Všechny viry nemají translacni aparat ano ne.
Helikální kapsidy Všechny +RNA Některé +RNA Všechny -RNA Některé -RNA Některé DNA.
Viroidy Využívají hostitelskou jadernou DNA dependentní RNA polymerázu I nebo II Využívají hostitelskou jadernou RNA dependentní RNA polymerázu I nebo II Jsou infekční.
Order the sentence correctly: Infekční cyklus Replikace_genomu_(translace(transkripce)_kapsidových_proteinů) Skládání_virových_částic_a_opuštění_buňky_(virové_potomstvo_muže_infikovat_další_buňky) Produkce_virové_mRNA_(translace_genů_nutných_pro_replikaci_genomu) Pochlecní_a_vstup_častice_(zahrnuje_transport__do_místa_replikace_viru).
Žadné viry nobsahují ve virionech enzym pro replikaci ano ne.
Všecny savčí dna viry zpusobují nádory ano ne.
Receptorem zprostředkovaná fúze Přímo na cytoplasmatické membráně Unik z endozomu Pomocí klatrinových váčků.
ssDNA viry Parvovirus Dependovirus Geminiviry Erythrovirus Bocavirus Densovirinae Polyomavirus.
Parvoviry Lineární + nebo -ssDNA Kruhová + nebo -ssDNA Replikace rotující vlasenky (rolling hairpin replication) Je tam virus využívající pomocný virus Vektor pro protinádorovou terapii Infekce vede k destrukci buněk Po vstupu do jádra DNA cirkularizuje.
Polyomaviry dsDNA lineární +RNA Obalený Tumorogenní Vétšina využívá pro infekci lipidové receptory (gangloisidy) LT protein (multifunkční, navázání p53 a pRb) Má nezbytné pro lytický cyklus proteiny ve tegumentu.
Papillomaviry Všechny ORF na 1 řetězci DNA - ORF se překrývají -> zvýšení kódující kapacity Kontrolní oblast LCR (loni control region) Onkoproteiny E6, E8 Má lipidický obal nucleocore: kruhová virová genomová ds DNA, cca 8 kbp + buněčné histony.
Adenoviry Po vazbě indukce klatrinem (zprostředkovaná endocytoza) Celý genom využít pro kódování proteinu na obou vláknech DNA E1A proteiny jsou klíčové pro replikaci E3 “death protein” vzniká v časné fázi VP16 protein transportován do jádra.
Poxviridae Celý replikační cyklus probíhá v cytoplasmě Tam patří myxoma virus Neobalený MV (maturated virion) - možno izolovat z infikovaných buněk Má laterální tělíska Geny obsahují introny Obalený geny introny neobsahují jediné DNA viry nesoucí ve virionu vlastní DNA polymerasu i topoizomerázu.
Picornaviry Neobalené Hladké nebo s kaňony Póry v buňečné membráně tvořeny VP1 a VP4 proteiny Klatrinem zprostředkovaný vstup Mají hemaglutinin polyA sekvence je přidávána hostitelskými enzymy.
Koronaviry Největší genom ze všech DNA virů Koruna je tvořená jedním z obalových glykoproteinů Translací celého genomu vzniká polyprotein, který za pomoci proteáz rozštěpěn na jednotlivé nestrukturní proteiny HE protein je hlavní transmembránový protein Obalové glykoproteiny jsou co-translačně vkládány do membrány ER.
Filoviry Ebola virus Uspořádání virionu podobné picornavirům Helikální nukleokapsida Vlasenkove struktury regulují transkripci a stabilitu mRNA Matrixový protein VP40 řídí opuštění buňky.
Viry s “ambisense” genomem Strategie DNA virů Viry se segmentovaným genomem Replikují se v jádře Virová syntéza mRNA začíná na oligoproteinu s čepičkou Virion se skládá v ER.
Reoviridae Obalené Segmentovaný lineární dsRNA genom Kapsida má několik vrstev Receptorem zprostředkovaná endocytóza závislá na integrinu beta-1 Transkripce všech segmentů probíhá současně.
Rotaviry Čeleď Reoviry Čeleď Filoviry.
Retroviry zcela mimikují buněčnou mRNA Kódující oblast - 2 geny (gag a pol) Na obou koncích shodné regulační oblasti LTR Reverzní transkriptáza je lokalizována ve virové core.
Obalené Picornaviridae Adenoviridae Rhabdoviridae Togaviridae Rostlinné.
Využívá sestřihový aparát (mohou využívat ti co se replikují v jádře) Orthomyxoviridae - influenza Retroviry Parvoviridae Ambisens viry Poxviridae Reoviridae.
parvoviry Potřebují DNA replikační aparát, ale nedokážou navodit S-fázi buňky množí se pouze v dělících se buňkách Nemohou se množit v dělících se buňkách.
obrazek čeled.
obrazek čeled.
obrazek čeled.
obrazek čeled.
obrazek čeled.
obrazek čeled.
obrazek čeled.
obrazek čeled.
obrazek čeled.
obrazek čeled.
obrazek čeled.
obrazek čeled.
obrazek čeled.
obrazek čeled.
obrazek čeled.
obrazek čeled.
obrazek čeled.
obrazek čeled.
transkripce (early genes) -> translace -> replikace DNA -> transkripce (late genes) -> translace -> assembly.
replikace (-> komplementární řetězec) -> transkripce -> translace -> assembly.
transkripce -> translace -> částečné assembly -> replikace -> transkripce -> translace.
translace (proteosyntéza mimo jiné i RdRp) -> replikace -> transkripce -> translace -> assembly.
transkripce -> translace -> replikace -> enkapsidace -> transkripce -> translace.
reversní transkripce -> integrace -> transkripce -> translace.
dosyntetizování dsDNA -> transkripce -> translace -> assembly -> replikace + reversní transkripce.
Transkripce:
- 2 nepřekrývající se ORF => CAP a REP
- čtecí rámec pro CAP proteiny dokáže kódovat až 3 kapsidové proteiny (VP1, VP2, VP3)
- mRNA pro VP1 a VP2 vzniká alternativním sestřihem
- hostitelská RNA polymeráza II. pomáhá při transkripci
- mRNA má čepičku a polyA konec
- kapsidové proteiny tvoří prázdné kapsidy - je sem enkapsidován genom (pomocí REP).
Order the sentence correctly: Transkripce polyomavirů transkripce_časných_genů replikace transkripce_běží_protisměrně_z_opačných_vláken_genomu transkripce_pozdních_genů.
replikace polyomavirů probíhá v jádře v cytoplasmě.
replikace DNA Polyomavirů vyžaduje jediný replikační faktor = (...........), ostatní faktory => jako DNA polymerázy, pomocné proteiny, atd. poskytuje host. b.
.
(..........) slouží k degradaci buňky -> pokud přichází stresové signály nebo virová infekce -> (..........) je aktivován - fosforyluje se -> pokud vyhodnotí poškození jako neúnosné, vede buňku do apoptózy
.
polyomaviry zkratka.
- kapsida tvořena 2 kapsidovými proteiny L1 (majoritní, ale kratší) a L2 (minoritní - DNA vazebný)
- nucleocore obsahuje kruhovou dsDNA a histony
- oblast časných genů (E-oblast) => E1-E4 a oblast pozdních genů (L-oblast) => L1, L2
- kontrolní oblast (LTR či UCR) -> odděluje E- a L-oblast (mezi E6 a L1 proteinem)
- replikace probíhá v jádře.
- pentonové proteiny spojeny s fibers (= trimer proteinu IV)
- fibers (vlákna) jsou zakončena knoflíkem (knob)
- nucleocore => obsahuje lineární dsDNA + histony
- genom je po celé délce pokryt histonovým polypeptidem (= protein VII)
- používají jako primární receptor molekulu CAR; vazba viru na CAR receptor je zprostředkovaná vláknem (jeho koncovou částí knob)
- Inhibice hostitelské PKR (RNA-dependentní protein kináza).
Morfogeneze virionů Adenovirů probíhá v cytoplasmě virový genom obsahuje enkapsidační signál v úseku v oblasti E1B genu virové kapsidy podléhají maturaci za účasti virových proteáz E4 protein indukuje buněčnou smrt (nezávisle na fungováni p53).
ktery je to virus?
-infekce epiteliálních buněk => lytický cyklus
-infekce primárních B-buněk -> nejprve ustavení latence
.
vlastnosti genomu:
-neschopnost separace vláken -> pokud je separujeme - dojde k rychlé renaturaci
-koncové smyčky jsou bohaté na AT, existují ve 2 isomerních formách
-většina esenciálních genů mapuje v centrální oblasti (jsou zde proteiny důležité pro transkripci, replikaci, morfogenezi)
-geny specifické pro jednotlivé viry mapují do oblastí blízko konců -> geny zajišťující obranu před imunitním systémem hostitele
-geny neobsahují introny
-geny mají krátké regulační oblasti, každý gen má vlastní promotor
-transkripce z obou vláken.
Pokud není přítomna žádná primáza -> dochází k vytvoření primeru z templátového řetězce DNA
Jak se nazývá ten děj?.
virus vakcinie poxviry orthomyxoviry parvoviry filoviry.
+ssRNA viry obalené neobalené.
oncovirinae čeled papillomaviry čeled retroviry čeled reoviry.
genom retrovirů +ssRNA ssDNA -ssRNA genom je znázorňován jako křivka existují jako dimer v head-to-head orientaci.
Čí je to replikační cyklus viru?
1.vazba na receptor
2.fúze virového obalu s plazmatickou membránou nebo membránou endozomu
3.reverzní transkripce
4.integrace do genomu hostitelské buňky
5.transkripce virové RNA, sestřih a translace proteinů
6.morfogeneze virionů a uvolnění z buňky
7.po uvolnění z buňky následuje maturace virionů.
všechny RNA viry, kromě Orthomyxovirů, se replikují v cytoplasmě ano ne.
všechny -RNA viry musí mít vlastní RNA polymerázu ano ne.
|
