Test způsoby přírodovědy velmi malých rozměrů

ERASED TEST, YOU MAY BE INTERESTED ON způsoby přírodovědy velmi malých rozměrů

COMMENTS	STATISTICS	RECORDS

TAKE THE TEST

Title of test:
způsoby přírodovědy velmi malých rozměrů

Description:
tož tak to máš

Author:

Bohuš Stejskal

Other tests from this author

Creation Date:
09/01/2024

Category: Others

Number of questions: 222

Share the Test:

New Comment

No comments about this test.

Content:

Které enzymy nejsou součástí restrikčně-modifikačních systémů bakterií? a) DNA polymerázy b) DNA metyltransferázy c) RNázy d) Restrikční endonukleázy.
Amplikon: a) Replikovaná DNA b) Produkt PCR c) Templát d) Pár primerů.
Co je to templát? a) Amplifikovaná DNA b) Produkt PCR reakce c) Molekula DNA, která slouží jako vzor pro tvorbu její kopie d) Oligonukleotid.
Hmotnostní spektrometrie rozlišuje částice podle: Rozdílu hmotnosti Poměru náboje a povrchu Poměru hmotnosti a náboje Četnosti iontů.
Které enzymy nejsou součástí restrikčně-modifikačních systémů bakterií? DNA polymerázy DNA metyltransferázy RNázy Restrikční endonukleázy .
Vyjádřením afinity je hodnota? Tm Náboj proteinu Kd Velikost proteinu .
K čemu se využívá SDS-PAGE? K rozdělení proteinů dle molekulové hmotnost K rozdělení proteinů dle tvaru K rozdělení proteinů dle hustoty náboje K rozdělení proteinů dle počtu disulfidových vazeb.
Co je to templát? Amplifikovaná DNA Produkt PCR reakce Molekula DNA, která slouží jako vzor pro tvorbu její kopie Oligonukleotid.
K připojení fosfátové skupiny (fosforylaci) k substrátu se obecně využívá enzymů: Nukleáz Polymeráz Fosfatáz Kináz.
Kterou látku lze použít při precipitaci DNA jako nosiče pro lepší výtěžek? Chloroform tRNA octan sodný ethanol.
Jaká metoda se používá pro separaci proteinů před Westernovým přenosem? SDS-PAGE Nativní PAGE Elektroforéza v agarozovém gelu Imunodetekce.
K optimální separaci produktů štěpení plazmidu o velikosti 4kbp restriktázou štěpící na dvou vzdálených místech využijí: ? Nativní PAGE s 10% obsahem PA Denaturační PAGE s 20% obsahem PA SDS-PAGE Agarozové elektroforézy s 1-2% agarozou .
Která značka není používána jako TAG? Proteáza A GFP GST MBP.
K přípravě jednořetězcové DNA z dvouřetězcové enzymatickou cestou lze využít: Exonukleáza fága lambda při existenci jednoho 5‘ PO3 konce ve dvouřetězci DNA Nukleáza EXOIII při existenci recesivního 3‘ OH konce ve dvouřetězci DNA Exonukláza fága lamba při existenci 5‘ OH konce ve dvouřetězci DNA Nukleáza EXOIII při existenci recesivního 5‘ PO3 konce ve dvouřetezci DNA.
Při přípravě cDNA knihovny z transkriptomu využíváme sledu reakcí: Izolace RNA-rozštěpení DNázou I- reverzní transkripce-amplifikace DNA PCRúprava konců restriktázou- ligace vektoru- ligázou Amplifikace DNA PCR- rozštěpení DNázou I- reverzní transkripce-úprava konců restriktázou-ligace do vektoru ligázou- izolace RNA Izolace RNA- amplifikace PCR- úprava konců restriktázou- reverzní transkripceligace do vektorů ligázou- rozštěpení DNA DNázou I Izolace RNA → reverzní transkripce → amplifikace DNA PCR-rozštěpení DNA DNázou I- úprava konců restriktázou- ligace do vektoru ligázou.
Který krok není součástí imunoprecipitace? Filtrace Precipitace Eluce Promytí.
Jaká forma plasmidové DNA putuje v agarozovém gelu nejrychleji? Otevřená kružnicová Superhelikální Lineární Všechny putují stejně rychle.
V jakém rozmezí (ve Svedbergových jednotkách) se pohybují sedimentační koeficienty biomakomolekul? 1000-10000 S 100-10000 S 100-1000 S 1-100 S.
Mezi tzv. next-generation sequencing platformy se neřadí: SOLiD SMRT/PacBio Oxford NanoPore Illumina .
Při zahřívání dsDNA dochází k Denaturaci- tvorbě dsDNA ze dvou molekul ssDNA Denaturaci- tvorbě dvou molekul ssDNA Renaturaci- tvorbě dvou molekul ssDNA Renaturaci- tvorbě dsDNA ze dvou molekul ssDNA.
Vyberte faktory, které ovlivňují pohyblivost proteinů v nedenaturačním gelu. Hustota náboje Tvar Koncentrace akrylamidu Velikost.
Která látka snadno proniká do živých eukaryotických buněk? Žádná z možností není správná WST1 MTT MTS.
Jak se nazývá metoda využívající hybridizace vzorků, nanesených na membránu ve formě teček, se značenou sondou? DNA microarray Dot blot Southern blot Fluorescenční in situ hybridizace.
Které testy patří do skupiny testů viability? Testy změn integrity membrán Testy metabolické aktivity Klonogenní testy Elektroforetické testy.
Specifickým partnerem pro interakci s biotinem je: Avidin Steptovidin Streptavidin Biovidin.
Produkty štěpení DNA restrikčními endonukleázami mohou mít obecně: G-bohaté konce Pouze kohezní (sticky) konce Tupé nebo kohezní konce Pouze tupé (blunt) konce .
Pro FRET musí být donorové a akceptorové molekuly od sebe vzdáleny typicky: 0-1 A 100-500 A 10-100 A 10-100 nm 1-10 nm.
V jakém médiu bývají kultivovány buňky při klonogenních testech? DMEM médium Agarové misky RPMI médium Polotekutý agar .
Metoda fluorescenční polarizace využívá na vstupu: Lineárně polarizovaného světla Rozptýleného světla Depolarizovaného světla Odraženého světla .
Co je prvním krokem při RT- PCR? Reverzní transkripce Štěpení RNA Reverzní translace Polymerace při pokojové teplotě .
Jaký typ přenosu (blotu) se používá pro přenos proteinů? Easternův Northernový Southernový Westernový.
K jakým procesům dochází při stabilní transfekci? DNA se nezačleňuje do genomu V jedné buňce se většinou nenachází více kopií transgenu V jedné buňce se nachází vyšší počet kopií transgenu DNA se začleňuje do chromozomu.
Která z metod není vhodná na studium protein-protein interkací? Imunoprecipitace SPR FRET RT-PCR .
K čemu dochází pro PCR při vysokém počtu cyklů? Dochází ke vzniku nespecifických PCR produktů, vyčerpání komponent reakce, degradaci DNA- polymerázy i DNA Dochází k obrácenému průběhu PCR Dochází k prodloužení PCR produktů Dochází k degradaci PCR produktů .
Pro stanovení síly integrace protein-DNA jsou vhodné metody: X-ray ITC SPR EMSA.
Nejobvyklejším kofaktorem DNázy I pro náhodné štěpení je: Mg 2+ Zn 2+ K+ Ca 2+ Mn 2+.
Jaké látky se používají pro eluci his tagovaných proteinů z kolony HisTrap? Glutathion GST Nízké pH Imidazol.
Která z těchto molekul DNA má nejvyšší vznášivou hustotu? Zastoupení bází v DNA nemá vliv DNA bohatá na A/T DNA bohatá na G/C DNA bohatá na A.
Vysokoafinitní interakce mezi DNA-proteiny jsou v rozmezí Kd: nM-μM mM-M μM-mM nM-mM.
Sekvence syntézou /polymerací využívají tyto sekvenční metody/platformy: Illumina (Oxford) NanoPore Tzv. Maxam-Gilbertovo sekvenování Tzv. Sangerovo sekvenování (+ pyrosekvenování ) .
MBP je protein vážící: Malé proteiny Manosu Maltozu Mukozu.
Elektroforetická metoda využívaná pro srovnání exprese souboru proteinů za různých podmínek se označuje: TEMED 2D-DIGE Diferenční dvourozměrná gelová elektroforéza Pulzní gelová elektroforéza .
Čeho je potřeba dosáhnout ve 2. kroku purifikace proteinů? Získání hustého homogenitu nebo extraktu s většímu i menšími molekulami z cytosolu Získání organel v neporušeném stavu Rozbití buněk nebo tkáně Získání suspenze buněk nebo tkáně .
Jakým způsobem může být naznačena sonda pro hybridizaci nukleových kyselin? Radioaktivně, fluorescenčně nebo enzymaticky Jen enzymaticky Jen fluorescenčně Jen radioaktivně .
FPLC používá nejčastěji pro detekci proteinů: VIS-detektor Detektor vodivosti UV detektor Detektor FAC .
Izoelektrický bod proteinu udává pH při které se protein denaturuje teplotu při které je protein nabitý pH při kterém je celkový náboj proteinu nulový oblast proteinu s nejvyšším lokálním pozitivním nábojem .
Jaké látky NELZE použít pro vytvoření gradientního roztoku? Ribozomální podjednotky Nukleové kyseliny Sacharóza Percoll.
Držitelem nobelovy ceny za vývoj systému CRISPR/Cas9 je i: J. Doudna E. Charpentier T. Cech J. Watson .
Který z těchto enzymů nepatří mezi nukleázy: DNáza I T4 polynukleotid kináza EcoRV Cas9.
Jaké látky je možné využít pro nespecifické obarvení všech proteinů v gelu? Dusičnan stříbrný Protilátky Coommassie Brillant Blue G Ponceau S.
Při Sangerově sekvenování se využívá zastavení syntézy DNA pomocí modifikovaných nukleotidů: 2‘, 3‘-dideoxy NTP 7- deaza dNTP 5- methyl dNTP 2-amino dNTP .
Polymerace polyakrylamidových gelů je iniciována: TEMED (tetrametylen diamin) EDTA (etylendiamintetraacetát) APS (amonium persulfát) SDS (sodium dodecylsulfát) .
Pull down assay se používá na: Izolaci nespecifických proteinů pomocí proteinu G Izolaci nespecifických proteinů pomocí proteinu A Izolaci specifických proteinů pomocí Ab Izolaci proteinů imunitní odpovědi .
Vyberte geny, které patří mezi reportérové geny Geny pro chloramfenikol defosforylázu Geny pro beta-glukuronidázu Geny pro hygromycin esterifikázu Geny pro luciferázu .
RNA sloužící jako lokalizační součást komplexu CRISPR/Cas9 se nazývá: Transfer RNA Messenger RNA Guide RNA Micro RNA.
Vyberte NEpravdivá tvrzení týkající se monoklonálních protilátek Získávají se ze séra imunizovaných laboratorních zvířat Reagují s více epitopy Jsou specifické pouze k jednomu epitopu Jsou produkovány pomocí hybridomů .
Grafickým znázorněním četnosti iontů na hodnotě m/z je: Hmotnostní spektrum Klenowův fragment DNA plot I Dnáza I Grafické spektrum.
Na čem závisí rychlost sedimentace částic při izopyknické centrifugaci Hustotě částic Hmotnosti částic Tvaru částic . Náboji částic .
Co je to multiplex PCR? PCR s jedním párem primerů PCR s více páry specifických primerů PCR s více DNA plymerázami PCR s více RNA plymerázami .
Imunofluorescence využívá protilátky značené s: Chemochromem Imuochromem Chluorochromem Fluorochromem.
K čemu slouží dodecylát sodný při přípravě vzorků pro SDS- PAGE? Eliminaci disulfidových vazeb v proteinech Zachování disulfidových vazeb v proteinu Zamaskování vlastního náboje proteinu Denaturaci proteinu.
Která z těchto látek slouží k enzymatickému štěpení buněčných membrán? Dodecylsíran sodný (SDS) Triton X-100 Lysozym Bovinní sérový albumin (BSA).
Izokaudemery jsou: Restrikční enzymy, které štěpí stejná cílová místa, ale vytvářejí odlišné konce Restrikční enzymy, které štěpí stejná cílová místa a vytvářejí stejné konce Restrikční enzymy, které štěpí odlišná cílová místa a vytvářejí odlišné konce Restrikční enzymy, které štěpí odlišná cílová místa, ale vytvářejí stejné konce. .
Jaké je přibližné zastoupení mRNA v celkové RNA buňky? 5% 80% 50% 10-20% .
Pro separační superhelikální plasmidové DNA pomocí zonální centrifugace lze využít: Gradientu dextrozy Gradientu sacharózy Gradientu percollu Gradientu CsCl/EtBr.
Jaký typ přenosu (blotu) se používá pro přenos RNA? Easternův Northernový Westernový Southernův.
Kolikrát byl (v průměru) jeden nukleotid/ oblast DNA osekvenován (získána informace o jeho primární struktuře) označuje? Pokrytí (coverage) Čtení (read) Knihovna (library) Hloubka (seq. depth).
Z jakého materiálu je membrána používaná při Southernově nebo Northernovém přenosu? Nylon PVC Nitrocelulóza PVDF.
Za výzkum elektroforézy obdržel Nobelovu cenu Arthur Kornberg Frederick Sanger Arne Tiselius Linus Pauling .
Obecně nejvyšší délku čtení (délku jednoho osekvenovaného fragmentu DNA) poskytuje metoda/platforma SoliD (Oxford) NanoPore (+ SMRT- pacific biosciences) Illumina Sangerovo sekvenování pomocí kapilárního sekvenátoru.
Mezi hlavní DNA vazebné domény patří Zinc-thumb Helix-turn-helix Turn Zinc-finger.
Pro kvantitativní stanovení protein-protein interakcí lze použít metody: IP Fluorescenční anizoterapie WB SPR.
. Pro spojení fragmetnů DNA po restrikčním štěpení je výhodné mít: Komplementární kohezní konce Telemetrické konce Nekomplementární kohezní konce Jeden konec tupý a jeden kohezní .
Čeho je potřeba dosáhnout ve 3. kroku purifikace proteinů? Získání suspenze buněk nebo tkáně -1.krok Získání hustého homogenitu nebo extraktu s většímu i menšími molekulami z cytosolu Získání organel v neporušeném stavu Rozbití buněk nebo tkáně – 2. krok .
Vazby proteinů na DNA se účastní Peptidová vazba mezi Arg a guaninem Vodíková vazba mezi Arg a Guaninem Vodíková vazba mezi Gln a Adeninem Peptidová vazba mezi Gln a Adeninem .
Co se děje v prvním kroku PCR cyklu při denaturaci DNA? PCR reakční směs se zahřeje na 94-96°C a oba DNA řetězce se oddělí PCR reakční směs se ochladí na 4°C, což umožní oddělení DNA řetězců PCR reakční směs se zahřeje na 72°C a DNA-polymeráza přidává nukleotidy k 3‘ koncům PCR reakční směs se ochladí na 50-65°C, což umožní primerům se navázat na ?.
Vyberte správné tvrzení o FRET: Emisní spektrum akceptoru se musí překrývat s absorbčním spektrem donoru Absorbční spektrum akceptoru se musí překrývat s emisním spektrem donoru Orientace dipolu donoru a akceptoru musí být přibližně antiparalelní Orientace dipolu donoru a akceptoru musí být přibližně paralelní .
Jak se nazývá metoda využívající vazby značených sond a mikroskopie, kterou lze využít pro lokalizaci nukleových kyselin v buňkách? Southern blot Dot blot Dna microarray Fluorescenční in situ hybridizace.
Při izoelektrické fokusaci se využívá gelu s gradientem Koncentrace polyakrylamidu pH teploty koncentrace Na+ inotů .
Při iontoměničové chromatografii je vazba proteinu na matrix závislá na: pH Interakci enzym-substrát Velikosti proteinů Iontové síle .
Jaké bude průměrné pokrytí při sekvenaci celého haploidního lidského genomu (3mld. Párů bází) pomocí plně využité platformy HiSeq X 10 6 84 2.
Jaký je základní postup při precipitaci DNA? Přidání octanu sodného, 2. přidání 100% ethanolu, 3. promývání 80% ethanolem, 4. odebrání supernatantu a rozpouštění DNA Přidání 100% ethanolu- promývání 80% ethanolem- přidání octanu sodnéhoodebrání supernatantu a rozpuštění DNA Přidání octanu sodného- přidání 80% ethanolem- promývání 100% ethanolem- odebrání supernatantu a rozpuštění DNA Přidání 80% ethanolu- promývání 100% ethanolem- přidání octanu sodnéhoodebrání supernatantu a rozpuštění DNA.
Který z těchto enzymů nepatří mezi deoxyribonukleázy? RNáza H Restrikční endonukleáza Smal DNáza I Nukleáza S1.
K internímu značení řetězce DNA, tzv. nick-translaci, lze využít enzymu: DNA polymeráza I Klenowův fragment DNA pol I T4 DNA ligáza DNáza I.
Mezera (gap) v případě struktury nukleových kyselin /biotechnologií označuje: Jednořetězcový koncový přesah dvouřetězcové molekuly Místo vazby enzymu DNáza I Delší jednořetězcovou oblast v rámci dvouřetězcové molekuly Sekundární strukturu DNA nebo RNA harakterizovanou tvorbou guninových ….
Podle velikosti proteinů lze separovat prostřednictvím: Iontoměničové chromatografie Afinitní chromatografie Gelové chromatografie sloupcové chromatografie.
Afinitní značka oligo His6 má sekvenci: HHHHHH HH GKPIPI YPYDVP.
Podle jaké vlastnosti se proteiny separují při SDS-PAGE? Hustota náboje Tvar Vlastní náboj proteinu Molekulová hmotnost .
Z jaké bakterie byla vyizolována první restrikční endonukleáza (Hindll) Escherichia coli Haemophilus influenzae Deinococcus radiodurans Chlamydia trachomatis.
Náboj nukleových kyselin za fyziologického pH je dán: Přítomností atomu kyslíku v heterocyklu (deoxy)ribozy Množstvím asociovaných molekul vody Přítomností fosfátové skupiny v cukr-fosfátové páteři Přítomností aminoskupin dusíkatých bází .
Celkový náboj proteinu v příslušném pH je dán: Součtem aktuálních nábojů jednotlivých aminokyselin Sekundární strukturou proteinu Přítomností etanolu v roztoku proteinu Obsahem glycinu a alaninu v proteinu .
Jaké jsou hlavní kroky PCR cyklu? Nasedání primerů (annealing) Degradace primerů (annealing) Prodloužení DNA řetězce (extension) Denaturace DNA .
Na jakou oblast protilátky se váže protein A? CL VL CH FC.
Neoschizomery jsou: restrikční enzymy, které štěpí stejná cílová místa a vytvářejí stejné konce restrikční enzymy, které štěpí stejná cílová místa, ale vytvářejí odlišné konce restrikční enzymy, které štěpí odlišná cílová místa a vytvářejí odlišné konce restrikční enzymy, které štěpí odlišná cílová místa, ale vytvářejí stejné konce.
Pro analýzu genové translace je možné použít: IP RT-PCR WB ELISA.
Jakými způsoby může být značena sekundární protilátka křenovou peroxidázou fluorescenční značkou žádná z možností není správná alkalickou fosfatázou.
Průtokové cytometrie lze použít pro analýzu buněčného cyklu díky: fluorescenčnímu barvení DNA imunofluorescenčnímu barvení membrán fluorescenčnímu barvení lipidů imunohistochemickému barvení proteinů.
Detekce jednotlivých tkáňových antigenů pomocí specifických primárních protilátek využívá metod? Imunoelektrochemie Imunologie Imunohistochemie imunofluorescence.
Jaký typ molekul je přenášen při Northernovém přenosu DNA DNA i RNA RNA proteiny.
Principiální rozdíly mezi tzv. next generation a 3rd generation sekvenováním jsou: pro NGS jsou fragmenty vstupující do sekvenace amplifikovány, pro 3rd gen. ne 3rd gen. poskytuje velmi dlouhá čtení, oproti relativně krátkým v případě NGS 3rd gen. je vždy založeno na sekvenaci syntézou, NGS ne nejsou žádné.
Jaké postupy lze využít pro rozbití buněk nebo tkáně ve 2. kroku purifikace proteinů? použitím detergentu na perforaci plasmatické membrány protlačením buněk malým otvorem rozbitím buněk těsnícím rotačním pístem v tlustostěnné nádobce rozbití ultrazvukem.
Které metody patří mezi biochemické metody sloužící k přenosu DNA do buněk? transfekce za použití virových vektorů transfekce zprostředkovaná fosforečnanem vápenatým transfekce elektroporací transfekce lipofekcí .
Na dvoudimenzionální elektroforéze separujeme ve dvou směrech proteiny podle izoelektrického bodu a velikost izoelektrického bodu a teploty tání velikosti a teploty tání velikosti a tvaru.
K čemu slouží Westernův přenos? rozdělení proteinů v gelu dle molekulové hmotnosti přenosu proteinů rozdělených elektroforézou z membrány na gel přenosu proteinů rozdělených elektroforézou z gelu na membránu odbarvení proteinů.
Zkratka ITC vyjadřuje ionizační termální kalorimetrii ionizační termální kalorimetrii izotermální titrační kalorimetrii izotermickou termální kalorimetrii.
Nejčastější využití termostabilních DNA polymeráz je při: nick-translaci terminálním značení DNA polymerázové řetězové reakci (PCR).
Které skupiny můžeme řadit mezi obvyklé donory při FRET? Cy3 GAL4 Streptavidin Fluorescein.
Která metoda se využívá pro přenos DNA do bakteriálních buněk? transfekce centrifugace transformace sonikace.
čemu slouží hodnota IC50? Ke stanovení testovaných látek, které jsou schopné inhibovat určitý biologický proces právě u 50 různých buněčných linií Ke stanovení koncentrace testované látky, která je schopná stimulovat určitý biologický proces právě u 50 různých buněčných linií Ke stanovení koncentrace testované látky, která je schopna inhibovat určitý biologický právě na polovinu Ke stanovení koncentrace testované látky, která je schopná stimulovat určitý biologický právě o polovinu.
K čemu slouží dodecylsulfát sodný při přípravě vzorků pro SDS-PAGE? zamaskování vlastního náboje proteinu eliminaci disulfidových vazeb v proteinech zachování disulfidových vazeb v proteinu denaturaci proteinu.
Pro studium funkčnosti regulační oblasti genu lze použít: kvasinkový dvouhybridní systém Sangerovo sekvenování centrifugace luciferázový reporterový test.
Jakou minimální sekvenační kapacitu potřebujete pro osekvenování genomu E. coli (4,6 mil. Párů bazí) s průměrným pokrytím 8? cca 37 mil. pb cca 4,6 mil. pb cca 1000 mil. pb 0,57 mil. pb .
Která z metod je denaturační? ultracentrifugace MS analýza imunoprecipitace cryoEM.
Které z těchto enzymů patří mezi deoxyribonukleázy? restrikční endonukleáza Smal DNáza I Nukleáza S1 RNáza H.
Jaký roztok se používá při izolaci RNA pomocí fenol-chloroformové extrakce? Guanidium thiokyanát: fenol : chloroform, pH 4,5 Guanidium thiokyanát: fenol : chloroform, pH 8,0 Fenol : chloroform : isoamylalkohol, pH 4,5 Fenol : chloroform : isoamylalkohol, pH 8,0.
K separaci se proteinů obvykle využívá: PAGE s 20 % obsahem PA SDS-PAGE agarozové elektroforézy s 1% agarozou pulsní gelové elektroforézy.
Který z těchto enzymů patří mezi restrikční endonukleázy? Bal31 Nukleáza S1 EcoRV DNáza I.
Které enzymy jsou součástí restrikčně-modifikačních systémů bakterií? DNA polymerázy RNázy DNA metyltransferázy restrikční endonukleázy.
Metody PLA využívá pro detekci komplexů: hybridizaci centrifugaci elektroforézu imunoprecipitaci.
Která z těchto molekul DNA má nejnižší vznášivou hustotu? DNA bohatá na G/C DNA bohatá na G DNA bohatá na A/T zastoupení bazí v DNA nemá vliv.
Které metody mohou být využity pro přenos DNA do buněk? transformace centrifugace transfekce elektroporace.
Sekvenační metoda sloužící pro kvantifikaci RNA při analýze transkriptomu se označuje: ChIP seq targeted resequencing whole genome sequencing RNA seq.
Izokaudamery jsou: restrikční enzymy, které štěpí stejná cílová místa a vytvářejí stejné konce restrikční enzymy, které štěpí odlišná cílová místa a vytvářejí odlišné konce restrikční enzymy, které štěpí stejná cílová místa, ale vytvářejí odlišné konce restrikční enzymy, které štěpí odlišná cílová místa, ale vytvářejí stejné konce.
Jaký typ přenosu (blotu) se používá pro přenos DNA? Westernový Southernův Earstenův Northernový.
Které jsou hlavní komponenty PCR? templátová DNA Taq DNA polymeráza DNáza I reakční pufr.
Tzv. protein-DNA Footprinting je založeno na detekci: DNA sekvence chráněné proteinem před účinkem DNásy I detekci pyrofosfátu uvolněného při syntéze DNA prostřednictvím luciferázy DNA polymerázy při syntéze prostřednictvím luciferázy průchodu sekvenované molekuly hemolysinovým pórem a detekci elektrického signálu.
Která z těchto metod není založena na využití hybridizace nukleových kyselin? testy komplementarity sekvencí Westernový přenos lokalizace genů na chromozomech analýza genové exprese.
Principiálním výsledkem sekvenačního experimentu je informace o: pořadí (deoxy)ribonukleotidů v molekule DNA nebo RNA primární struktuře DNA nebo RNA délce DNA nebo RNA řetězce sekundární struktuře DNA nebo RNA.
Jaké částice lze při diferenciální centrifugaci oddělit? heterogenní částice v homogenním roztoku heterogenní částice v heterogenním roztoku homogenní částice v homogenním roztoku homogenní částice v heterogenním roztoku.
Zkratka PLA znamená: polymerase luminiscence assay proximity ligation assay polymerase ligation assay polymerase luciferase assay.
Pro afinitní purifikaci proteinů s GST je jako imobilizovaný interakční partner použit: glutathion streptavidin chelát niklu biotin.
Čeho je třeba dosáhnout v 1. kroku purifikace proteinů? získání hustého homogenitu nebo extraktu s většími i menšími molekulami z cytosolu získání suspenze buněk nebo tkáně rozbití buněk nebo tkáně získání organel v neporušeném stavu.
Fragmenty nukleových kyselin o velikosti v řádech stovek kbp bychom nejlépe separovali pomocí: agarozové elektroforézy s 1% agarozou pulsní gelové elektroforézy SDS-PAGE PAGE s 20% obsahem pA.
Jaký typ plasmidové DNA putuje v agarozovém gelu nejrychleji: otevřená kružnicová lineární superhelikální všechny putují stejně rychle.
Který krok je vynechán u metody AlphaLISA při porovnání s metodou ELISA? promývání vazba druhé protilátky na protein vazba druhé protilátky vazba proteinu na první protilátku.
Izoschizomery jsou: restrikční enzymy, které štěpí stejná cílová místa a vytvářejí stejné konce restrikční enzymy, které štěpí stejná cílová místa, ale vytvářejí odlišné konce restrikční enzymy, které štěpí odlišná cílová místa a vytvářejí odlišné konce restrikční enzymy, které štěpí odlišná cílová místa, ale vytvářejí stejné konce.
Pro separaci buněčných organel pomocí zonální centrifugace lze využít: gradientu dextrózy gradientu CsCl/EtBr gradientu Percollu gradientu sacharózy.
Kolik cyklů nejčastěji mívá PCR? PCR mívá nejčastěji 45-55 cyklů PCR mívá nejčastěji 5-15 cyklů PCR mívá nejčastěji 25-35 cyklů PCR mívá nejčastěji 15-25 cyklů.
Tzv. SOLiD sekvenování je založeno na: průchodu sekvenované molekuly hemolysinovým pórem a detekci elektrického signálu detekci pyrofosfátu uvolněného při syntéze DNA prostřednictvím luciferázy postupné ligaci fluorescenčně značených oktamerních oligonukleotidových sond inkorporaci fluorescenčně značených terminátorů polymerace a snímání fluorescence.
Restrikční endonukleázy štěpí: jednořetězcovou DNA dvouřetězcovou DNA jednořetězcovou RNA jednořetězcovou a dvořetězcovou DNA.
Pro frakcionaci buněk dle určitých vlastností lze využít metody: konfkální mikroskopie FACS FRET PCR.
DNA ve stejnosměrném el. poli putuje k anodě nepohybuje se denaturuje pohybuje se ke katodě .
Pro doplnění delta přesahů je možné použít Klenowovu polymerázu S1 nukleázu DNA ligázu nelze doplnit .
Pro denaturaci proteinů při denaturační PAGE se používá nízké pH a vysoká teplota vysoká koncentrace soli dodecylsulfát sodný a vysoká teplota močoviná a ultrazvuk (sonikace) .
Jaký typ plazmidové DNA putuje v agarozové gelu (při elektroforéze) nejpomaleji poškozená s jednořetězcovým zlomem linearizovaná superhelikální všechny putují stejně rychle.
Pro snadné přesné spojení dvou fragmentů DNA je vhodné mít oba spojované konce přečnívající oba spojované konce ošetřené DNA – fosfátázámi oba spojované konce tupé jeden tupý a druhý přečnívající.
Exonukleázy štěpí polynukleotidy vnitřní molekuly z konců molekul v náhodných sekvencích v specifických sekvencích .
Pro převod jednotek rcf a rpm při centrifugaci je potřebné znát poloměr rotoru dostředivou sílu uhlovou rychlost.
Pro separaci různých proteinů lze využít diferenciální centrifugaci: směs heterogenních částic v homogenním roztoku, sedimentace částic s významně odlišnou velikostí – sedimentace různou rychlost centrifugaci v sacharóze centrifugaci v gradientu chloridu cesného .
.Metoda separace molekul v gelu s pH gradientem na základě jejich pI se nazývá sDS PAGE izoelektrická fokusace izotachoforéza.
Pro stanovení jednonukleotidového genového polymorfizmu je nejlepší FISH PCR – RFLP imunoblotting ELISA.
DNázá 1 štěpí primárně dsDNA ssDNA a dsDNA primárně ssDNA.
Co jsou to schizomery restrikční enzymy které štěpí odlišná cílové místa restrikční enzymy, které štěpí stejné cílové místa, ale mají odlišný typ štěpení a jsou z jiných bakterií restrikční enzymy, které štěpí stejné cílové místa.
Společná teplota Tm oligonukleotidů je 65 °C. Ta = ? stejná nezáleží vyšší o cca 3 - 5 °C nižší o cca 3 - 5 °C.
K čemu je možné využít testy viability K testování chemosenzitivity nádorových buněk Ke stanovení cytotoxického efektu léčiv Ke stanovení proapoptického efektu léčiv.
4 metody izolace DNA.
4 způsoby transfekce buněk.
Co barví coomassie blue.
Co je to hvězdičková aktivita (star activity).
Co je to thermocycler.
Co může způsobovat tzv. hvězdičkovou aktivitu restrikčních enzymů.
Co se používá pro stanovení účinnosti transfekce:.
Co znamená zkratka PCR?.
Hodnota g=(9,81) odpovídá.
Jak se nazývá metoda, kterou lze využít pro analýzu exprese genů, využívající fluorescenční detekci hybridizovaných úseků NK na mikropodložce:.
Jaké jsou základní výhody MTT testu (4).
Jaké sekvence nejčastěji štěpí restrikční enzymy?.
Jaký je základní postup při izolaci DNA na kolonce? (4).
Jaký typ RNA lze vyizolovat pomocí magnetických kuliček s navázanou d(T25) sekvencí tRNA mRNA rRNA dsRNA.
K barvení NK v gelu se standardně NEPOUŽÍVÁ.
K čemu slouží závěrečná extenze:.
Kromě CRISPR/Cas systému jsou dalšími systémy pro přímou editaci genomu buněk ZFN TALENs RNAi PCR.
Která z těchto metod nepatří mezi klasické možnosti naznačení sondy pro hybridizaci NK ? Značení pomocí přesunu jednořetězcového zlomu Koncové značení Značení pomocí náhodných hexanukleotidů Amplifikace pomocí PCR.
Které buňky jsou schopné redukovat MTT?.
Metoda využívající protilátky FACS znamená:.
Mezi typické sekvenační experimenty patří tzv.:.
Pomenujte typ přenášaných molekul Southernových Westernových Northernových .
Elektroforézu lze využít pro: Stanovení primární struktury proteinů Stanovení sekundární struktury proteinů Stanovení pH makromolekul Stanovení vznášivé hustoty makromolekul.
Proteiny se při izoelektrické fokusaci rozdělují podle svého: pH pI pKa pKb.
Pro hyperchromní efekt platí: Při postupném zahřívání dsDNA dochází ke zvyšování absorbance při vlnové délce 260 nm Při postupném ochlazování ssDNA dochází ke zvyšování absorbance při vlnové délce 260 nm Při postupném zahřívání dsDNA dochází ke snižování absorbance při vlnové délce 260 nm Při rychlém ochlazení ssDNA dochází ke snížení absorbance při vlnové délce 260 nm.
Metoda využívající tohoto typu uspořádání protilátek se nazývá: Westernův přenos ELISA Imunoprecipitace Hybridizace in situ.
Pro doplnění 3´ přesahů lze použít Klenowovu polymerázu S1 nukleázu DNA ligázu nelze doplnit.
S jakou pravděpodobností se bude v náhodné, nekonečně dlouhé sekvenci DNA vyskytovat štěpící místo pro Abst (CCTCGAGG) restriktázu? 1:8 1:32 1:4 096 1:65 536.
Pro reverzibilní denaturaci DNA NELZE použít Vysokou teplotu Vysoké pH Močovinu Ultrazvuk.
Pro přesnou lokalizaci proteinů v buňce můžeme použít Westernův přenos Imunodetekci in situ Proteinové čipy Konfokální mikroskopii.
Dna dependentní DNA polymeráza polymeruje nukleotidy k primeru vždy pouze ve směru 5´- 3´ 3´- 5´ v obou směrech v žádném směru.
Od kterého cyklu začínají ve správně fungující PCR reakční směsi vznikat první amplikony od 15. cyklu od 3. cyklu od 1. cyklu od 6. cyklu.
S jakou pravděpodobností se bude v náhodné, nekonečně dlouhé sekvenci DNA vyskytovat štěpící místo pro EcoRI (GAATTC) restriktázu? 1:6 1:24 1:4096 1:1296.
Jakou teplotu Tm má uvedený oligonukleotid: 5´-GCGGAATACGATTCGGCAATCG-3´ 21°C 37°C 12°C 68°C.
Jaká je molekulová hmotnost (Mw) sloučeniny, jestliže pro přípravu 5 mM roztoku jste použili 0,64 mg této látky a 218,1 μl rozpouštědla? (na 1 desetinné místo, bez jednotek).
Kolik molekul plasmidu pBR322 (4361 bp) je obsaženo ve 2 ng (Mw bp = 650) (v mol, jednotky nepiš, zaokrouhli na 2 desetinné místa).
Pomocí sekvenace Sangerovou enzymovou metodou byl získán následující výsledek. Jaká je sekvence původního oligonukleotidu AATCGCTA TAGCAGAT TTAGCGAT ATCGCTAA.
Pro stanovení podjednotkového složení proteinového komplexu byste použili metodu: PCR-RFLP Southernův přenos centrifugace v gradientu CsCl2 imunoprecipitace a SDS-PAGE.
Pro přenosnou "in situ" lokalizaci RNA v buňce byste použili: Nothernův přenos PCR DNA čipy FISH.
Pro přenosnou "in situ" lokalizaci proteinů v buňce byste použili: Westernův přenos imunodetekci in situ proteinové čipy konfokální mikroskopii.
Tzv. (Oxford) Nanopore sekvenování je založeno na: postupné ligaci fluorescenčně značených oktamerních oligonukleotidových sond detekci pyrofosfátu uvolněného při syntéze DNA prostřednictvím luciferázi inkorporaci fluorescenčně značených terminátorů polymerace a snímaní fluorescence průchodu sekvenované molekuly hemolysinovým pórem a detekci elektrického signálu.
Pomocí DNA čipů s cDNA sondami můžeme zjistit konformaci DNA lokalizaci genů na DNA počet chromozomů v buňce změnu genové exprese.
Monoklonální protilátky se vyznačují: relativně jednoduchou připravou a vysokou specifitou náročnou připravou a vysokou specifitou relativně jednoduchou připravou a nižší specifitou náročnou připravou a nižší specifitou.
Polyklonální protilátky se vyznačují: relativně jednoduchou připravou a vysokou specifitou náročnou připravou a vysokou specifitou relativně jednoduchou připravou a nižší specifitou náročnou připravou a nižší specifitou.
V molekulární biologii nejčastěji užívané restriktázy typu 2 štěpí: náhodné sekvence specifické sekvence DNA od volných konců ve velké vzdálenosti od vazebné sekvence.
Přidáním jednomocných kationtů a ethanolu do vodného roztoku NK při jejich precipitaci způsobí jejich rozpuštění ve vodné části roztoku jejich plynulou sedimentaci na povrchu roztoku a tím jejich vysrážení záměnu počtu bazí v řetězcích NK a tím jejich vysrážení snížení jejich rozpustnosti ve vodném prostředí a tím jejich vysrážení.
Principem enzymové metody sekvencování DNA (Sangerovo sekvencování) je: amplifikace úseků DNA určených k sekvencování pomocí PCR s využitím směsi ddNTP a dNTP štěpení dsDNA amplikonů pomoci nukleáz modifikace ssDNA řetězce pomocí chemických činidel s následným štěpením výsledku pomocí vysoké teploty v přítomnosti piperidinu modifikace dsDNA řetězce pomocí chemických činidel s následným štěpenim výsledku pomocí vysoké teploty v přítomnosti piperidinu.
Principem kvantitativního stanovení pomoci Real Time PCR je: možnost provádět amplifikaci při vysokém počtu PCR cyklů možnost měření nárůstu fluorescence neznámého vzorku v průběhu každého dalšího PCR cyklu během exponenciální fáze amplifikace bez jeho porovnání se standardem možnost měření nárůstu fluorescence neznámého vzorku v průběhu každého dalšího PCR cyklu během exponenciální fáze amplifikace a jeho porovnání s nárůstem fluorescence standardů o definované koncentraci možnost měnit koncentraci enzymů na vstupu při přípravě PCR reakce.
Principem extrakce nukleových kyselin a proteinů fenol-chloroformem je: separace proteinů a nukleových kyselin na rozhraní dvou vodných fází, z nich jedna je silně nasycena roztokem jednomocných kationtů separace proteinů a nukleových kyselin na rozhraní etanolu a vody při teplo roztoku -70°C separace proteinů na rozhraní lehčí vodné a těžší organické fáze, kde nukleová kyselina disociuje na rozhraní obou fází společně s proteiny separace proteinů na rozhraní lehčí vodné a těžší organické fáze, kde nukleová kyselina disociuje v lehčí vodné fázi a proteiny na rozhraní obou fází.
Pro tento typ reakce byste použili enzym: DNA polymerázu DNA kinázu DNA fosfatázu endonukleázu.
PCR amplikony (≈ 200 bp) byste při elektroforéze nejlépe rozdělili v řídkém agarózovém gelu nejlépe rozdělili v hustém agarózovém gelu nerozdělili denaturovali.
Pro vizualizaci DNA při elektroforéze NELZE použít: ethidium bromid stříbro SYBR Green Coomasie blue.
NK absorbují UV záření s maximem při: 260 nm 230 nm 320 nm 280 nm.
Je-li při vlnové délce absorbčního maxima DNA naměřena absorbance nižší než 0.1, bude výsledek měření koncentrace nukleové kyseliny pravděpodobně: zcela přesný podhodnocený nadhodnocený zcela nepřesný.
Která z funkci DNA dependentni DNA polymerázy je nezbytná pro správný průběh Real Time PCR za použiti TaqMan Sond (na principu proximálního zhášení) funkce 5´-3´ exonukleázové aktivity funkce 3´-5´ exonukleázové aktivity funkce zvyšujici procesivitu polymerázy funkce snižujíci procesivitu polymerázy.
Různé konformace plasmidové DNA (4 kbp) byste při elektroforéze: nejlépe rozdělili v řidkém (0.8%) agarózovém gelu nejlépe rozdělili v hustém (2%) agarózovém gelu nerozdělili denaturovali.
Při izokinetické centrifugaci je rychlost sedimentace částic v průběhu centrifugace: nízká vysoká konstantní nulová.
Při precipitaci nukleových kyselin etanolem v prostředí jednomocných kationtů ve vodném roztoku dochází k neutralizaci záporného náboje PO, cukerného zbytku molekul DNA a tim ke sniženi jejich rozpustnosti ve vodě fyzickému odděleni PO, od cukerného zbytku molekul DNA za současné disociace obou dceřiných řetězců nukleových kyseliny pouze k fyzickému oddělení obou dceřiných řetězců nukleových kyseliny nedochází k ničemu, nukleová kyselina je zcela intaktní k etanolu a jednomocným kationtům.
Při 2D elektroforéze proteinů se proteiny rozdělují dle svého: náboje a hmostnosti pI a hmotnosti náboje a pH hustoty a terciární struktury.
Pro tento typ reakce byste použili enzym: DNA polymerázu DNA kinázu DNA fosfatázu endonukleázu.
RNA-dependentní DNA polymeráza (reverzní transkriptáza): vytváří DNA řetězec podle RNA templátu vytváří RNA řetězec podle DNA templátu vytváří hybridní heteroduplexy DNA:RNA spojuje DNA a RNA řetězce.
Závislost absorbance na koncentraci při A260 je lineární: od hodnoty 1,0 v rozsahu měření od 0,1 do 0,3 v rozsahu měření od 0 do 1,0 v rozsahu měření od -1,0 do +1,0.
Je-li při vlnové délce absorbčního maxima DNA naměřena absorbance vyšší než 0,3, bude výsledek měření koncentrace nukleové kyseliny pravděpodobně: zcela přesný podhodnocený nadhodnocený zcela nepřesný.
K promývání precipitované DNA (tak aby zůstala stále vysrážená) se používá 20 % ethanol 50 % ethanol 70 % ethanol 100 % ethanol.
Ethidium bromid se váže irevirzibilně do malého žlábku DNA váže revirzibilně do malého žlábku DNA interkaluje mezi báze DNA neváže se na DNA.
Jako separační media pro elektroforézy se používá: glykogen kyselina hyaluronová polyakrylamid antigen typu II.
Princip proximálního zhášení (použitý např. při konstrukci TagMan sond) je založen na: přesné poloze fluorescenční sondy v průběhu oligonukleotidu umožňující efektivní záření sondy krátké vzdálenosti fluoroforu a zhášeče umožňující efektivní zhášení (Quenching) dlouhé vzdálenosti fluoroforu a zhášeče umožňující efektivní záření navržené sondy až do doby detekce dlouhé vzdálenosti dvou flouroforů umožňující efektivní záření navržené sondy v době detekce.

Report abuse

▲