biologia molecolare tre

Quale elemento è presente solso nella trascrzione in vivo degli eucarioti e non in vitro?. il Mediatore. TBP. TAF. TFIIH.

cellule di E coli vengono fatte crescere in un mezzo di coltura che ha come unica fonte di C il gluccosio. Si aggiunge triptofano., le cellule continuano a crescere dividendosi ogni 30 minuti. Come cambiano i livelli di sintasi del triptofano, una proteina codificata dall'operone del triptofano , se il mRNA del triptofano è stabile, ossia viene degradato molto lentamente?. I livelli di sintasi del triptofano aumentano in modo esponenziale. Non ci sono abbastanza elementi per poter dare una risposta. I livelli di sintesi del triptofano restano elevati per molto tempo. Quando la concentrazione del triptofano (aggiunto al mezzo di coltura) è alta, i livelli di sintasi del triptofano diminuiscono significativamente a causa dell'attenuazione della traduzione dell'mRNA, anche se l'mRNA è stabile.

Qual'è la proteina centrale della ricombinazione omologa. RuvC che taglia i filamenti di DNA a livello della giunzione di Holliday. RecA che è il prototipo di una classe di proteine presenti in tutti gli organismi. RuvB che fornisce l'energa per lo scambio di appaiamenti. RecA presente solo nei Procarioti.

Qual modificazione avviene nel dominio CTD della RNA polimerasi durante fase di allungamento della trascrizione?. una fosforilazione. un'acetilazione. una metliazione. nessuna.

Un mRNA sintetico con sequenza ripetitiva 5'-CACACACACACACACACACACACA...-3' viene introdotto come stampo in un estratto cellulare usato come sistema di sintesi proteica in vitro. Assumendo che questa sintesi proteica inizi dal primo nucleotide della sequenza, senza bisogno di un codone di inizio, quale prodotto (o quali prodotti) ti aspetti di trovare dopo la sintesi?. Una proteina con sequenza alternata di due differenti amminoacidi. Una proteina con sequenza alternata di tre differenti amminoacidi. Due proteine con sequenza alternata di tre differenti amminoacidi. Una proteina contenente un solo tipo di amminoacido.

l risultato visto nello studio dei merodiploidi di Jacob e Monod che ha suggerito che la regione lacI agisse in trans per regolare l'operone lac era: Un mutante non funzionale lacI non può essere corretto da un allele lacI. Un mutante non funzionale lacO non può essere corretto da un allele lacO. Un mutante non funzionale lacI è corretto da un allele wild-type lacI . Un mutante non funzionale lacO è corretto da un allele wild-type lacO.

Quale dei risultati sperimentali di Avery dimostrò che il DNA è necessario e sufficiente alla trasformazione dei batteri?. L'aggiunta di DNA da solo permette la trasformazione. Le proteine da sole permettono la trasformazione. Rimuovendo il DNA dagli estratti cellulari ottenuti dal ceppo S la trasformazione non avveniva. Rimuovendo l'RNA dagli estratti cellulari ottenuti dal ceppo S la trasformazione non avveniva.

risulta in un triplex in cui tutti e tre i filimenti sono composti solo da purine. possono risultare nella formazione di una tripla elica all'interno di lunghe sequenze che contengono solo purine e pirimidine in un filamento. può creare interazioni addizionali AT. risulta in un triplex in cui tutti e tre i filimenti sono composti solo da purine. risulta in un tetraplex da uno strecht di residui di G.

Nel caso del long-patch BER negli eucarioti, le attività di tre proteine, oltre alla ligasi finale, provvedono ad allungare di alcuni nucleotidi il 3'OH e a tagliare via il tratto di DNA spostato. Di quali proteine si tratta? (Tutte tranne TFIIH). PCNA. DNA polimerasi ? o ?. FEN1. TFIIH.

Lo spliceosoma è coinvolto nello splicing di: Pre-mRNA nucleari eucariotici. tutti i mRNA. Pre-mRNA mitocondriali. Precursore dell'rRNA di Tetrahymena.

L'O 6 metil G permette alla guanina di appaiarsi sia con la citosina che con la timina, generando una lesione altamente citotossica. Come avviene la riparazione?. è riparata mediante la fotoliasi ed è una riparazione diretta. Mediante mismatch repair, non è una riparazione diretta. La riparazione della transmetilazione avviene da parte di una metiltransferasi ed è una riparazione diretta. Mediante riparazione per escissione dei nucleotidi, non è una riparazione diretta.

Quale superstruttura può essere assunta da un tratto di DNA a doppia elica che contiene una sequenza ripetuta e invertita?. Struttura Z. Struttura cruciforme. Struttura circolare. Struttura superavvolta.

Considerando una molecola di DNA duplex circolare superavvolta, qual'è la relazione che esiste tra le grandezze: "twist" (Tw), "writhe" (Wr) e "linking number" (Lk)?. Lk = Tw + Wr. Lk = Tw - Wr. Tw = Lk + Wr. Lk = Tw · Wr.

Il DNA viene danneggiato sia per cause endogene che per cause esogene. Gli errori sono dati: in maggior parte da agenti mutageni ambientali, quali raggi X, agenti chimici, UV. in maggior parte da agenti mutageni endogeni, quindi il DNA è danneggiato in condizioni fisiologiche da acqua, ossigeno e agenti alchilanti. con la stessa frequenza da agenti mutageni esogeni ed endogeni. da danni esogeni i stimati al giorno 50000 rotture della singola elica.

Perché il Codice Genetico è "degenerato"?. degenera fino ad esaurirsi. un amminoacido è codificato da più codoni. inserisce codoni non senso interrompendo la catena. porta all'apertura della forca replicativa.

I meccanismi di riparazione sono specifici per tipo di errore e funzionalmente conservat. La riparazione diretta del danno avviene. per escissione delle basi e dei nucleotidi. tramite fotoriattivazione e transmetilazione. per tolleranza per sintesi di translesione. per ricombinazione omologa.

Unità di espressione genica costituita da uno o più geni connessi e dalle sequenze dell'operatore e del promotore, che ne regolano la trascrizione: promotore. Operone. repressore. induttore.

La sequenza consenso -10 è TATAAT. Se due geni tipA e tipB hanno promotori con la stessa sequenza, a parte la regione -10, dove il promotore di XXX è TAATAT e quello di XXY è TGTCGA, quale gene sarà trascritto più efficacemente e perché?. viene trascritto più efficientemente tipB perché la sequenza in posizione 210 di tipA devia maggiormente dalla sequenza consenso e sarebbe più difficile da aprire, perché ha un contenuto di TA superiore. non c'è differenza vengono trascritte ugualmente. viene trascritto più efficientemente tipA perché la sequenza in posizione 210 di tipB devia maggiormente dalla sequenza consenso e sarebbe più difficile da aprire, perché ha un contenuto di GC superiore. viene trascritto più efficientemente tipA, perché è più simile alla sequenza originale del promotore.

Qual è il danno più comune dell'idrolisi sul DNA?. deaminazione della timina. rimozione di una citosina e formazione di un sito abasico. deaminazione della citosina ad uracile. rottura del legame glisodico tra le pirimidine ed il DNA.

Quale delle seguenti affermazioni è vera per la regione lacO dell'operone lac?. Mutazioni in questa regione portano all'espressione costitutiva del promotore. Codifica per la proteina del repressore Lac. Contiene il promotore dell'operone. Codifica per la proteina galattoside permeasi.

La T°C melting del DNA: è la T°C a cui il DNA si scioglie. è una Timina che viene eliminata e porta lla fusione del DNA. è la T°C a cui il 100% del DNA è denaturato. è la T°C a cui il 50% del DNA è denaturato.

L'immagine rappresenta la perdita di una purina che figura 7.1. deriva dall'alchilazione l'aggiunta di un gruppo alchile (metilico, etilico) agli atomi delle basi nucleotidiche o allo scheletro fosfodiesterico. non comporta alcun danno per la sequenza del DNA. corrisponde ad un processo di deaminazione. La deamnazione della citosina è alle base delle mutazioni di circa un 1/3 delle malattie genetiche umane. determina la formazione di un sito abasico (AP). I siti AP sono mutagenici, perché possono introdurre mutazioni, bloccano le DNA polimerasi e per questo sono potenzialmente citotossici.

Il codice genetico è: la traduzione dell'mRNA. la relazione tra sequenza nucleotidica e sequenza amminoacidica. l'informazione genetica del DNA. la trascrizione del DNA.

in E. coli la DNA polimerasi I: è un complesso multipeptidico con 10 diversi polipeptidi. Rha 4 domini funzionali ed 3 subunità. Riempire le brevi sequenze di DNA a singola elica che derivano dalla replicazione del DNA (lagging strand) e dalla riparazione, quando i nucleotidi danneggiati devono essere rimossi. ha un'alta processività, fedeltà un'attività esonucleasica 3'-5' (proof reading).

Perchè ciascuna forca replicativa richiede un filamento guida ed un filamento ritardato?. perchè l'elicasi svolgono un'elica più velocemente di un'altra. perchè i filamenti del DNA sono antiparalleli e la polimerasi può lavorare solo in una direzione. perchè la sintesi deve essere complementare. perchè la DNA polimerasi deve sintetizzare DNA dal 3' al 5'.

Le principali differenze nei processi di replicazione e trascrizione sono: solo nella trascrizione occorre un templato. la trascrizione ha come prodotto molte copie di RNA, la duplicazione ha come prodotto una copia del genoma che consiste in una molecola di DNA. la trascrizione avviene nel citoplasma e la replicazione nel nucleo. la trascrizione può iniziare in qualunque punto, mentre la duplicazione necessita di precise sequenze di inizio dette promotori.

Per denaturazione del DNA si intende: la separazione dei due filamenti per rottura dei legami idrogeno. la sostituzione di alcuni nucleotidi nel DNA. l'inattivazione di un gene. l'idrolisi del DNA.

Per palindrome si intende una particolare sequenza che può essere letta nello stesso modo da sinistra a destra e da destra a sinistra. Indicare quale delle seguenti sequenze di DNA a singolo filamento, diventa una palindrome associandosi al filamento complementare: 3'-CAAAGGTTTG-5'. 3'-GAGCCGGCTC-5'. 3'-GAGTAACTAC-5'. 3'-CGTATTATGC-5'.

In un amminoacil-tRNA: l'amminoacido è legato all'estremità 3'. l'amminoacido è legato all'estremità 5'. l'amminoacido è legato all'ansa anticodone. l'amminoacido è legato all'ansa della pseudouridina.

Un filamento di una molecola di DNA è interamente trascritto in RNA messaggero dalla RNA polimerasi: la composizione in basi del DNA utilizzato come stampo è C = 18,5%, G = 22,4%, A = 26,6%, T = 32,5%. La composizione in basi dell'RNA trascritto è: G = 18,5%, C = 22,4%, A = 32,5%, U= 26,6%. G = 32,5%, C = 26,6%, A = 18,5%, U= 22,4%. G = 26,6%, C = 22,4%, A = 18,5%, U= 32,5%. G = 22,4%, C = 18,5%, A = 26,6%, U= 32,5%.

Quali interazioni molecolari sono implicate nella stabilizzazione della doppia elica del DNA? (2 risposte corrette): Legami fosfodiesterici. Legami covalenti. Interazioni idrofobiche (impilamento delle basi). Interazioni di Van der Waals.

Nell' approccio sperimentale di Meselson e Stahl che portò le prove dell'ipotesi semiconservativa come il modello più probabile per la replicazione del DNA, quali radioisotopi e metodi di separazione sono stati usati?. Cellule radiomarcate con timidina [3H]. Batteri cresciuti in un mezzo contenente timidina [3H] fino a che l'intero DNA contenesse catene pesanti e quindi trasferite in un mezzo di coltura leggero e pesante per un ciclo di replicazione. Separazione su gradiente di densità. Batteri cresciuti in N14H4 e in N15 H4, separati conun'ultracentrifuga in un gradiente di densità di CsCl. Cellule infettate con il batteriofago T4 coltivate in presenza di radionuclidi, DNA analizzato con il gradiente CsCl gradiente.

La lettura di un segmento di DNA contenente il 20% di Adenina produrrà una sequenza di: RNA contenente il 20% di Timina. DNA contenente il 40% di Uracile. RNA contenente il 20% di Uracile. DNA contenente il 40% di Timina.

Quale di queste affermazioni relativa agli Enhancer è vera?. funzionano in entrambi i sensi. si trovano solo al centro del gene che regolano. sono specifici per un singolo gene. agiscono in trans.

Negli eucarioti, le famiglie geniche sono gruppi di: due o più geni, spesso collocati adiacenti l'uno all'altro nel genoma, che si sono formati per duplicazione di un singolo gene ancestrale, seguita da fenomeni di divergenza . I geni membri di una famiglia hanno sequenze codificanti, e quindi anche funzioni biochimiche simili . 100-500 geni, spesso collocati adiacenti l'uno all'altro nel genoma, che si sono formati per duplicazione di un singolo gene ancestrale, seguita da fenomeni di convergenza . I geni membri di una famiglia hanno sequenze codificanti, e quindi anche funzioni biochimiche simili. due o più geni, spesso collocati adiacenti l'uno all'altro nel genoma, che si sono formati per duplicazione di un singolo gene ancestrale, seguita da fenomeni di divergenza . I geni membri di una famiglia hanno sequenze codificanti, e quindi anche funzioni biochimiche diverse. 10-100 geni, spesso collocati in regioni anche distanti nel genoma, che si sono formati per duplicazione di un singolo gene ancestrale, seguita da fenomeni di divergenza . I geni membri di una famiglia hanno sequenze codificanti, e quindi anche funzioni biochimiche simili .

Una modalità NON utilizzata dai sistemi di riodellamento della cromatina: possono far slittare un nucleosoma in una diversa posizione. sostituire un nucleosoma con un altro che contenga una variante istonica. espellere un nucleosoma dal DNA. possono modificare l'estremità N terminale delle code istoniche.

Quali delle seguenti affermazioni sui superavvolgimenti solenoide e plectonemico è vero?. la formazione di superavvolgimenti solenoidi è sequenza specifico. solo i superavvolgimenti plectonemici sono stabilizzati dalla presenza di proteine. i superavvolgimenti plectonemici sono sempre sinistorsi, mentre quelli solenoidi sono destorsi. nel DNA rilassato i superavvolgimenti plectonemici sono tutti destorsi e i superavvolgimenti sinistorsi sono solenoidi.

l trans-splicing è una forma particolare di splicing dell'RNA, osservato per lo più in alcuni organismi: tutte e tre le risposte sono corrette. interessa solo organismi procariotici. le giunzione interessa esoni non consecutivi. la giunzione interessa molecole di RNA diverse.

Perchè mutazioni in BRCA2 sono responsabili del 50% di tumori al seno?. perchè la sua mancanza non permette una corretta riparazione del DNA. Il prodotto di BRAC2 interagisce con la proteina Rad51 e controlla la stabilità del genoma. Il gene BRCA2 stabilisce con Rad51 delle interazioni proteina-proteina. tutte e tre le risposte sono corrette.

Quali delle seguenti RNA polimerasi è responsabile della trascrizione degli RNA codificanti per proteine?. RNA polimerasi 3. RNA polimerasi 2. RNA polimerasi 1. RNA polimerasi 4.

Il complesso proteico detto caricatore della sliding clamp catalizza l'apertura ed il posizionamento della proteina sul DNA, allo stesso modo il caricatore rimuove la sliding clamp quando la sintesi del DNA è finita. Il caricatore è ATP dipendente, quando il caricatore si lega, le subunità ? e ? cambiano conformazione e possono in questo interagire con la pinza e determinarne l'apertura. Il caricatore è ATP indipendente, quando il caricatore si lega, le subunità ? e ? cambiano conformazione e possono in questo interagire con la pinza e determinarne l'apertura. il caricatore si comporta come una topoisomerasi. Ha sei ripiegamenti simmetrici ed formata da un dominio ripetuto tre volte in ogni monomero.

Quale delle seguenti proprietà chimiche dell'interazione tra purine e pirimidine non influenza struttura e funzione degli acidi nucleici?. la planarità delle basi. l'assorbanza agli UV. l'impilamento idrofobico. il tautomerismo delle basi.

Quale delle seguenti affermazioni NON è vera per l'operone lac: la trascrizione produce un singolo mRNA policistronic, che contiene lacZ, A e lac Y. Il gene lacI gene è controllato dallo stesso promotore del gene lacZ. Il repressore Lac è espresso costitutivamente. La regione dell'operatore regola la trascrizione attraverso l'interazione con la proteina repressore Lac.

Quali delle seguenti modificazioni sono utilizzate nei nucleotidi?. Metilazione. Glicosilazione. Modificazioni degli acidi grassi. Fosforilazione.

La fosforilazione della serina 5 degli eptapeptidi ripetuti nella coda CTD (YSPTSPS) della RNA polimerasi II consente il reclutamento degli enzimi coinvolti: nell'aggiunta della coda di poli(A). nell'aggiunta del cap al 5'. nello splicing degli introni. nella terminazione della trascrizione.

Cosa attiva l'amminoacido legato al tRNA?. PiPi. GADH. GDP. AMP.

quali funzioni dell'RNA sono dipendenti dalla sua struttura terziaria?. trasportatore di aminoacidi al sito di di sintesi proteica. tutte. ruolo catalico splicing e trascrizione. trasportatore transiente di informazione genetica.

L'istone H1 linker: Piccola proteina globulare con una coda N-ter di 20-35aa, 80 residui nel dominio centrale globulare e e regione Cter di 100 residui. appartiene ad una struttura di supporto detta scaffold. promuovono la condensazione del DNA, necessarie alla segregazione dei cromosomi durante la mitosi, implicate nei meccanismi di riparazione. si assembla in un tetramero con H3-H4.

La particolare instabilità dell'RNA (rispetto alle molecole di DNA) è dovuta alla presenza di un gruppo ..... sulla posizione 2' del ribosio: amminico. metilico. fosforico. ossidrilico.

Il complesso del MEDIATORE: è un complesso di oltre 4 subunità, molto conservato tra lievito e mammiferi. è un importante componente per la formazione del PIC (complesso di pre-inizio della trascrizione), molto conservato tra lievito e mammiferi. lega direttamente la RNA polimerasi mitocondriale. è un importante componente per la inibizione del PIC (complesso di pre-inizio della trascrizione), molto conservato tra lievito e mammiferi.

L'acetilazione degli istoni gioca un ruolo biologico fondamentale nella maggior parte dei processi coinvolti nella regolazione della trascrizione. I principali enzimi coinvolti: Le istondeacetilasi (HDAC) che si dividono in 2 diversi gruppi A e B, e le acetiltransferasi. Le istondeacetilasi catalizzano il trasferimento di un gruppo acetile all'amino gruppo in posizione ? delle catene laterali di lisina ed utilizzano come cofattore il Coenzima A. Ciò neutralizza la carica positiva della lisina e indebolisce l'interazione fra gli istoni ed il DNA. Le due principali classi A e B si distinguono perché la classe A acetila gli istoni sulla cromatina e la classe B gli istoni liberi nel citoplasma. Le acetiltransferasi, svolgono la funzione opposta di ristabilire la carica positiva sulla lisina. Ci sono 4 classi di enzimi, di cui solo la classe III richiede uno specifico cofattore NAD+. Le acetiltransferasi, che si dividono in 2 diversi gruppi acetiltransferasi (HAT) A e B, e le istondeacetilasi. Le acetiltransferasi catalizzano il trasferimento di un gruppo acetile all'amino gruppo in posizione ? delle catene laterali di lisina ed utilizzano come cofattore il Coenzima A. Ciò neutralizza la carica positiva della lisina e indebolisce l'interazione fra gli istoni ed il DNA. Le due principali classi A e B si distinguono perché la classe A acetila gli istoni sulla cromatina e la classe B gli istoni liberi nel citoplasma. Le istondeacetilasi (HDAC) svolgono la funzione opposta di ristabilire la carica positiva sulla lisina. Ci sono 4 classi di enzimi, di cui solo la classe III richiede uno specifico cofattore NAD+. Le acetiltransferasi, che si dividono in 4 diversi gruppi acetiltransferasi (HAT), e le istondeacetilasi, che si dividono in gruppo A e B. Le istondeacetilasi (HDAC) catalizzano il trasferimento di un gruppo acetile all'amino gruppo in posizione ? delle catene laterali di lisina ed utilizzano come cofattore il Coenzima A. Ciò neutralizza la carica positiva dell'arginina e indebolisce l'interazione fra gli istoni ed il DNA. Le due principali classi A e B si distinguono perché la classe A acetila gli istoni sulla cromatina e la classe B gli istoni liberi nel citoplasma. Le acetiltransferasi svolgono la funzione opposta di ristabilire la carica positiva sulla lisina. Ci sono 4 classi di enzimi, di cui solo la classe III richiede uno specifico cofattore NAD+. Le acetiltransferasi, che si dividono in 4 diversi gruppi acetiltransferasi (HAT), e le istondeacetilasi, che si dividono in gruppo A e B. Le istondeacetilasi (HDAC) catalizzano il trasferimento di un gruppo acetile all'amino gruppo in posizione ? delle catene laterali di lisina ed utilizzano come cofattore il Coenzima A. Ciò neutralizza la carica positiva dell'arginina e indebolisce l'interazione fra gli istoni ed il DNA. Le due principali classi A e B si distinguono perché la classe A acetila gli istoni sulla cromatina e la classe B gli istoni liberi nel citoplasma. Le acetiltransferasi svolgono la funzione opposta di ristabilire la carica positiva sulla lisina. Ci sono 4 classi di enzimi, di cui solo la classe III richiede uno specifico cofattore NAD+.

Nell'immagine è visualizzato un meccanismo di riparazione. Quale? perchè si dice che il meccanismo è diretto? figura 7.2. E' un esempio di riparazione per escissione dei nucleotidi e non è una riparazione diretta. E' riparata la formazione dei dimeri che si formano tra due pirimidine dopo esposizione agli UV. E' un esempio di mismatch repair, non è una riparazione diretta. E' una riparazione della transmetilazione da parte di una achilmetiltransferasi ed è una riparazione diretta.

Quale delle seguenti caratteristiche della replicazione del DNA NON è la stessa per la trascrizione dell'RNA?. L'inizio richiede il riconoscimento di una specifica sequenza del DNA. L'inizio della sintesi richiede un primer. La sintesi richiede un templato. La sintesi è catalizzata in direzione 5'->3'.

Quale forma ha la molecola tridimensionale di tRNA?. S. L. O. V.

Una mutazione nel gene RuvB potrebbe: aumentare il legame di RuvB al DNA. aumentare il legame di RuvA al DNA. ridurre la resistenza agli UV. aumentare gli eventi di ricombinazione del DNA.

Qual è il corretto ordine degli eventi trascrizionali che avvengono dopo che la polimerasi si è legata al promotore?. Inizia la sintesi dell'RNA,formazione del complesso aperto, formazione del complesso chiuso, clearance del promotore. formazione del complesso chiuso, , formazione del complesso aperto, clearance del promotore, inizio della sintesi dell' RNA. formazione del complesso aperto, formazione del complesso chiusoo, inizio della sintesi dell' RNA, clearance del promotore. formazione del complesso chiuso, formazione del complesso aperto, inizio della sintesi dell' RNA, clearance del promotore.