a intervalli regolari. Che cosa si intende per traslazione in PCA? Aumentare la scala delle variabili Eliminare le variabili con bassa varianza Spostare i dati in modo che il centroide sia all'origine degli assi. Qual è l'obiettivo principale della normalizzazione in un database relazionale? Espandere la memoria del database Aumentare la velocità di elaborazione Minimizzare la ridondanza dei dati. Quale software è utilizzato per predire domini proteici? InterPro Entrez GeneMapper. A cosa serve una matrice BLOSUM in bioinformatica? Identificare sequenze proteiche per organismi specifici Calcolare la struttura tridimensionale delle proteine Valutare somiglianze tra proteine evolutivamente distanti. In quale situazione è utile l'uso della sPLS? Quando si conoscono a priori le relazioni tra variabili Quando il dataset ha molte variabili e solo un sottoinsieme è rilevante Quando tutte le variabili sono fortemente correlate. Qual è la caratteristica principale della distanza euclidea? Calcola la somma dei valori assoluti delle differenze tra punti È la distanza 'in linea retta' tra due punti in uno spazio multidimensionale È una distanza basata solo sulle coordinate positive. Qual è il principale vantaggio di un multi-allineamento progressivo? Riduce i tempi di calcolo Evita l'uso di gap Aumenta la precisione. Qual è la funzione della deviazione standard in una distribuzione normale? Misura la dispersione dei dati attorno alla media Indica il numero di osservazioni della popolazione Determina il valore centrale della distribuzione. Quale dei seguenti intervalli rappresenta un coefficiente di probabilità del 99,9%? Tra -2,58 e 2,58 Tra -3,29 e 3,29 Tra -1,96 e 1,96 . In quale situazione è utile la procedura di Benjamini-Hochberg? Per aumentare il numero di falsi negativi Per eliminare la necessità di normalizzazione in caso di test multipli Per controllare il tasso di falsi positivi (False Discovery Rate) . Come viene definito un insieme ordinato di informazioni memorizzabili o processabili come unità? Variabile File Array. Che cos'è il coefficiente di clustering in una rete? La misura della distanza tra due nodi La probabilità che due nodi connessi a un altro nodo siano connessi fra di loro La somma dei link in una rete. Qual è il vantaggio del Pareto scaling? Aumenta l'influenza delle variabili con alta varianza Riduce l'influenza delle variabili con alta varianza Riduce l'influenza delle variabili con bassa varianza. Qual è il compito di un programma applicativo? Gestire direttamente l'hardware del computer Fornire accesso ai componenti del sistema operativo Svolgere attività specifiche per l'utente, come la videoscrittura. Cosa significa «tagliare» un dendrogramma? Dividere il dendrogramma nel numero minimo di cluster Separare le variabili tra di loro Dividere il dendrogramma in un numero desiderato di cluster. Quando si utilizza l'analisi sPLS-DA? Per ridurre la varianza tra i gruppi senza selezione delle variabili Per testare l'indipendenza tra variabili Perselezionare un numero limitato di variabili rilevanti per la classificazione. Qual è il database dedicato ai polimorfismi a singolo nucleotide? dbSNP GeneBank RefSeq. Quale matrice è utilizzata per calcolare punteggi di sostituzione in proteine? PAM1 BLOSUM62 GAPM. Che cosa misura l'accuratezza di un test diagnostico? La probabilità che un risultato positivo sia errato La capacità del test di evitare qualsiasi errore di misura La capacità del test di distinguere correttamente tra veri positivi e negativi. Qual è l'operazione principale dell'operatore 'SELECT' in SQL? Creare una nuova tabella Rimuovere solo i campi ripetuti Estrarre righe specifiche da una tabella . Quando si utilizza un paired t-test? Quando si confrontano campioni indipendenti tra loro Quando si confrontano le differenze all'interno dello stesso gruppo in due condizioni Quando si ha una varianza nota. Qual è il nome della distribuzione normale con parametri µ = 0 e σ = 1? Distribuzione normale standardizzata Distribuzione normale simmetrica Distribuzione di Gauss. Qual è l'intervallo di valori per Z nella distribuzione normale standardizzata che rappresenta il 90%? Tra -1,96 e 1,96 Tra -1,65 e 1,65 Tra -2,58 e 2,58. Qual è il vantaggio principale della rappresentazione compressa nella trasformata BWT? Conservare tutte le informazioni sul genoma Facilitare la ricerca e l’allineamento Ridurre il numero di trascritti analizzati. Qual è il database primario per sequenze nucleotidiche? Protein Data Bank ENA UniProt. Quale database include annotazioni di proteine curate? Swissprot NRSeq RefSeq. Quale ruolo ha un gap in un allineamento? Introduce uno spazio per ottimizzare il confronto tra sequenze Aggiunge un nucleotide mancante alla sequenza per consentire l'allineamento Accelera il processo di allineamento rendendolo possibile il confronto. Qual è il significato del parametro μ in una distribuzione normale? È la dispersione dei dati attorno al valore centrale È la media della distribuzione È il valore massimo della curva. Qual è il ruolo principale della tabella FM nella trasformata BWT? Sequenziare RNA non codificanti Correggere errori di sequenziamento Accelerare la ricerca di pattern nelle sequenze. Qual è il ruolo principale dell'RNA Editing? Sintetizzare nuove molecole di DNA Tradurre RNA in proteine Modificare la sequenza primaria dell'RNA. In quale formato viene rappresentata l'informazione all'interno di un computer? Sistema binario Sistema decimale Sistema ottale. In un linguaggio di programmazione, cos'è una stringa? Una variabile che contiene solo numeri Una sequenza di caratteri alfanumerici Un tipo di dato booleano. Qual è la definizione corretta di una variabile? Un insieme di valori ordinati che può cambiare durante l'esecuzione Un valore costante non modificabile Una coppia nome-valore che può cambiare durante l'esecuzione. Qual è il formato di file consente di rappresentare sequenze con punteggi di qualità? BED GFF FASTQ. Qual è un indicatore chiave per valutare bias di sequenziamento nei grafici di FastQC? Lunghezza dei frammenti Conteggio delle reads Squilibrio nel contenuto di basi . Che cos'è un cammino minimo in una rete? La connessione tra nodi con lo stesso grado Un circuito che si auto-alimenta Il percorso con il minor numero di link che collega due nodi. Quando si utilizza un test a due code? Quando si vuole verificare se c'è una differenza in entrambe le direzioni tra le medie di due gruppi Quando si confronta una media con un valore noto Quando si vuole solo identificare aumenti di media. Qual è il principale metodo per identificare geni differenzialmente espressi? Normalizzazione TPM Analisi statistica Sequenziamento de novo. Quale parametro è essenziale per interpretare i risultati di FastQC? Percentuale di mismatch Distribuzione della qualità lungo le reads Lunghezza del trascritto. Che cosa indica il terzo quartile in una distribuzione? La media della distribuzione Il valore al di sotto del quale si trova il 75% delle osservazioni Il valore più frequente nella distribuzione. In un test diagnostico, cosa rappresenta un alto valore dispecificità? Una riduzione della sensibilità Una maggiore probabilità di identificare i falsi positivi Una maggiore capacità di identificare correttamente i veri negativi. Cosa indica una sensibilità del 100% in una analisi ROC? Nessun vero negativo Nessun falso negativo Nessun falso positivo. Come si chiama una distribuzione normale con media 0 e varianza 1? Distribuzione normale standardizzata Distribuzione normale centrata Distribuzione normale unitaria. Qual è l'obiettivo principale della PLS-DA? Ridurre la varianza dei dati Classificare variabili continue Separare le classi in base alla variabilità correlata a Y. Quale approccio si basa su somiglianze evolutive per analizzare sequenze proteiche? Modelli teorici Matrici di sostituzione Analisi tridimensionale. Cosa si intende per Family Wise Error Rate (FWER)? La frequenza con cuisi osservano errori di tipo II La probabilità di ottenere almeno un falso positivo in test multipli La media delle varianze delle variabili che determinano i falsi positivi. Qual è il principale vantaggio del paired-end rispetto al single-end? Maggior quantità di reads Informazioni aggiuntive su varianti Maggiore costo. Qual è l'unità utilizzata per misurare la lunghezza di una sequenza nucleotidica? Mbp bp Kb. In una matrice delle adiacenze, cosa rappresenta il valore 0? Un link ponderato La presenza di un link tra due nodi L'assenza di un link tra due nodi . Qual è il principale obiettivo della procedura di trimming? Eliminare basi di bassa qualità Rimuovere reads duplicate Sequenziare RNA alternativi . Qual è una caratteristica del clustering gerarchico? Utilizza sempre matrici di distanza Suddivide in gruppi sulla base di definizione Raggruppa osservazioni senza membri. Qual è il vantaggio principale dell'uso della distanza di correlazione di Pearson nel clustering? È sensibile all’ampiezza dei valori Ignora l’ampiezza dei valori e si concentra sulle tendenze Si applica solo a variabili qualitative. Come si chiama il test statistico per confrontare due medie campionarie indipendenti? t-test ANOVA Test . Qual è il vantaggio principale dell'indice FM creato da HISAT2? Ottimizzare la ricerca di pattern nel genoma Sequenziare trascritti non noti Normalizzare reads allineate. Qual è il parametro tipico di una rete biologica complessa? Numero di varianti SNP Coefficiente di clustering Lunghezza della sequenza. Qual è lo scopo del clustering nei dati biostatistici? Aumentare la variabilità tra gruppi Ridurre il numero totale di osservazioni Riconoscere pattern simili per raggruppare campioni o variabili correlati. Cosa indica la presenza di tre asterischi (***) in un grafico? p-value < 0,05 p-value < 0,01 p-value < 0,001. Qual è un vantaggio del sequenziamento RNA-Seq rispetto ai microarray? Costo inferiore e semplicità Maggiore sensibilità e precisione Meno dipendenza dal design sperimentale. Qual è l'utilità della trasformata di Burrows-Wheeler nella bioinformatica? Analizzare l'espressione genica Comprimere e indicizzare sequenze genomiche Generare reads RNA-Seq . Qual è lo scopo della normalizzazione per somma in analisi multivariata? Rimuovere le differenze di scala tra i campioni Ridurre la varianza tra i campioni Uniformare l'unità di misura tra variabili. Nella PLS-DA, qual è il significato di Q2Y? Capacità predittiva del modello Varianza spiegata Deviazione standard media. Qual è l'obiettivo principale della Cluster Analysis? Identificare gruppi di unità statistiche con caratteristiche distintive Identificare gruppi di unità statistiche con valori di frequenza simili Ridurre il numero di variabili in un dataset. Qual è il tipo di RNA che lega i ribosomi durante la traduzione? mRNA tRNA rRNA. In che modo l’aumento della numerosità campionaria influisce su un test? Aumenta la potenza del test Aumenta l’accuratezza del test Riduce il p-value . Qual è una caratteristica del clustering non gerarchico? Utilizza sempre una matrice di distanza Suddivide in gruppi sulla base di centroidi Raggruppa le osservazioni senza iterazioni. Qual è un’applicazione chiave della trascrittomica? Determinare la struttura dei ribosomi Sequenziare il genoma Identificare biomarcatori di malattie. Quale grafico di FastQC evidenzia la distribuzione dei valori di qualità lungo le reads? Per base sequence quality GC content Per base sequence content. In una distribuzione normale, i valori estremi sono: Più comuni dei valori centrali Meno frequenti dei valori centrali Equamente frequenti rispetto ai valori centrali. Qual è il ruolo della standardizzazione in statistica? Aumentare il numero di osservazioni Permettere il confronto di variabili con scale diverse Calcolare direttamente la varianza. In un test a due cose, cosa indica il valore critico? La sommatoria dei valori osservati diviso la radice quadrata della deviazione standard Il valore massimo del p-value che serve per accettare H0 se l’ipotesi alternativa è vera Il punto oltre il quale rifiutiamo H0 in entrambe le direzioni. Che cos’è un gap in un allineamento di sequenze? Una posizione vuota inserita per ottimizzare l’allineamento Una sovrapposizione tra due segmenti Un errore nella sequenza di dati. Qual è una caratteristica di un cluster in Cluster Analysis? Gli oggetti nel cluster sono dissimili tra loro I cluster sono sempre dello stesso tipo all’interno di un gruppo Gli oggetti nel cluster sono simili tra loro. Cosa rappresenta la distanza di Manhattan? La somma delle distanze al quadrato tra punti delle coordinate La somma delle distanze euclidee tra due punti La somma delle differenze assolute tra coordinate. Quale tipo di grafico FastQC identifica duplicati nei dati di sequenziamento? Sequence duplication levels Per base quality score GC distribution. In informatica, la complessità temporale di un algoritmo quantifica: Il numero di linee di codice di un programma La quantità di memoria richiesta durante l’esecuzione Il tempo necessario per eseguire un algoritmo in funzione della dimensione dell’imput. Perché il trascrittoma è importante per la biologia? Analizza esclusivamente gli esoni Riflette l’attività dinamica del genoma Mostra solo i geni regolatori. Qual è la principale caratteristica delle tecniche chemometriche? Possono predire la classificazione in classi sconosciute Richiedono esclusivamente dati qualitativi per essere efficaci Utilizzano metodistatistici per estrarre informazioni significative da dati complessi. Qual è la funzione principale della trascrittomica? Studiare l’intero insieme di RNA trascritti in un determinato momento Analizzare la struttura del DNA in diverse cellule Identificare solo gli mRNA codificanti. Qual è il metodo di sequenziamento in grado di raggiungere capacità di 10 Gbp/giorno? SOLiD Sequencing Illumina Sequencing Oxford Nanopore Sequencing. Cos’è un Biplot? Un plot che combina scores e loading in PCA Un grafico per dati categorici Una rappresentazione lineare . Qual è la differenza tra PCA e PL-SDA? La PCA è non supervisionata, mentre la PLS-DA è supervisionata per la classificazione Entrambe sono tecniche di riduzione dimensionale non supervisionate La PLS-DA è usata solo per dati categorici. Che cosa rappresenta la distanza di Minkowski? una distanza generalizzata che può essere adattata a distanza euclidea o Manhattan una misura della correlazione tra variabili continue la distanza tra i valori più estremi di due variabili. Qual è la funzione dell’analisi di arricchimento? Rimuovere dati non rilevanti da un database Identificare categorie funzionali arricchite nei dati Creare nuove sequenze da analizzare per arricchire i database secondari. Che tipo di operazione rappresenta l’unione nell’algebra relazionale? L’unione di tutte le tuple, eliminando eventuali duplicati L’unione di tutte le colonne di una tabella L’unione di attributi comuni tra due tabelle. Qual è la principale differenza tra RAM e ROM? La ROM è più veloce della RAM La RAM è volatile, mentre la ROM è permanente La RAM è usata solo per la memorizzazione temporanea del sistema operativo. Qual è una caratteristica distintiva dei microarray rispetto a RNA-Seq? Maggior range dinamico Alta precisione Dipendenza da conoscenze genomiche. Che cosa significa PCA in statistica? Proporzione delle componenti attese Predisposizione alla classificazione avanzata Principale component Analysis. Qual è l’area totale sotto una curva normale? 100 1 0,5. Che cosa si intende per iterazione in K-means? Ogni ciclo di assegnazione a ricalcolo dei centroidi L’assegnazione dei dati ai cluster senza ripetizioni Il calcolo della media di ciascun cluster. Cosa rappresenta l’errore standard della media (ESM)? La variabilità all’interno del campione La precisione della media campionaria come stima della media della popolazione Il valore medio dei campioni. In una curva normale, i punti di flesso si trovano: Aµ±2 σ Aµ±3 σ Aµ± σ. Quale tipo di grafico è utilizzato per rappresentare variabili quantitative? Istogramma Box plot Diagramma a barre . Qual è la caratteristica distintiva del ncRNA rispetto al mRNA? Trasporta aminoacidi ai ribosomi Dirige la sintesi proteica Non codifica proteine. Qual è lo scopo principale di un database secondario? Accettare nuove sequenze Organizzare dati derivati Conservare dati grezzi. Qual è la componente principale del genoma? DNA Proteine Lipidi. Cos’è la bioinformatica? L’archiviazione e analisi di dati biologici su larga scala Il sequenziamento delle proteine mediante computer SNP La manipolazione diretta dei geni in silico. Che cosa rappresenta un biomarcatore in biostatistica? Una variabile che descrive l’età media di una popolazione Un indicatore misurabile di uno stato o condizione biologica Un fattore casuale utilizzato per stimare la variabilità di un campione . Che cos’è una sequenza di DNA rappresenta in bp? Posizione basale Base primaria Coppia di basi . In OPLS, cosa si intende per componente ortogonale? Una variabile correlata a Y Una componente non correlata a y Un valore medio di X. In una rete non orientata, come appare la matrice delle adiacenze? Asimmetrica rispetto alla diagonale Simmetrica rispetto alla diagonale Ponderata con valori diversi da zero. Qual è la distribuzione di grado tipica di una rete casuale? Distribuzione a legge di potenza Distribuzione di Poisson Distribuzione normale. Perché è importante la normalizzazione nei dati multivariati? Rende le variabili confrontabili tra loro Aumenta la varianza Riduce la media. Quale algoritmo è ottimizzato per la mappatura di reads RNA-Seq? HISAT2 BWA CLUSTAL. Quale tipo di database contiene dati curati e derivati da analisi? Database primari Database secondari Database di struttura. Qual è la funzione principale del database PDB? Archivia strutture tridimensionali di proteine e acidi nucleici Archivia dati di espressione genica Archivia dati di sequenze nucleotidiche. Quando si utilizza la tecnica di clustering non supervisionata? Quando non si ha conoscenza a priori della struttura dei dati Quando si vogliono confrontare due variabili Quando i dati sono categorizzati in classi note. La differenza interquartile è utile per: Valutare la dispersione della metà centrale dei dati Misurare la simmetria di una distribuzione Rappresentare la tendenza centrale della distribuzione. Qual è il ruolo principale della Gene Set Enrichment Analysis (GSEA)? Isolare RNA non codificanti Identificare gruppi di geni arricchiti Determinare la quantità di RNA presente . Che cosa rappresenta una rete connessa? Una rete in cui esiste un cammino tra ogni coppia di nodi Una rete in cui i link sono diretti Una rete senza hub. Qual è l’importanza del database UniProt? Fornisce una collezione di strutture tridimensionali Archivia sequenze proteiche e informazioni funzionali Archivia varianti di acidi nucleici tra specie. In un test t per dati appaiati, H0 suggerisce che: C’è un errore del primo tipo nel campionamento Non c’è differenza significativa tra i dati C’è una differenza significativa tra i dati. Qual è l’unità minima di informazione in un computer? Bit Nibble Byte. Quale database contiene dati genomici? GEO Reactome GenBank. Che cos’è uno Scree Plot? Un grafico che mostra la varianza spiegata da ciascun campione Un grafico che mostra la varianza spiegata da ciascuna variabile Un grafico che mostra la varianza spiegata da ciascuna componente. Cosa rappresenta i loadings in un PCA? Le classi di appartenenza La media dei valori Il contributo di ciascuna variabile alla componente principale. Qual è il parametro chiave per confrontare geni tra due condizioni? Conteggio delle reads Log2FC (Fold Change) Numero totale di reads. Che cos’è una matrice delle adiacenze? Una rappresentazione grafica dei nodi e link di una rete Una tabella che mostra solo i nodi più importanti Una matrice quadrata che rappresenta la presenza o assenza di link tra nodi. Qual è lo scopo della statistica inferenziale? Descrivere e organizzare i dati Trarre conclusioni generali a partire dai dati campionari Raccogliere dati attraverso metodi di campionamento. Quale componente hardware è responsabile della temporizzazione delle operazioni di un computer? ROM RAM Clock. Cosa rappresenta la curva ROC? La media dei falsi positivi e veri negativi a diversi cut-off Il valore di accuratezza del test tramite la valutazione della AUC La relazione tra sensibilità e specificità a diversi cut-off. Quale rete biologica è caratterizzata da nodi altamente connessi? Rete casuale Rete a invarianza di scala Rete semplice. Cosa rappresenta l’area sotto la curva normale? Il 100% delle osservazioni Il 50% delle osservazioni La somma delle frequenza dei dati. Inche modo la PCA (Analisi delle Componenti Principali) aiuta nell'analisi dei dati? Aumenta il numero di variabili per analisi dettagliate Riduce le dimensioni mantenendo gran parte dell'informazione Classifica dati binari. Un byte è composto da quanti bit? 8 16 4. Quale valore di α è comunemente utilizzato nei test statistici? 0,0001 0,1 0,05. Quale tecnica di sequenziamento ha la capacità più alta di lettura al giorno? Sequenziamento Sanger Oxford Nanopore Sequencing 454 Pyrosequencing. Cosa indica un test a una coda? La possibilità di rifiutare H0 solo da una direzione La possibilità di rifiutare H0 in entrambe le direzioni La possibilità di ridurre la deviazione standard in una direzione. Quale dei seguenti è vero per la varianza campionaria? È sempre uguale alla varianza della popolazione È sempre più piccola della deviazione standard Viene calcolata con una correzione per piccoli campioni. Qual è lo scopo della statistica descrittiva? Descrivere e sintetizzare i dati osservati Verificare la validità di un modello statistico Formulare ipotesi sulle popolazioni basate su un campione. Che cosa si intende per errore standard della media? La media della varianza all'interno del campione La variabilità delle medie campionarie rispetto alla media della popolazione La media dei valori assoluti delle differenze dalla media . Quale tipo di distribuzione presenta due picchi principali? Distribuzione unimodale Distribuzione asimmetrica Distribuzione bimodale. Cosa significa un valore AUC di 1 in una curva ROC? Il test discrimina casualmente Il test è perfetto e non ha errori Il test non ha alcun valore informativo. Qual è il ruolo della trascrittasi inversa nella preparazione della libreria RNA-Seq? Amplificare frammenti di DNA Sequenziare direttamente il genoma Convertire l'RNA in cDNA. Cosa consente di fare un Dot Plot? Generare nuove sequenze Visualizzare somiglianze tra sequenze Identificare errori in sequenze. Qual è una caratteristica importante di un biomarcatore valido? Deve essere unico per ogni individuo specifico Deve cambiare frequentemente nel tempo in modo da creare una matrice confusione valida Deve avere alta sensibilità e specificità. Quale dei seguenti algoritmi è utilizzato per l'allineamento globale? Matcher BLAST Needleman-Wunsch. Qual è la funzione principale di un grafico box plot? Rappresentare la media aritmetica dei dati e la loro deviazione standard rispetto al range Visualizzare la distribuzione di frequenza di una variabile qualitativa Mostrare la distribuzione dei dati e identificare i valori estremi. .Quale parametro di rete descrive la probabilità che due nodi connessi a un altro nodo siano anch'essi connessi tra loro? Betweenness centrality Coefficiente di clustering Densità della rete. Qual è la differenza principale tra la statistica bivariata e quella univariata? La statistica univariata richiede sempre una matrice delle distanze La statistica bivariata analizza la relazione tra due variabili, mentre la univariata si focalizza su una sola La statistica bivariata utilizza solo dati categoriali. Qual è una delle applicazioni della Cluster Analysis in biologia? Classificare proteine o geni con funzioni simili Misurare la media di proteine in campioni Rappresentare la deviazione standard dei dati. Qual è la funzione principale dei “motif” in una rete? Indicare la direzione delle interazioni Rappresentare errori nelle connessioni Costituire pattern o sottografi con struttura ricorrente associati a funzioni biologiche . Qual è l'obiettivo principale dell'RNA-Seq? Isolare frammenti genomicispecifici Sequenziare direttamente le proteine Rivelare la quantità di RNA presente in un campione. Quale tecnologia ha reso il sequenziamento del DNA più veloce ed economico? Ion Torrent Illumina Sequencing Maxam-Gilbert. Quale formato di file è comunemente usato per rappresentare sequenze di nucleotidi o proteine? VCF GFF FASTA. Quale test è adatto per confrontare le medie di tre o più gruppi? Test Z ANOVA Test chi-quadro. Qual è la potenza di un test? La probabilità di commettere un errore del II tipo La probabilità di rifiutare H0 quando H1 è vera La probabilità di accettare H0 . Quale intervallo include circa il 95% dei dati in una distribuzione normale? μ ± 2σ μ ± σ μ ± 3σ. Cos'è una matrice di sostituzione? Un insieme di algoritmi per allineare sequenze Un sistema di archiviazione disequenze proteiche Una tabella che assegna punteggi alle sostituzioni di residui. In statistica inferenziale, cosa rappresenta l'ipotesi nulla? Un'ipotesi di distribuzione dei valori attesi entro un determinato intervallo di deviazione standard Un'ipotesi che non prevede alcuna differenza o effetto Un'ipotesi che afferma l'esistenza di un effetto. Come reagiscono le reti a invarianza di scala alla perdita casuale di un nodo? Collassano immediatamente Perdono i nodi principali Mantengono la loro struttura e funzionalità. Quale parametro influenza la forma della curva in una distribuzione normale? La media aritmetica La moda La deviazione standard. Qual è la funzione principale dei database primari in bioinformatica? Fornire strumenti per l'analisi statistica dei dati biologici Archiviare dati sperimentali come sequenze nucleotidiche e proteiche Creare modelli di strutture proteiche basate sui dati. Che cosa misura una matrice PAM? La distanza genetica tra due specie evolutivamente vicine L'espressione genica nelle popolazioni evolute nello stesso clade La probabilità di sostituzione di amminoacidi nel tempo evolutivo. Chi ha sequenziato per primo una proteina? Kary Mullis Allan Maxam Frederick Sanger. Qual è la caratteristica principale della distribuzione normale standardizzata? È sempre simmetrica rispetto all'asse delle y Ha media pari a 0 e deviazione standard pari a 1 Ha media pari a 1 e deviazione standard pari a 0. Quando si usa il coefficiente di correlazione di Pearson? Per analizzare variabili qualitative percentualizzate Per variabili quantitative con relazione lineare Per misurare la varianza di variabili qualitative continue. In un database relazionale, cosa rappresenta la chiave primaria? Un attributo che consente di unire tabelle diverse Un attributo che può avere valori duplicati Un attributo che identifica univocamente ogni record. Quando è appropriato utilizzare l'ANOVA? Per confrontare due medie accoppiate Per confrontare più di due medie indipendenti Per confrontare solo due medie. Quale processo aiuta a ridurre il bias nel design sperimentale? Uso di adattatori Sequenziamento paired-end Randomizzazione. Qual è il parametro chiave per normalizzare i dati nella matrice di conteggio? Lunghezza del genoma Lunghezza degli esoni Numero totale di geni. Qual è il principale vantaggio dell'allineamento locale rispetto a quello globale? Evita l’uso di gap Evidenzia regioni conservate Analizza sequenze complete. Qual è l'obiettivo della stratificazione in un campionamento? Ridurre la variabilità campionaria dividendo la popolazione in gruppi omogenei Aumentare la variabilità del campione Scegliere campioni solo dalle aree con più alta densità di popolazione. Quale delle seguenti tecniche è una tecnica di classificazione non supervisionata? PCA LDA PLS-DA. Quale indice statico divide un dataset in quattro parti uguali? Quartili Media Varianza. Qual è la funzione della tabella delle occorrenze creata da Bowtie? Normalizzare la matrice di conteggio delle occorrenze Annotare varianti genomiche che occorre correggere Fornire l'indice delle occorrenze di ogni carattere. Cos’è un algoritmo? Un database relazionale Una funzione matematica complessa Un insieme finito di istruzioni chiare e non ambigue per risolvere un problema. Qual è l'obiettivo della strategia di clustering gerarchico top-down? Unire le osservazioni in gruppi grandi Calcolare la media delle osservazioni in ogni gruppo Suddividere il dataset iniziale in gruppi più piccoli. Qual è lo scopo dell'algoritmo di Needleman-Wunsch? Allineare globalmente due sequenze Identificare domini ripetuti in un problema Valutare il polimorfismo genetico. Qual è il compito principale della bioinformatica? Analizzare dati biologici Disegnare proteine Simulare cellule . Quale processo determina la struttura tridimensionale del ribosoma? Trascrizione di ncRNA Sequenziamento del trascrittoma Assemblaggio di rRNA e proteine. In un test diagnostico, cosa rappresenta il cut-off? Un valore che separa i falsi positivi dai veri negativi Un valore medio usato per standardizzare i risultati Il punto che separa i veri positivi dai veri negativi. Qual è l'obiettivo dell'analisi multivariata? Descrivere relazioni complesse tra molte variabili Misurare la frequenza di una variabile Rappresentare solo una variabile in un grafico. Qual è un requisito essenziale per garantire robustezza nei risultati? Sequenziamento casuale Numero limitato di campioni Replicati biologici. Che cosa misura il coefficiente di correlazione di Manhattan (MCC)? L’accuratezza del modello di classificazione La variabilità dei falsi negativi La capacità di classificare correttamente i veri positivi e negativi. Quale componente è essenziale per la funzionalità del ribosoma? mRNA rRNA tRNA. Qual è la probabilità che due individui della stessa specie abbiano differenze genetiche? 2% 0,1% 1%. Quale metodo di campionamento non garantisce una selezione casuale? Campionamento per randomizzazione semplice Campionamento di convenienza Campionamento stratificato. Quale rete è rappresentata da connessioni orientate e ponderate? Rete semplice Rete biologica Rete casuale . Quale indice viene usato per esprimere la precisione di una misura? Mediana Media Deviazione standard. Quale tra questi è un parametro campionario che stima la deviazione della popolazione? La deviazione standard campionaria La media La mediana. Cos’è una matrice delle distanze? Una rappresentazione delle distanze tra tutte le coppie di oggetti Una rappresentazione delle correlazioni tra tutte le coppie di oggetti Una rappresentazione delle regressioni tra tutte le coppie di oggetti . Quale significato ha un p-value maggiore di 0,05 in un test ANOVA? Non ci sono differenze statisticamente significative tra i gruppi Almeno uno dei gruppi è significativamente diverso dagli altri Il test è sempre significativo. Quale funzione principale svolge l'algoritmo BLAT? Analisi filogenetica Mappatura genomica Allineamento globale. Quale tecnica viene utilizzata da Bowtie per ridurre il consumo di memoria? Algoritmi di clustering indicizzati Normalizzazione delle reads nella tabella delle occorrenze Combinazione di compressione e indicizzazione. Quale dei seguenti è un linguaggio di basso livello? Java Assembly Python. Per un intervallo di confidenza del 95%, quale valore di Z si utilizza? 2,58 1,96 3,29. Quale metodo identifica geni ortologhi tra specie? Multi-allineamento Analisi filogenetica BLAST. Qual è il risultato principale dell'allineamento con Bowtie? Reads mappate sul genoma di riferimento Sequenze non codificanti annotate Profili di espressione genica. In una Cluster Analysis gerarchica, qual è il risultato finale della suddivisione del dataset? Un grafico di dispersione Una serie di medie Un dendrogramma. Qual è la funzione principale della memoria RAM in un computer? Eseguire operazioni di input/output Memorizzare permanentemente i dati Memorizzare temporaneamente i dati da elaborare. Qual è l'effetto della trasformazione logaritmica su variabili con alta varianza? Elimina completamente la varianza dovuta al caso, mantenendo quella effettiva Da maggiore peso alla varianza delle variabili indipendenti Riduce l'effetto di valori estremi. Quale tipo di mutazione è un cambiamento puntuale non silente? Inversione Transizione Delezione. Qual è la relazione tra sensibilità e specificità in una curva ROC? Un aumento della sensibilità comporta una diminuzione della specificità, e viceversa Non esiste una relazione diretta tra le due La sensibilità è sempre il doppio della specificità. Cos'è una relazione eteroschedastica? Quando la varianza tra le variabili è omogenea Quando la media delle variabili è uguale Quando esistono sotto-popolazioni con varianze diverse. Cos'è il Fourth Paradigm nella scienza? L'introduzione del sequenziamento genico Una metodologia scientifica guidata dai dati L'uso di esperimenti per validare modelli teorici. Quale parametro definisce la dispersione in una distribuzione normale? Moda μ σ. Qual è il ruolo del cut-off in una curva ROC? Stabilire il valore medio delle risposte positive Eliminare i valori estremi dal dataset Determinare il punto ottimale per massimizzare la sensibilità del test. Qual è il significato di un test a due code? Il test verifica differenze solo in una direzione Il test non ha una regione di rifiuto definita I test verifica differenze in entrambe le direzioni. Quale intervallo rappresenta il 99% dei dato di una distribuzione normale? μ ± 2,58σ μ ± σ μ ± 3σ. Nella PCA, le componenti principali sono: Combinazioni lineari delle variabili originali Variabili centrate sulla media Variabili originali non correlate. Qual è il motivo principale per utilizzare RNA-Seq? Analizzare proteine Identificare trascritti rari Misurare abbondanza di ncRNA. In un modello PLS, cosa rappresentano le componenti latenti? Valori di varianza casuali ortogonali alle componenti principali Nuove variabili che riassumono la variazione essenziale Variabili predittive originali. Qual è la differenza tra un metodo di clustering gerarchico e non gerarchico? Il metodo non gerarchico può generare un numero di cluster variabile durante l'analisi Nel metodo gerarchico i cluster sono stabiliti a priori e non possono essere modificati Il metodo gerarchico richiede un numero fisso di cluster. Cos'è un polimorfismo? Un errore di trascrizione durante la replicazione del DNA Una variazione genetica presente in almeno 1% della popolazione Una mutazione che causa la poliomielite. Che cosa rappresenta la frequenza assoluta di una modalità? La proporzione di una modalità rispetto al totale Il numero di volte che una modalità si presenta in un dataset La somma delle altre frequenze. Cos'è un intervallo di confidenza? Un range in cui si trova la media campionaria Un intervallo entro cui la variabile è sicuramente presente Un intervallo che contiene il valore atteso della popolazione con un certo livello di sicurezza. Quale tecnica è usata per analizzare l'evoluzione molecolare? Analisi filogenetica Modifica delle sequenze nucleotidiche Test di mutagenesi sperimentale. A cosa serve la trasformazione in Z in una distribuzione normale? Per calcolare la deviazione media Per standardizzare la distribuzione Per ridurre il numero di variabili. Che cosa misura l’ANOVA a una via? La probabilità di un evento in un singolo gruppo Le differenze tra le medie di tre o più gruppi La relazione tra due variabili continue. Che cos'è la filogenesi molecolare? Lo studio delle relazioni evolutive tra geni e proteine Una tecnica per clonare sequenze di DNA L'analisi di mutazioni proteiche in laboratorio. Quale caratteristica distingue una rete ponderata da una non ponderata? La presenza di link con direzioni l numero di nodi presenti nella rete La forza dell'interazione rappresentata dai link. Qual è il significato di "sensibilità" in un test? La capacità di identificare tutti i veri negativi La capacità di rilevare i veri positivi La frequenza dei falsi negativi. Quale parametro viene utilizzato per identificare geni espressi in modo significativo? FDR p-value Log2FC. Qual è il metodo principale per identificare polimorfismi nel genoma? Analisi filogenetica Allineamento Sequenziamento. Qual è il ruolo principale del trimming nel workflow RNA-Seq? Amplificare frammenti genomici Rimuovere adattatori e basi di bassa qualità Sequenziare RNA non codificanti. Quale valore assume il coefficiente di correlazione in una perfetta correlazione negativa? 0 1 -1. Qual è lo scopo della Cross-Validation in PLS-DA? Valutare la capacità predittiva del modello Calcolare le variabili qualitative Misurare la media di variabili continue. Qual è l'algoritmo più utilizzato per identificare allineamenti locali? BLAST ClustalW Needleman-Wunsch. Qual è l'algoritmo di allineamento utilizzato per trovare somiglianze locali? Smith-Waterman Matcher Stretcher. Qual è la funzione principale delle reti biologiche? Calcolare la probabilità di mutazioni genetiche Misurare la velocità di crescita delle cellule Analizzare le interazioni binarie tra entità biologiche. Cos'è una mutazione puntiforme accettata (PAM)? Una mutazione che è accettata dalla selezione naturale Una mutazione casuale che causa malattie genetiche Una mutazione che si ripete in una popolazione specifica. In informatica, cosa rappresenta la complessità spaziale di un algoritmo? Il tempo di esecuzione in funzione della dimensione dell'input La quantità di memoria RAM utilizzata durante l'esecuzione l numero di istruzioni eseguite durante l'esecuzione. Qual è il significato di un clustering nei dendrogrammi? Mostrare le differenze tra tutti i campioni senza correlazione Ordinare i dati in base alla loro frequenza Raggruppare variabili o campioni con caratteristiche simili. Qual è la funzione dell’errore standard della media? Calcola la media delle deviazioni standard della mediana Misura la dispersione dei dati rispetto alla media del campione Indica la precisione della media campionaria come stima della media della popolazione. Qual è il significato della sensibilità di un biomarcatore? La capacità di identificare correttamente i veri positivi La resistenza del biomarcatore ai cambiamenti ambientali La capacità di identificare correttamente i casi negativi. In OPLS-DA, cosa significa "separazione ortogonale"? Separare la variabilità utile dalla variabilità di disturbo Eliminare le variabili non correlate Calcolare la media dei dati. Qual è il principale obiettivo del trimming delle reads? Normalizzare la matrice di conteggio Migliorare la qualità dei dati Rimuovere RNA non codificanti. Quale modello descrive reti con pochi nodi altamente connessi e molti nodi poco connessi? Rete casuale Rete a invarianza di scala Rete gerarchica. In Cluster Analysis, cosa si intende per separazione? La distanza media tra gli elementi del cluster La distanza tra elementi appartenenti a cluster diversi La frequenza delle variabili nel cluster. Che cos'è una sequenza di DNA rappresentata in bp? Base Primaria Coppie di basi Posizione Basale. Qual è lo scopo di un dendrogramma in un'analisi di cluster? Rappresentare graficamente le relazioni gerarchiche tra cluster Mostrare la distribuzione dei dati Identificare i valori anomali nel dataset. Qual è il modello teorico che descrive reti con cammini brevi tra nodi? Albero gerarchico Scala libera Mondo piccolo. Che cosa rappresenta la regressione lineare? Un test per misurare la probabilità di eventi binari Una misura della dispersione dei dati intorno alla media Un modello statistico che descrive la relazione lineare tra una variabile dipendente e una indipendente. Che cosa rappresenta un valore di R² vicino a 1? Il modello spiega bene la variabilità dei dati Il modello non spiega la variabilità dei dati Il modello è casuale. Quale tecnica chemometrica viene utilizzata per ridurre il numero di variabili mantenendo la massima varianza possibile? PLS-DA OPLS PCA. Quale delle seguenti tecniche di sequenziamento è la più recente? Maxam-Gilbert Sequencing Oxford Nanopore Sequencing Sanger Sequencing. Qual è un vantaggio del sequenziamento paired-end? Maggior velocità Rilevamento limitato di varianti Informazioni su trascritti complessi. In quale tipo di memoria viene solitamente caricato il firmware? RAM ROM Cache. Che cosa indica un autovalore (eigenvalue) in PCA? La somma delle medie dei dati La quantità di varianza spiegata da una componente principale La variabilità totale di una singola variabile . Cos'è la distribuzione normale? Una distribuzione continua con forma a campana Una distribuzione di variabili discrete Una distribuzione di frequenze categoriali. Perché si utilizza la PLS in bioinformatica? Per aumentare la dimensionalità dei dati Per analizzare relazioni complesse tra X e Y in dataset di alta dimensionalità Per analizzare relazioni complesse tra X e Y in dataset con alta variabilità. Qual è lo scopo di un grafico a dispersione? Rappresentare la relazione tra due variabili quantitative Confrontare le frequenze di variabili categoriche Rappresentare la relazione tra due variabili qualitative continue. Qual è il significato di distribuzione di grado in una rete? Rappresenta la probabilità che un nodo abbia un determinato grado Calcola la media dei nodi di una rete Misura la forza delle connessioni in una rete ponderata. Quale parametro guida l'introduzione di gap durante un allineamento? Gap penalty Match score Similarity score. In una distribuzione normale, cosa indica la media? Il valore più frequente nel dataset Il valore centrale che divide la distribuzione in due metà uguali La somma delle deviazioni standard. Cosa rappresenta il parametro σ in una distribuzione normale? La mediana La deviazione standard Il valore massimo della curva. Quale centro di ricerca è noto per la gestione di dati bioinformatici? MIT EMBL-EBI Università di Harvard. Quale fase è cruciale per garantire la qualità dei dati RNA-Seq? Assemblaggio de novo Sequenziamento dei frammenti Controllo qualità delle reads. In una distribuzione, il terzo quartile rappresenta: Il valore sotto il quale si trova il 75% dei dati Il valore centrale l valore oltre il quale si trova il 75% dei dati. Quale dei seguenti è un esempio di variabile qualitativa? Il colore degli occhi Il peso di un oggetto L'altezza di una persona . Che cosa rappresenta la varianza in un campione? La dispersione dei dati attorno alla media La frequenza di un evento La media dei valori osservati. Qual è la caratteristica principale della moda? È la media dei valori più estremi E sempre uguale alla mediana È il valore che si presenta con maggiore frequenza in un dataset. Quale ruolo hanno i polimorfismi nella diagnosi genetica? Forniscono informazioni sulla struttura tridimensionale del DNA Aiutano a identificare il rischio di malattie genetiche Permettono di calcolare la distanza evolutiva tra organismi. Qual è un importante vantaggio del metodo GSEA? Analizza esclusivamente il trascrittoma Concentra l'analisi su gruppi di geni predefiniti Identifica singoli geni regolatori . Cosa misura la covarianza tra due variabili? La media delle variabili La somma dei valori delle due variabili La variabilità congiunta tra le variabili. Qual è l'importanza dei replicati tecnici in un esperimento RNA-Seq? Controllare errori analitici Normalizzare il trascrittoma Migliorare il conteggio totale. Quando si utilizza la normalizzazione per variabili? Per ridurre il numero di variabili Quando tutte le variabili hanno la stessa unità di misura ma sono affette da bias Per rendere le variabili comparabili in presenza di scale diverse. Qual è la differenza tra un diagramma a barre e un istogramma? Un diagramma a barre rappresenta variabili qualitative, mentre un istogramma variabili quantitative Un istogramma rappresenta frequenze assolute, mentre un diagramma a barre rappresenta solo valori medi Non vi è alcuna differenza sostanziale. Qual è il ruolo principale degli snRNA? Modulare lo splicing Tradurre RNA in proteine Legare ribosomi. Qual è lo scopo della centratura dei dati in PCA? Ridurre il numero di variabili nel dataset Aumentare la deviazione standard delle variabili Posizionare il centroide dei dati all'origine, facilitando l'interpretazione della variabilità. Un istogramma è usato per rappresentare: La distribuzione di frequenze di variabili quantitative La relazione tra due variabili La frequenza di una variabile qualitativa. Cos'è il coefficiente di determinazione R2 ? Il prodotto delle deviazioni standard delle variabili Una misura della media della varianza La proporzione della varianza nella variabile dipendente spiegata dal modello di regressione. Quale algoritmo è progettato per analizzare cammini minimi in reti biologiche? Dijkstra Bellman-Ford Floyd-Warshall. Qual è lo scopo della normalizzazione in Cluster Analysis? Aumentare la varianza dei dati in modo da evidenziare meglio le differenze tra gruppi Rendere comparabili variabili con unità di misura diverse Ridurre il numero di variabili nel dataset. Quale campo si concentra sull'integrazione di dati multi-omici? Evoluzione molecolare Filogenesi Biologia dei sistemi . Quale risorsa utilizza dati di espressione genica per generare modelli funzionali? GEO GenBank ArrayExpress. Perché il trimming è essenziale prima della mappatura delle reads? Migliora la qualità dell'allineamento Rimuove RNA non codificanti Riduce il numero di geni analizzati. Cosa rappresenta il valore massimo della curva normale? Il punto di massima densità di probabilità La moda della distribuzione La mediana della distribuzione. Qual è la funzione della distribuzione t di Student? Calcolare medie per grandi campioni Tenere conto della variabilità della deviazione standard nota della popolazione Tenere conto della variabilità della deviazione standard campionaria. Qual è la probabilità cumulativa associata al valore Z = 1,96? 0,68 0,99 0,95. Quale distanza dà maggiore peso alle differenze relative tra valori piccoli? Distanza Euclidea Distanza di Manhattan Distanza di Canberra. A cosa serve la tecnica OPLS? Aumentare il numero di variabili Calcolare la media delle variabili Separare la variabilità correlata da quella non correlata a Y . Che cosa rappresenta il primo quartile di un dataset? La media dei valori del dataset Il valore al di sotto del quale si trova il 25% delle osservazioni Il valore al di sotto del quale si trova il 75% delle osservazioni. Qual è lo scopo della Cluster Analysis in statistica? Misurare la correlazione tra variabili indipendenti Raggruppare oggetti simili in assenza di conoscenza a priori Classificare oggetti in base a criteri noti . Cosa rappresenta il valore critico in un test statistico? l valore minimo per accettare H0 l valore massimo per rifiutare H0 Il valore che separa la regione di accettazione dalla regione di rifiuto. Che cosa rappresenta l'intervallo di confidenza al 95%? La probabilità che la media campionaria sia esattamente uguale alla media della popolazione L'intervallo entro cui ci si aspetta che la media della popolazione cada con una confidenza del 95% La probabilità che la media campionaria sia all'interno di una deviazione standard dalla media. In una rete a invarianza di scala, quale effetto può avere la perdita di un hub? Può causare il collasso della rete Aumenta la densità della rete Riduce la connettività della rete in modo insignificante . Quando si usa la PCA? Per esplorare dataset binari di cui non si conosce la complessità Per classificare variabili qualitative in dataset multidimensionali Per esplorare pattern nascosti in dataset complessi. In una matrice delle adiacenze, cosa rappresenta il valore 0? La presenza di un link tra due nodi Un link ponderato L’assenza di un link tra due nodi. Cos'è la bioinformatica nel contesto della biologia molecolare La creazione di database di immagini cellulari Un insieme di esperimenti per alterare il DNA L'archiviazione e analisi di dati genetici e molecolari. Quale database fornisce informazioni sui microRNA? TRANSFAC Reactome miRBase. Qual è lo scopo della correzione di Bessel? Aumentare la deviazione standard per campioni di piccole dimensioni Calcolare il p-value Evitare la sottostima della varianza campionaria. Che cosa rappresenta una matrice delle distanze? La media delle distanze tra le osservazioni La somma delle varianze di tutte le variabili La distanza numerica tra coppie di punti o campioni in un dataset. Che cosa rappresenta una ROC multivariata in un modello predittivo? La capacità di predire un solo outcome con una singola variabile La valutazione della capacità discriminante di più variabili combinate in un unico modello Una curva che mostra solo il tasso di veri positivi. Quale programma è progettato per analizzare trascrizioni e identificare geni? Needleman-Wunsch CLUSTAL SPLIGN. Che cosa rappresenta un istogramma? La media di un campione di dati La relazione tra due variabili La distribuzione di frequenza di variabili quantitative. Quando si considera che un AUC sia indicativo di una buona capacità discriminante? Quando è vicino a 1 Quando è vicino a 0 Quando è vicino a 0,5. Quale strategia di clustering utilizza l'algoritmo K-means? Random sampling Top-down Bottom-up. Qual è la differenza tra quartile e percentile? I quartili dividono i dati in quattro parti uguali, mentre i percentili li dividono in 100 parti uguali I quartili sono utilizzati solo in statistica inferenziale I percentili sono sempre multipli dei quartili. Qual è il ruolo del database UniProt? Conservare sequenze proteiche Analizzare strutture tridimensionali Sequenziare proteine. Quale approccio è utilizzato per identificare pattern ricorrenti in reti biologiche? Cross-validation Motif analysis Data folding. Che cosa rappresenta un outlier in una distribuzione di dati? Un valore centrale della distribuzione La media di tutti i valori Un valore che si discosta notevolmente dalla maggior parte degli altri valori. Quale database è specifico per le espressioni geniche? UniProt GenBank GEO (Gene Expression Omnibus) . Quando si usa un grafico a barre raggruppate? Per mostrare la tendenza temporale di una variabile Per confrontare valori di diverse categorie in più gruppi Per visualizzare la distribuzione di frequenza di variabili continue . Cosa rappresenta un box plot? La frequenza delle modalità di una variabile qualitativa La distribuzione dei valori con la mediana e i quartili Una serie di barre che mostrano errori di misura. In un'analisi di regressione lineare, cosa indica il coefficiente di determinazione (R2)? La media della variabile dipendente La frequenza dei falsi positivi La proporzione di varianza spiegata dal modello. Qual è la funzione principale del sistema operativo? Eseguire calcoli complessi Gestire le risorse hardware e software Memorizzare dati in modo permanente. A cosa serve la PLS-DA in analisi di classificazione? Misurare varianze separate Distinguere campioni tra classi note Calcolare la frequenza dei dati. Qual è il principale database utilizzato per raccogliere sequenze proteiche? GenBank UniProt PubMed. Quale parametro è utilizzato per correggere p-value in test multipli? FDR Log2FC Conteggio normalizzato. Qual è il formato di file che combina sequenze e punteggi di qualità? BED SAM FASTQ. Qual è una caratteristica della distanza di Canberra? È insensibile ai grandi cambiamenti nei dati anche quando i valori assoluti sono piccoli È sempre inferiore alla distanza di Manhattan, pertanto è più sensibile Dà maggiore peso alle differenze relative quando i valori assoluti sono piccoli. Qual è l’obiettivo della normalizzazione TPM? Garantire l’accuratezza del p-value Sequenziare RNA non codificante Confrontare trascritti tra esperimenti. Quando si usa un t-test a una coda? Quando si confrontano più di due gruppi Quando non si ha nessuna ipotesi specifica Quando si ha un’ipotesi direzionali su un effetto. Che cosa si intende per varianza spiegata in PCA? La proporzione di variabilità totale rappresentata da una componente principale La differenza tra la media e la mediana La misura della correlazione tra due variabili. Che cosa rappresenta la retta di regressione in un grafico? La linea che minimizza la distanza quadrata dai punti La frequenza relativa del campione La media dei valori osservati. Quando si usa la distanza di correlazione? Per valutare meglio le differenze relative tra variabili Quando i dati sono normalizzati Quando si vuole ignorare l’ampiezza dei valori assoluti. Che cos’è una matrice in IT? Un singolo valore non modificabile Un insieme di valori organizzati in righe e colonne Un vettore di valori numerici organizzati in righe e colonne. Qual è la principale piattaforma di ricerca sviluppata da NCBI? Entrez PubMed Protein Data Bank. Che cosa si intende per modello supervisionato? Un modello che utilizza dati con etichette per prevedere categorie Un modello che riduce la dimensionalità dei dati Un modello che esplora la struttura dei dati senza classi note. Che cosa rappresenta un campione stratificato? Un campione scelto solo in base alla convenienza Un campione diviso in gruppi omogenei basati su una caratteristica rilevante Un campione casuale semplice senza divisioni. Che cos’è il grado di un nodo in una rete? Il numero di link direttamente connessi a quel nodo La probabilità di essere connesso ad un altro nodo La distanza del nodo dal centro della rete. Quale componente di Bowtie gestisce gli allineamenti multipli? Generatore di reads casuali Algoritmo di backtracking Normalizzatore di conteggi. Qual è il significato di un coefficiente di correlazione pari a 0? Esiste una correlazione perfetta Esiste una correlazione negativa Non c’è correlazione lineare. Che cosa indica la colorazione in una heatmap? La variazione dei valori di espressione tra variabili e campioni La posizione esatta delle osservazioni La deviazione standard di ogni variabile. Qual è lo scopo della Cluster Analysis nel data mining? Aumentare la varianza delle variabili Eliminare le variabili senza correlazione Identificare pattern o raggruppamenti nei dati senza etichette. Quale tra i seguenti è un indice di posizione centrale? Deviazione standard Varianza Media. La simmetria in una distribuzione significa che: Media, mediana e moda sono uguali Non ci sono valori estremi La distribuzione è divisa in quartili. Che cosa si intende per scarto medio in statistica? La media delle deviazioni assolute dalla media La media aritmetica dei valori di un campione La differenza tra il valore massimo e minimo. Qual è il metodo più usato per allineare sequenze di proteine evolutivamente divergenti? BLOSUM62 PAM80 PAM1. Qual è il nome del database di proteine che contiene informazioni sulla struttura 3D delle macromolecole? UniProt GenBank PDB. Quando è utile utilizzare la trasformazione logaritmica in un dataset? Quando si confrontano variabili qualitative Quando tutte le variabili sono misurate sulla stessa scala Quando si vuole ridurre l’impatto delle differenze elevate tra i valori. Cosa misura l'accuratezza di un test diagnostico? La frequenza di falsi positivi La proporzione di veri positivi e veri negativi La proporzione dei veri positivi e rispetto ai falsi positivi. In una PLS-DA, cosa rappresenta un VIP score superiore a 1? Che la variabile è irrilevante per il modello Che la variabile è meno influente Che la variabile è importante per la separazione delle classi. In statistica inferenziale, cosa rappresenta un intervallo di confidenza? L'intervallo entro cui si trova un parametro della popolazione con una certa probabilità La media del campione rispetto alla popolazione La somma delle varianze di tutte le osservazioni. Perché è utile comprendere il processo di standardizzazione? Per calcolare facilmente la media Per eliminare i valori negativi Per interpretare i risultati delle analisi statistiche. Qual è lo scopo principale delle tecniche di clustering? Misurare la correlazione tra variabili Raggruppare le unità in gruppi omogenei Rappresentare una variabile su un asse cartesiano . Qual è il nome del fenomeno che rende una mutazione stabile nella popolazione? Traslocazione Fissazione Polimorfismo. In una distribuzione normale, circa il 68% delle osservazioni si trova: Tra µ ± 2 σ Tra µ ± 3 σ Tra µ ± 1 σ. Qual è il principale obiettivo della matrice di conteggio? Misurare i livelli di espressione genica Sequenziare RNA totale Rilevare mutazioni. Cos'è il Volcano Plot? Un grafico di dispersione per identificare cambiamenti significativi tra più di due gruppi Un grafico di dispersione per identificare cambiamenti significativi tra due gruppi Un grafico di dispersione per identificare cambiamenti significativi tra almeno due gruppi. Cos'è una variabile quantitativa continua? Una variabile rappresentabile da qualsiasi numero all'interno di un intervallo Una variabile che descrive attributi come colore o forma Una variabile che assume continuamente valori interi positivi oppure negativi in un certo intervallo. In una distribuzione normale, circa il 68% delle osservazioni si trova: Tra µ ± 2 σ Tra µ ± 3 σ Tra µ ± σ . In un’analisi multivariata, qual è il ruolo della normalizzazione? Rendere comparabili variabili con metriche logaritmiche Rendere comparabili campioni di gruppi diversi Rendere comparabili variabili con unità diverse. Quale misura di distanza si basa sul teorema di Pitagora? Distanza Euclidea Distanza di Minkowski Distanza di Canberra. Qual è l'obiettivo della statistica bivariata? Studiare la relazione tra variabili qualitative e quantitative Studiare la relazione tra una coppia di variabili Determinare la media di una variabile. Che cosa rappresenta l'analisi PLS-DA multivariata? Un metodo di riduzione della dimensionalità senza classificazione Un test diagnostico non supervisionato Una tecnica supervisionata per la classificazione basata su più variabili predittive. Quale strumento è utilizzato per identificare regioni codificanti in sequenze nucleotidiche? ClustalW BLASTX TBLASTN. Quale test è utilizzato per dati accoppiati? t-test per dati appaiati Test chi-quadro ANOVA. Cos'è un clade nell'analisi filogenetica? Un gruppo di organismi con un antenato comune Un gruppo di organismi correlati ma senza un antenato comune Un parametro di clustering. Cosa indica il parametro sigma (σ) in una distribuzione normale? Il punto in cui la distribuzione raggiunge il suo massimo La dispersione dei valori attorno alla media La media dei valori della distribuzione. In un dendrogramma, cosa indica la lunghezza del ramo? La distanza tra cluster Il valore medio La frequenza delle variabili. Cosa rappresenta il clustering bottom-up? Raggruppamento che parte dalle singole osservazioni fino all'intero dataset Clustering che usa solo le metriche delle distanze bipartite Raggruppamento che parte dai gruppi e giunge fino alle singole osservazioni. Qual è il contributo principale di un workflow ben progettato? Garantire risultati robusti e riproducibili Evitare completamente i bias Ridurre il costo del sequenziamento. Qual è il database più utilizzato per sequenze nucleotidiche? RefSeq GenBank SwissProt. Un campione randomizzato è caratterizzato da: Un numero predefinito di unità Ogni unità ha la stessa probabilità di essere inclusa Una selezione basata sulla convenienza. Che cosa indica un'elevata Accuracy in una cross-validation per PLS-DA? Che il modello ha una bassa capacità di predizione Che il modello ha una bassa varianza Che il modello classifica correttamente la maggior parte dei campioni . Qual è la caratteristica principale di una distribuzione simmetrica? Ha sempre una curtosi positiva Media, mediana e moda coincidono È priva di valori estremi. Che cosa rappresentano i loading scores in PCA? La media delle componenti principali La distanza tra due variabili I contributi delle variabili originali a ciascuna componente principale. Qual è la formula dell'errore standard della media? σ2/n s/n σ/radice n. Qual è lo scopo del Protein Data Bank (PDB)? Archiviare strutture tridimensionali di proteine Registrare varianti SNP umane Conservare dati di espressione genica. Quale algoritmo è utilizzato per l’allineamento globale di sequenze? Smith-Waterman Matcher Needleman-Wunsch. In un grafico a dispersione, un rapporto lineare indica: Una varianza nulla tra le variabili Una relazione positiva o negativa costante Nessuna relazione tra variabili. Qual è la particolarità della distanza di Canberra? Ignora le differenze tra valori piccoli È adatta solo per variabili positive È particolarmente sensibile ai valori vicini a zero e alle differenze relative tra dati. Qual è l’importante funzione dei ncRNA? Regolare processi cellulari Dirigere la traduzione proteica Sequenziare genomi. Che cosa rappresenta un nodo in una rete biologica? Un'entità come un gene, una proteina o una malattia La forza dell'interazione tra due entità La connessione tra due entità biologiche. Qual è la differenza principale tra l'accuratezza e la precisione di una stima? Non esiste differenza tra i due concetti La precisione misura la dispersione, mentre l'accuratezza misura la vicinanza al valore vero L'accuratezza misura la dispersione, mentre la precisione misura la vicinanza al valore vero. Come si calcola la sensibilità di un test? FN / (TP + TN) FP / (TP + TN) TP / (TP + FN) . Cosa indica l’acronimo SNP? Sequence Nucleotide Projection Single Nucleotide Polymorfism Single New Protein. Cosa indica un pattern di correlazione positiva tra unità statistiche: Hanno varianze molto simili pertanto appartengono alla stessa unità campionaria Che all’aumentare di una l’altra diminuisce Probabilmente fanno parte dello stesso tessuto o funzione . Qual è la funzione dei database secondari in bioinformatica? Salvare dati non creati Contenere dati analizzati derivato da database primari Archiviare solo sequenze di DNA che derivano da database primari. Qual è lo scopo della deviazione standard? Trovare il valore più frequente di un dataset Fornire una misura della dispersione dei dati intorno alla media Indicare la tendenza centrale dei dati. La distanza Minkowski è una generalizzazione di quale misura? Della distanza euclidea e Manhattan Solo della distanza di Manhattan Solo della distanza euclidea, purché considerata al quadrato. Quale approccio è utilizzato per l’allineamento globale di sequenze? BLAST Needleman-Wunsch Smith-Waterman. Qual è il principale vantaggio della tecnica paired-end in RNA-Seq? Sequenzia frammenti genomici in tempo reale Analizza RNA non codificanti Permette la lettura di entrambe le estremità di un frammento. Quale è il nome dei database che consente di ottenere informazioni sulla struttura 3D delle proteine? PDB GenBank UniProt. Qual è l’uso della tecnica di allineamento locale (Smith-Waterman)? Allineare tutte le sequenze in un database in modo globale Trovare regioni di somiglianza tra due sequenze in porzioni limitate Determinare la struttura tridimensionale delle proteina. Qual è la funzione principale di una heatmap? Mostrare solo le variabili più importanti di un dataset Visualizzare la correlazione tra variabili e campioni usando una scala di colori Separare i dati in cluster definiti. Quale paramento si guarda per identificare il peso dei bias di sequenziamento nei grafici di FASTQC? Conteggio delle reads Lunghezza dei frammenti Squilibrio nel contenuto di basi. Limitazione della cluster analysis gerarchica La necessità di impostare un numero fisso di cluster La mancanza di coerenza tra cluster L’impossibilità di riconsiderare una divisione d’un livello successivo. Qual è la differenza tra Cluster Analysis e PLS-DA? La Cluster Analysis richiede categorie predefinite supervisionate almeno sulla prima dimensione La Cluster Analysis è sempre binaria, mentre la PLS-DA può essere a più di due cluster La Cluster Analysis non è supervisionata e non richiede categorie predefinite . Cosa identifica la sensibilità di un biomarker? La capacità di identificare correttamente i veri positivi La capacità di identificare correttamente i casi negativi La resistenza del biomarcatore ai cambiamenti ambientali . Qual è la deviazione standard di un campione formato da una sola unità campionaria? 1 0 Non esiste.

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